伴发闭角型青光眼视网膜色素变性遗传家系RHO基因突变的鉴定研究
发布时间:2020-07-29 13:44
【摘要】:目的:1.研究一个伴发闭角型青光眼(angle-closure glaucoma,ACG)的视网膜色素变性(retinitis pigmentosa,RP)家系的遗传特性和临床表型,提取各家系成员的DNA,建立临床电子档案和DNA标本库。2.筛查致病基因,测序分析家系成员基因组DNA,定位致病突变。方法:1.RP家系临床资料的采集:RP家系内的6例成员(5例患者,1例正常人)签署知情同意书,按照RP的诊断标准,询问家系成员病史,绘制家系图谱,门诊检查视力、眼压、视野、OCT、裂隙灯、房角镜、间接检眼镜、眼底照相、ERG等。2.抽取家系成员的外周静脉血并提取基因组DNA,结合目标区域捕获高通量测序先证者DNA,比对基因组数据库DNA序列,筛选可疑致病基因位点。3.采用Sanger测序验证先证者和家系内其他成员疑似突变位点。结果:1.依据遗传特征明确该RP家系是一个常染色体显性遗传RP家系,所有受试者基因组DNA纯度均鉴定达标。2.此RP家系的5例患者均有夜盲和视野缺损,存在不同程度视力下降,视网膜呈青灰色骨细胞样改变,2例患者伴发闭角型青光眼,2例患者存在房角狭窄。3.RP家系先证者的可疑致病原因初步定位于RHO基因c.541GAp.Glu181Lys突变,经Sanger测序验证证实突变存在,家系内、外成员检测确定基因型表型共分离。结论:1.本研究家系是一个伴发闭角型青光眼的常染色体显性遗传RP家系,临床表型符合RP特征。2.初步认为本研究的患者发病与RHO基因c.541GAp.Glu181Lys突变有关。3.视网膜色素变性伴发青光眼患者较易漏诊,通过分析临床资料及目标区域捕获高通量测序技术可明确诊断及致病基因突变。
【学位授予单位】:中国人民解放军医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R775;R774.13
【图文】:
RP家系内的先证者HI:邋9的姐姐IE:邋6和子女IV:邋9、IV:邋10经检查均为患者,逡逑该家系RP性状连续4代传递,男女均有发病,比例为1邋:邋2,符合常染色体完全显性逡逑遗传特征。本研究中RP家系图谱如图1。逡逑14逡逑
Fig.邋2邋Clinical邋characteristics邋of邋RP邋patients邋a:patient邋III邋6,邋OD,showing邋an邋iris邋hole邋at邋11邋o'clock逡逑direction;b:patient邋III邋9,邋OD.showing邋shallow邋anterior邋chamber;c:patient邋III邋9,邋OD,showing邋chamber逡逑angle邋closure;d:patient邋III邋6,邋OD,showing邋attenuation邋of邋vessels,bone邋spicule邋deposits邋in邋the邋retina;逡逑e:patient邋III邋9,邋OS,邋showing邋bone邋spicule邋deposits邋in邋the邋retina,aneurysmal邋change邋of邋inferior逡逑vessels;f:patient邋III邋9,邋OD.showing邋superior邋visual邋field邋defect;g:patient邋III邋6?邋OD,showing邋a邋tubular逡逑visual邋field;h:patient邋III邋9,邋OD/OS,showing邋retinal邋nerve邋fiber邋layer邋thickness邋decreased:patient邋III邋9,逡逑OD,showing邋retinal邋thickness邋increase邋in邋the邋fovea;j:patient邋III邋6,邋OD,showing邋a邋thin邋retina邋beside逡逑macula邋lutea逡逑】7逡逑
(4)序列分析逡逑参考美国医学遗传学和基因组学学院(American邋College邋of邋Medical邋Genetics逡逑and邋Genomics,ACMG)相关指南解读数据,评估下机的原始数据(Raw邋reads)的测逡逑序质量,首先去除被接头污染以及低质量reads,随后用Burrows邋Wheeler邋Aligner逡逑软件[4]比对HGl9序列,评价序列捕获效果,用SOAPsnp软件f5]和Samtools软逡逑件[6]分别进行邋SNV(single邋nucletide邋variant)和邋Indel(insertion邋and邋deletion)查询,生逡逑成目标区域碱基多态性结果,比对数据库NCBI邋dbSNP、HapMap、1000邋human逡逑genome邋dataset邋和邋database邋of邋100邋Chinese邋healthy邋adults,找出可疑突变,进行注释、逡逑26逡逑
本文编号:2774041
【学位授予单位】:中国人民解放军医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R775;R774.13
【图文】:
RP家系内的先证者HI:邋9的姐姐IE:邋6和子女IV:邋9、IV:邋10经检查均为患者,逡逑该家系RP性状连续4代传递,男女均有发病,比例为1邋:邋2,符合常染色体完全显性逡逑遗传特征。本研究中RP家系图谱如图1。逡逑14逡逑
Fig.邋2邋Clinical邋characteristics邋of邋RP邋patients邋a:patient邋III邋6,邋OD,showing邋an邋iris邋hole邋at邋11邋o'clock逡逑direction;b:patient邋III邋9,邋OD.showing邋shallow邋anterior邋chamber;c:patient邋III邋9,邋OD,showing邋chamber逡逑angle邋closure;d:patient邋III邋6,邋OD,showing邋attenuation邋of邋vessels,bone邋spicule邋deposits邋in邋the邋retina;逡逑e:patient邋III邋9,邋OS,邋showing邋bone邋spicule邋deposits邋in邋the邋retina,aneurysmal邋change邋of邋inferior逡逑vessels;f:patient邋III邋9,邋OD.showing邋superior邋visual邋field邋defect;g:patient邋III邋6?邋OD,showing邋a邋tubular逡逑visual邋field;h:patient邋III邋9,邋OD/OS,showing邋retinal邋nerve邋fiber邋layer邋thickness邋decreased:patient邋III邋9,逡逑OD,showing邋retinal邋thickness邋increase邋in邋the邋fovea;j:patient邋III邋6,邋OD,showing邋a邋thin邋retina邋beside逡逑macula邋lutea逡逑】7逡逑
(4)序列分析逡逑参考美国医学遗传学和基因组学学院(American邋College邋of邋Medical邋Genetics逡逑and邋Genomics,ACMG)相关指南解读数据,评估下机的原始数据(Raw邋reads)的测逡逑序质量,首先去除被接头污染以及低质量reads,随后用Burrows邋Wheeler邋Aligner逡逑软件[4]比对HGl9序列,评价序列捕获效果,用SOAPsnp软件f5]和Samtools软逡逑件[6]分别进行邋SNV(single邋nucletide邋variant)和邋Indel(insertion邋and邋deletion)查询,生逡逑成目标区域碱基多态性结果,比对数据库NCBI邋dbSNP、HapMap、1000邋human逡逑genome邋dataset邋和邋database邋of邋100邋Chinese邋healthy邋adults,找出可疑突变,进行注释、逡逑26逡逑
【参考文献】
相关期刊论文 前6条
1 王芳;吴志鸿;;原发性视网膜色素变性伴发青光眼的研究进展[J];中华灾害救援医学;2015年08期
2 徐张幸;彭晓燕;;原发性视网膜色素变性继发黄斑囊样水肿的治疗进展[J];中华眼科医学杂志(电子版);2014年01期
3 闫光辉;盛迅伦;;中国视网膜色素变性相关基因研究现状[J];中华眼底病杂志;2011年05期
4 覃泳杰;郭海科;;常染色体遗传型视网膜色素变性相关基因的研究进展[J];眼科研究;2009年12期
5 夏小平;赵丽娜;朱鹏宇;田东华;宋国祥;;视网膜色素变性合并近视家系的临床及遗传学研究[J];眼科新进展;2009年07期
6 彭清华;视网膜色素变性并发青光眼21例临床分析[J];中国实用眼科杂志;1995年02期
本文编号:2774041
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