冠心病lncRNA表达谱分析、生物标志物鉴定与初步功能研究

发布时间：2024-02-19 17:22

　　背景与目的:长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)已被证实参与冠心病(coronary artery disease,CAD)的病理生理过程,但仍缺乏系统的研究。本研究通过冠心病病例对照lncRNA表达谱研究及大样本的重复验证,探索lncRNA在冠心病中的表达模式,鉴定诊断冠心病的lncRNA生物标志物;通过初步功能研究,明确了差异表达lncRNA对邻近基因和炎症相关基因的表达调控作用。为动脉粥样硬化及冠心病的预防、诊断和治疗提供新线索。方法:1.应用高通量的lncRNA/mRNA芯片,在93例冠心病患者和48例健康对照对象的外周血单个核细胞中(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs),进行全基因组水平的lncRNA/mRNA表达谱分析。应用GO(gene ontology)分析及通路分析,探索差异表达的mRNAs与差异表达的lncRNAs之间的潜在的生物功能关联;应用通路网络分析探究显著通路的相互作用关系。2.基于差异倍数、P值、预测靶基因以及与CAD或者血脂异常易感位点位置关系等筛选标准,挑选了 7个l...

【文章页数】：67 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１技术路线流程图??９??

北京协和医学院中国医学科学院?硕士研究生学位论文??因此，本研究主要内容包括如下几个部分：??１．进行冠心病全基因组ＩｎｃＲＮＡ／ｍＲＮＡ表达谱分析；应用ＧＯ分析及通路分析探??索差异表达的ｍＲＮＡ与差异表达的ＩｎｃＲＮＡ之间的潜在的生物功能关联；应用??ｑＲＴ－ＰＣＲ在冠心病病....

图２生物表达谱差异表达ＩｎｃＲＮＡ／ｍＲＮＡ聚类分析与火山图??

ＩｎｃＲＮＡｓ和８９０个差异表达的ｍＲＮＡｓ；其中８３３个ＩｎｃＲＮＡｓ和４２７个ｍＲＮＡｓ显??著上调，３７７个ＩｎｃＲＮＡｓ和４６３个ｍＲＮＡｓ显著下调。差异表达基因聚类分析和火??山图见图２。??２５??

图３表达谱芯片数据的生物信息学分析结果??Ａ：前３０个的生物过程、分子成分以及分子功能的富集Ｇ?

差异表达ｍＲＮＡｓ的信号通路进行相互作用分析。最显著富集的前３０个ＧＯ条目包??括细胞因子活动（Ｇ０：０００５１２５）、趋化因子活动（Ｇ０：０００５１２５）和趋化因子受体结??合（Ｇ〇：００４２３７９）等（图３Ａ）。差异ｍＲＮＡｓ结合差异表达ＩｎｃＲＮＡｓ的通路分析显??示排名前....

图６?４个ＩｎｃＲＮＡｓ在ＣＡＤ中ＲＯＣ曲线下面积结果，（Ａ）：?ＩｎｃＲＮＡ??ＥＮＳＴ０００００６０２５５８．１?和（Ｂ）：?ＡＳ０３９７３?的?ＡＵＣ?结果；??

?Ｊ??０．０?０．２?０．４?０．６?０．８?１．０?ｒ??１?－Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ??ｆ?ｏｂｊｅｃｔ??？?ＫＮＳＴ０ｔｆＨＪｆｔＵ？８８．１＋ｕｃ０Ｈｈｆｄ．ｌ?０Ａ５１（０ＪＪ１８５－０Ｊ？３６？??ＡＲｃ＋ＢＭＩ＋ＧＩｕｃｏｓｅ＋Ｈｄｌ?０．７７０９（０．７３４６....

本文编号：3903057