永久性心房颤动的基因组DNA甲基化分析

发布时间：2022-01-13 23:45

　　背景与目的心房颤动（atrial fibrillation,AF）是一种最常见的持续性心律失常,目前房颤是导致各种心血管疾病发病及死亡的主要原因之一。已有研究发现,房颤是一种遗传异质性疾病,与多种遗传因素密切相关,已知多种染色体异常及基因突变可以导致房颤发作。尽管通过对特异性基因以及全基因组关联研究发现了一些房颤的相关基因变异并且阐明房颤的遗传性,但是大部分房颤仍然无法单纯用基因突变来解释。表观遗传调控是控制基因表达方面的重要机制,它在一种潜在的遗传途径中发挥作用。DNA甲基化被认为是影响表观遗传学的重要驱动因素之一,目前已有众多研究指出DNA甲基化在许多细胞生物过程中扮演着重要且不断发展的角色,这些进程包括细胞发展、细胞分化和DNA-蛋白质的相互作用等等。越来越多的证据表明,外部刺激包括环境和生活方式可能通过表达异常的DNA甲基化模式影响基因表达状态。这种“外部刺激-DNA甲基化-基因表达"模式很大程度上有助于解释很多疾病的发生机制。本研究旨在使用高密度全基因组CpG甲基化芯片筛选了永久性房颤病人左心房组织的DNA甲基化并与健康正常窦性心律（SR）患者的左心房组织进行比较。基于不同的... 

【文章来源】：首都医科大学北京市

【文章页数】：86 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

HybridizationControls杂交质控图

首都医科大学博士学位论文中横轴是 log2(信号值)，纵轴是样本名称 。红色荧光表示未甲基化号值)，绿色荧光表示甲基化位点的 log2(信号值)。论：红色荧光和绿色荧光的差值一般是 2 个数量级。阳性参照中绿色og2(信号值) >12，标记实验成功。脱实验的质量控制质控检测未标记的探针产生的信号值（背景值）。此探针存在于 RA中，探针在单碱基延伸反应中不会延伸标记，可视为实验数据中的阴n（见图 2）。

首都医科大学博士学位论文图中横轴是 log2(信号值)，纵轴是样本名称 。红色荧光表示未甲基化位点的标记的 log2(背景值)，绿色荧光表示甲基化位点的未标记 log2(背景值)结论：阴性参照探针中绿色荧光 log2(背景值)和上图的阳性参照的 log2（信值）的差值在 2 个数量级以上，洗脱实验成功。3.2 预处理后的质量控制3.2.1 样本的质控样本的质量控制通过检测样本整体的甲基化化程度来进行，甲基化程度如下（图 3）

【参考文献】：
期刊论文
[1]PCDH10基因在前列腺癌组织中的甲基化测定及临床意义[J]. 刘绍祖,佟明,张骞,张莲,徐奔,李自智,黄伟超,金艳阳.  解放军医学院学报. 2014(04)
[2]风湿性心脏病患者外周血调节性T细胞与IL-10、TGF-β1的关系及意义[J]. 莫莉,许礼发.  中华临床医师杂志(电子版). 2012(10)
[3]Implications of discoveries from genome-wide association studies in current cardiovascular practice[J]. Panniyammakal Jeemon,Kerry Pettigrew,Christopher Sainsbury,Dorairaj Prabhakaran,Sandosh Padmanabhan.  World Journal of Cardiology. 2011(07)
[4]阿尔茨海默病患者体内端粒甲基化分析[J]. 管静芝,管维平,朱文华.  军医进修学院学报. 2011(02)
[5]先天性心脏病圆锥动脉干畸形NKX2-5基因CpG岛甲基化状态分析[J]. 盛伟,王慧君,马晓静,李文灿,陈龙,张进,黄国英,马端.  中国产前诊断杂志(电子版). 2010(03)
[6]中国心房颤动现状的流行病学研究[J]. 周自强,胡大一,陈捷,张仁汉,李奎宝,赵秀丽.  中华内科杂志. 2004(07)
[7]北京地区非瓣膜病心房颤动患者缺血性脑卒中发生率及影响因素的随访研究[J]. 马长生,周玉杰,马煜,郑知刚,颜红兵,王勇,李霄,柯元南,汤旦林.  中华心血管病杂志. 2002(03)



本文编号：3587368