基于羟甲基化修饰探讨早发冠心病血瘀证与ARF6、PSD2易感基因的相关性研究

发布时间：2025-01-20 13:04

　　目的:通过研究5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)在全基因组中的分布情况,探讨DNA羟甲基化(DNA hydroxymethylation)对早发冠心病(premature coronary heart disease,PCHD)血瘀证相关易感基因的影响,以期为早发冠心病血瘀证发病机制的表观遗传学研究提供基础。方法:1.采用DNA羟甲基化免疫共沉淀芯片(hMeDIP-Chip)Arraystar Human 4x180K Refseq Promoter Microarray检测5hmC在早发冠心病血瘀证组(简称PCHD血瘀证组)、早发冠心病非血瘀证组(简称PCHD非血瘀证组)、非早发冠心病血瘀证组(简称非PCHD血瘀证组)及正常组中全基因组DNA启动子区CpG岛的分布情况,通过组间比较得出早发冠心病血瘀证全基因组DNA差异羟甲基化分布谱;2.对筛选出的早发冠心病血瘀证相关差异羟甲基化基因ARF6(ADP-ribosylation factor 6,ADP-核糖基化因子6)、PSD2(pleckstrin and Sec7 domain contai...

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图1-1全基因组DNA提取后琼脂糖凝胶电泳

图1-1全基因组DNA提取后琼脂糖凝胶电泳3.2.2ShearedDNA质控全基因组DNA片段化后，NanoDrop定量，琼脂糖凝胶电泳分析来检查片段化DNA大小，如图1-2a、1-2b可知大多数DNA片段大小范围为：200~1000bp。

图1-2aShearedDNA琼脂糖凝胶电泳

图1-2aShearedDNA琼脂糖凝胶电泳

图1-2bShearedDNA琼脂糖凝胶电泳

图1-2bShearedDNA琼脂糖凝胶电泳3.2.3羟甲基化DNA免疫共沉淀（hMeDIP）质量评估hMeDIP倍数富集qPCR评估：采用△△Ct法分析数据。qPCR引物：F:5'AGAAGCTCGACCGTCTTGGC3'，R:5'AAACCGAACC....

图1-4a正常组vsPCHD血瘀证组差异羟甲基化基因GO功能分布图（前十位）

14图1-4a正常组vsPCHD血瘀证组差异羟甲基化基因GO功能分布图（前十位）

本文编号：4029296