风湿性心脏病肠道菌群宏基因组学分析
发布时间:2021-11-25 11:56
[背景与目的]风湿性心脏病是一类严重危及人类健康和生命的自身免疫性心脏疾病,云南省处于我国的西南高海拔地区,卫生条件落后,其发病率仍较高,且交通不方便,给予就诊造成了巨大的困难。而肠道菌群的变化已经被证实与人体许多自身免疫性疾病有关,基于此,我们通过采用宏基因组学高通量测序技术对风湿性心脏病患者的肠道菌群进行分析,寻找其中起关键作用的细菌成分,找到肠道菌群参与风湿性心脏病病理变化过程的证据,鉴定出抗生素的耐药基因,以便更全面地了解风湿性心脏病患病期间肠道微生物的变化,为临床选药和治疗提供帮助。[方法]我们收集了 10例风湿性心脏病患者和5例健康对照组的粪便样本作为研究对象,对15例粪便样本进行高通量测序,对测序结果进行高级生物信息学分析,包括肠道菌群结构和丰度的分析、KEGG数据库注释分析、COG数据库注释分析、CAZy数据库和ARDB注释。[结果]1.风湿性心脏病患者和健康对照人群的肠道菌群在门水平上主要集中于拟杆菌门(Bacteroidetes)、硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria);2.风湿性心脏病患者肠道中拟杆菌科(Bacteroidace...
【文章来源】:昆明医科大学云南省
【文章页数】:75 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-3琼脂糖凝胶电泳结果??1.?10质控结果??
图1-7门水平物种平均丰度柱状图??在种水平上注释到71种细菌,取平均丰度较高的前9种细菌进行绘图比较,??其他合并为others,如图1-8。与对照组相比,??实验组中?Bacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes?等细菌的丰度下降,??Bamesiella、Odoribacter、Parabacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes、??Clostridium、Eubacterium、Roseburia、Faecalibacterium、Ruminococcus、Dialister、??Megamonas、Escherichia等细菌的丰度上升。??25??
——.??图1-7门水平物种平均丰度柱状图??在种水平上注释到71种细菌,取平均丰度较高的前9种细菌进行绘图比较,??其他合并为others,如图1-8。与对照组相比,??实验组中?Bacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes?等细菌的丰度下降,??Bamesiella、Odoribacter、Parabacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes、??Clostridium、Eubacterium、Roseburia、Faecalibacterium、Ruminococcus、Dialister、??Megamonas、Escherichia等细菌的丰度上升。??25??
本文编号:3518090
【文章来源】:昆明医科大学云南省
【文章页数】:75 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-3琼脂糖凝胶电泳结果??1.?10质控结果??
图1-7门水平物种平均丰度柱状图??在种水平上注释到71种细菌,取平均丰度较高的前9种细菌进行绘图比较,??其他合并为others,如图1-8。与对照组相比,??实验组中?Bacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes?等细菌的丰度下降,??Bamesiella、Odoribacter、Parabacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes、??Clostridium、Eubacterium、Roseburia、Faecalibacterium、Ruminococcus、Dialister、??Megamonas、Escherichia等细菌的丰度上升。??25??
——.??图1-7门水平物种平均丰度柱状图??在种水平上注释到71种细菌,取平均丰度较高的前9种细菌进行绘图比较,??其他合并为others,如图1-8。与对照组相比,??实验组中?Bacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes?等细菌的丰度下降,??Bamesiella、Odoribacter、Parabacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes、??Clostridium、Eubacterium、Roseburia、Faecalibacterium、Ruminococcus、Dialister、??Megamonas、Escherichia等细菌的丰度上升。??25??
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