一个先天性白内障家系致病基因的鉴定

发布时间：2017-10-14 00:12

  本文关键词：一个先天性白内障家系致病基因的鉴定

  更多相关文章： 先天性白内障 基因组扫描 连锁分析 突变检测 CRYBB2

【摘要】：先天性白内障又称婴幼儿白内障,是儿童致盲的主要原因之一,流行病学调查显示其患病率为1-6/10000。在先天性白内障患者中,大约8.3%-25%是遗传性的。其遗传方式有常染色体显性遗传(autosomal dominant, AD)、常染色体隐性遗传(autosomal recessive, AR)和X连锁隐性遗传(X-linked recessive, XR),其中以常染色体显性遗传最为常见。该病具有高度遗传异质性,致病基因分别定位在1p36、3q21、13q11-q12、22q11等不同的染色体位上,已克隆了至少39个基因,其中晶状体蛋白突变是其发生的主要原因,约占遗传性白内障的50%。 目的：鉴定一个先天性白内障大家系的致病基因。 方法：本研究收集了一个先天性白内障家系36名成员(其中患者20名)的血样,选取家系中24名成员(其中患者18名)进行全基因组扫描和多点连锁分析,根据连锁分析的结果构建单体型图确定致病基因候选区间；对候选区间进行生物信息学分析,确定候选基因；最后对候选基因进行突变筛查,以期找到致病基因。 结果：通过全基因组扫描和连锁分析,我们在22号染色体rs140390、rs743409及rs2283792处得到最大LOD值3.263；单体型分析将疾病基因定位于22q11.21-12.1的2个SNP标记rs2283792和rs761670之间4.3Mb区域。依据功能候选策略,分析UCSC数据库rs2283792至rs761670之间及其附近的基因,晶状体蛋白基因CRYBB2、CRYBB3被选为首批候选基因。通过对先证者CRYBB2、 CRYBB3基因编码区及外显子与内含子交界区域进行测序分析,发现CRYBB2第453位由G改变成了C (c.453GC)。随后对家系中其他成员该位点进行了检测,发现该变异在家系内与疾病共分离。查询NCBI SNP数据库显示数据库中未收录。对300个正常个体该位点进行检测亦未发现该突变。 结论：CRYBB2基因c.453GC是此先天性白内障家系的致病突变。
【关键词】：先天性白内障 基因组扫描 连锁分析 突变检测 CRYBB2
【学位授予单位】：中南大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R776.1;Q78
【目录】：

• 摘要4-6
• Abstract6-8
• 目录8-9
• 英文缩略词表9-10
• 主要仪器、试剂与耗材10-13
• 前言13-17
• 1 研究对象17-19
• 2 研究方法19-27
• 2.1 样本收集19
• 2.2 全基因组扫描19-22
• 2.3 连锁分析22
• 2.4 单体型图的构建22
• 2.5 生物信息学分析及候选基因确定22
• 2.6 候选基因突变筛查22-26
• 2.7 保守性分析26-27
• 3 结果27-33
• 3.1 全基因组扫描及连锁分析结果27-29
• 3.2 单体型图29-30
• 3.3 生物信息学分析及候选基因确定30
• 3.4 候选基因突变检测结果30-32
• 3.5 保守性分析32-33
• 4 讨论33-38
• 5 结论38-39
• 参考文献39-44
• 综述44-57
• 参考文献52-57
• 致谢57-58
• 个人简历58

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 薛金龙;石淑先;孙芳玲;艾厚喜;张丽;王文;;Wnt信号通路及相关神经因子对神经再生的影响[J];中国比较医学杂志;2013年09期

，

本文编号：1027877