基于RNA-seq技术的散发性梅尼埃病患者外周血单核细胞转录组学研究

发布时间：2020-11-07 08:56

　　 研究背景:梅尼埃病是一种复杂性的内耳疾病,以发作性眩晕,波动性感音神经性聋、耳鸣、耳闷胀感为主要临床特征。随着基因技术的不断发展,梅尼埃病的基因学研究逐渐成为热点,但始终没能够完全揭示其发病机制。RNA-seq测序技术在多种疾病的分子病因学研究中取得了一系列的成果,然而,迄今为止,RNA-seq技术还未应用于梅尼埃病的研究中。实验目的:本研究旨在应用RNA-seq测序技术,分析梅尼埃病患者和正常人外周血转录组谱差异基因的表达变化,寻找潜在的差异基因以揭示疾病病因学相关机制。实验方法:首先,利用RNA-seq测序技术,分析人外周血单核细胞转录组谱,根据FPKM0.1,筛选出梅尼埃病患者组和正常组的差异表达基因;然后,利用GO(Geneontology)功能分析方法分析差异表达基因的功能特性,通过构建蛋白质-蛋白质相互作用的整体网络图,寻找不同基因表达产物之间的相互作用;为了验证梅尼埃病患者组和正常组差异基因表达水平,我们应用实时定量荧光PCR(qRT-PCR)和酶联免疫吸附试验(ELISA)方法,并分析相关差异表达基因与梅尼埃病免疫因素的相互关系。实验结果:对3例梅尼埃病患者和3例正常人进行测序的结果显示:共有366个差异表达基因(包括154个上调基因和212个下调基因)。其中,差异基因GSTM1,TMEM176A,TMEM176B,NSFP1在梅尼埃病患者中表达升高,SLC4A1和SLC4A10表达降低。GO功能分析显示:免疫因素可能在梅尼埃病发病过程中起重要作用。qRT-PCR和ELISA结果显示:GSTM1基因在患者组和正常组中有明显差异表达。结论:梅尼埃病患者基因表达谱异于正常人,GSTM1基因显著上调,揭示GSTM1可能作为梅尼埃病一个潜在生物标记物,免疫因素可能在梅尼埃病发病过程中起重要作用。
【学位单位】：山东大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：R764.33
【部分图文】：

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本文编号：2873721