1个高猝死风险肥厚型心肌病家系的临床和遗传学研究
发布时间：2022-01-12 08:02
背景与目的:肥厚型心肌病（Hypertrophic cardiomyopathy,HCM）是一种由编码肌节蛋白基因突变引起的常染色体显性遗传性疾病,其临床特征是左心室不对称性肥厚和舒张功能障碍。HCM临床表现广泛,从无症状到轻微临床症状、心力衰竭,甚至心源性猝死（Sudden cardiac death,SCD）,大部分患者通常具有较晚的发病年龄、温和的临床病程和较低的SCD发生率（每年0.5-1%）。然而,我们在1个HCM家族中发现其家系成员具有高度外显、严重心肌肥厚及猝死高发的临床表型。了解该致病突变与临床表型之间的联系具有重要的临床意义。资料与方法:本研究入选2018年12月就诊于陆军军医大学附属新桥医院的HCM家系1例,共9人（3人死亡,6人在世）,所有研究对象均签署知情同意书,了解本研究的目的和风险。对家系成员进行临床调查,调查数据包括临床症状和体征、常规心电图、动态心电图、超声心动图和3.0T心脏磁共振（Cardiac magnetic resonance,CMR）,并定期随访1年。同时,采集在世家系成员静脉血,该家族先证者及其父母和侄女接受全外显子组测序（Whole-ex...
【文章来源】：中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
家系遗传图谱
陆军军医大学硕士学位论文18（GERP,phyloP20way,phastCons20way），剪接预测有害（MaxEntScan,splice_dbscSNV）预测出变异对基因(基因产物)有影响符合可能致病证据PP3。这些发现提供了强有力的遗传证据，证明鉴定的MYBPC3基因c.2737+1(IVS26)G>T变体是该家族中的致病变体，并考虑其为该家族致病的因果突变。不幸的是，通过一代测序验证，先证者两个年幼的儿子（III-8，III-9）也被确认携带该致病杂合突变，测序峰图见图3。表4全外显子组测序检测的变体基因染色体位置核酸改变(外显子号)氨基酸改变先证者(患者)父亲(患者)母亲(正常)侄女(患者)相关疾病(OMIM号),遗传方式MYBPC3chr11:47,357,427c.2737+1(IVS26)G>T—杂合杂合野生型杂合CMH4(OMIM:115197),ADACTN2chr1:236,849,999c.26(exon1)A>Gp.Gln9Arg杂合杂合野生型野生型CMD1AA(OMIM:612158),ADPSEN2chr1:227,076,603c.640(exon8)G>Tp.Val214Leu杂合野生型杂合杂合CMD1V(OMIM:613697),AD注：CMH4：家族性肥厚型心肌病4型；CMD1AA：扩张型心肌病1AA型;CMD1V：扩张型心肌病1V型;AD：常染色体显性遗传；图3MYBPC3基因c.2737+1(IVS26)G>T突变Sanger测序图注：NCBI参考序列（A）；突变序列（B）；箭头所指位置为突变位点
陆军军医大学硕士学位论文193.4cDNA测序（逆转录测序）验证数据来自先证者静脉血的扩增子的核苷酸测序证实，在突变等位基因的剪接过程中外显子26号被跳过（图4）。外显子26含有来自c.2603-c.2737的135个碱基，因为缺失的碱基为3的整数倍，其不会引起移码和引入新的序列。图4剪接位点的cDNA测序（反转录测序）验证测序图注：NCBI参考序列（A）；突变的mRNA序列（B）；3.5突变蛋白的结构损害预测结果我们比较了NCBI数据库，发现c.2602/c.2603/c.2604编码甘氨酸（p.868），c.2737/c.2738/c.2739编码半胱氨酸（p.912）。c.2603-c.2737跳过后，c.2602/c.2738/c.2739形成编码甘氨酸的密码子GGC，因此缺失的氨基酸数为45个（p.869-p.912）（图5A）。使用I-TASSER服务器（ZhangY2008）通过同源建模建立cMyBP-C（残基867至964）中C7结构域的3D结构整体。C-得分=0.90（表示建模置信度的值，通常在-5到2的范围内，值越高，置信度越高）的模型显示出与人类MYBPC1蛋白（PDB2YUX）类似的拓扑结构和典型的β折叠桶状结构（图5B），在本研究中发现的突变将导致残基869-912的肽链（图5中红色框和红色条带所示）缺失，其包含3条β链（β1至β3）。显然，缺少这些β链肯定会阻止其在结构的核心处形成β折叠桶状结构，并导致整体结构的崩塌。从结构的角度来看，C7结构域正确折叠的严重破坏会在cMyBP-C的整体结构中产生级联效应，包括随后结构域（C8–Cx）的方向和位置变化，这将进一步干扰cMyBP-C插入肌节A带并导致明显功能丧失。
本文编号：3584422
【文章来源】：中国人民解放军陆军军医大学重庆市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
家系遗传图谱
陆军军医大学硕士学位论文18（GERP,phyloP20way,phastCons20way），剪接预测有害（MaxEntScan,splice_dbscSNV）预测出变异对基因(基因产物)有影响符合可能致病证据PP3。这些发现提供了强有力的遗传证据，证明鉴定的MYBPC3基因c.2737+1(IVS26)G>T变体是该家族中的致病变体，并考虑其为该家族致病的因果突变。不幸的是，通过一代测序验证，先证者两个年幼的儿子（III-8，III-9）也被确认携带该致病杂合突变，测序峰图见图3。表4全外显子组测序检测的变体基因染色体位置核酸改变(外显子号)氨基酸改变先证者(患者)父亲(患者)母亲(正常)侄女(患者)相关疾病(OMIM号),遗传方式MYBPC3chr11:47,357,427c.2737+1(IVS26)G>T—杂合杂合野生型杂合CMH4(OMIM:115197),ADACTN2chr1:236,849,999c.26(exon1)A>Gp.Gln9Arg杂合杂合野生型野生型CMD1AA(OMIM:612158),ADPSEN2chr1:227,076,603c.640(exon8)G>Tp.Val214Leu杂合野生型杂合杂合CMD1V(OMIM:613697),AD注：CMH4：家族性肥厚型心肌病4型；CMD1AA：扩张型心肌病1AA型;CMD1V：扩张型心肌病1V型;AD：常染色体显性遗传；图3MYBPC3基因c.2737+1(IVS26)G>T突变Sanger测序图注：NCBI参考序列（A）；突变序列（B）；箭头所指位置为突变位点
陆军军医大学硕士学位论文193.4cDNA测序（逆转录测序）验证数据来自先证者静脉血的扩增子的核苷酸测序证实，在突变等位基因的剪接过程中外显子26号被跳过（图4）。外显子26含有来自c.2603-c.2737的135个碱基，因为缺失的碱基为3的整数倍，其不会引起移码和引入新的序列。图4剪接位点的cDNA测序（反转录测序）验证测序图注：NCBI参考序列（A）；突变的mRNA序列（B）；3.5突变蛋白的结构损害预测结果我们比较了NCBI数据库，发现c.2602/c.2603/c.2604编码甘氨酸（p.868），c.2737/c.2738/c.2739编码半胱氨酸（p.912）。c.2603-c.2737跳过后，c.2602/c.2738/c.2739形成编码甘氨酸的密码子GGC，因此缺失的氨基酸数为45个（p.869-p.912）（图5A）。使用I-TASSER服务器（ZhangY2008）通过同源建模建立cMyBP-C（残基867至964）中C7结构域的3D结构整体。C-得分=0.90（表示建模置信度的值，通常在-5到2的范围内，值越高，置信度越高）的模型显示出与人类MYBPC1蛋白（PDB2YUX）类似的拓扑结构和典型的β折叠桶状结构（图5B），在本研究中发现的突变将导致残基869-912的肽链（图5中红色框和红色条带所示）缺失，其包含3条β链（β1至β3）。显然，缺少这些β链肯定会阻止其在结构的核心处形成β折叠桶状结构，并导致整体结构的崩塌。从结构的角度来看，C7结构域正确折叠的严重破坏会在cMyBP-C的整体结构中产生级联效应，包括随后结构域（C8–Cx）的方向和位置变化，这将进一步干扰cMyBP-C插入肌节A带并导致明显功能丧失。
本文编号：3584422
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