遗传性耳聋基因SNP分型基因芯片产品的研发
发布时间：2021-06-06 17:19
随着遗传性耳聋致病基因和作用机制的深入研究,越来越多的科研工作者把工作重点转移到基因型表型相关性研究领域。本论文首先进行了文献研究,筛选出了南方地区非综合征性耳聋患者GJB2基因、SLC26A4基因和和mtDNA 12S rRNA基因上存在的20个SNP突变热点;建立了基于这些SNP位点的多重PCR、单碱基延伸和基因芯片检测技术联合对遗传性耳聋致病基因分型方法;设计了点制41条探针,共6个Arrays,每个Array分布了144个信号点耳聋分型芯片,每张芯片可检测6个样本。结果表明:该基因分型芯片的检测灵敏度为75pg;用一代测序确诊的23例患者样本进行测试,结果检测特异性为100%,假阳性0%;数据的批间差10%以下。扩大样本数至南方地区235例非综合征性耳聋患者样本,研究发现67例携带GJB2突变基因,其中c.235delC突变34例（14.17%）,c.109G>A突变10例（10.21%）;发现31例携带SLC26A4突变基因,其中c.919-2A>G20例（8.51%）,c.2168A>G 9例（3.83%）;发现线粒体DNA 12S rRNA基因存在m.1...
【文章来源】：上海交通大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
研究路线图
上海交通大学工程硕士学位论文表 2-1 不同饱和盐溶液的相对湿度Table2-1Relative humidity of different saturated salt solutionsSatutated saltsolutionsRelative humidity at different temperatures (℃)15 20 25 30 40CaCl2 6H2O 0.35 0.32 0.29 0.26K2CO3 2H2O 0.44 0.45Ca(NO3)2 4H2O 0.60 0.55 0.50 0.45NaBr 2H2O 0.61 0.59 0.57 0.55NaCl 0.75 0.75 0.75 0.75 0.75KCl 0.86 0.85 0.85
c)图 2-2 遗传性耳聋基因 SNP 分型基因芯片探针分布a: 一张耳聋基因芯片上有 6 个相同的 Array，每个 Array 用围栏分离成单独的区域，每个区域能检测一个样本；b：芯片杂交后，通过结合的 cy3 标记特异荧光探针读取荧光信号，每个 Array 上的探针组合均相同；c：探针在芯片上的位置信息，P 为阳性对照，N 为阴性对照，B 为空白对照。Fig. 2-2 Layout of oligonucleotide probes in the hereditary deafness gene SNP chipa:A microarray was composed of six identical arrays, each of which is separted by a rectangle intoscanning area of a sample;b: After hybridization, the fluorescence signal was read by thecombination of the cy3 marker specific fluorescent probe, and each array had same combinationof triplicate oligonucletide probes; c: Position information of probe on the chip. P means PositiveProbe, N denotes Negative Probe, B represents Blank (Spotting buffer).
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘肃省375例非综合征型聋患者聋病易感基因突变检测分析[J]. 段世宏,郭玉芬,冯秀云,刘增平,袁逸铭,李勇. 听力学及言语疾病杂志. 2017(04)
[2]宁波地区非综合征型耳聋患儿耳聋基因热点突变筛查分析[J]. 高薇薇,卢文翔,张雷,白云飞. 浙江医学. 2017(12)
[3]广西地区222例感音神经性聋患者常见耳聋基因筛查结果分析[J]. 刘闽,胥亮,刘水霞,史敏,唐凤珠,瞿申红,梁建平,陆秋天,彭璐,景艳,李凤提. 听力学及言语疾病杂志. 2017(01)
[4]贵州省356例非综合征型聋患者常见致聋基因突变分析[J]. 杨雪,王幼勤,郭洪源,兰莉,刘宇清,曹祖威,陶方英,杨可婕. 听力学及言语疾病杂志. 2017(01)
[5]遗传性耳聋基因芯片检测方法的建立[J]. 李维,王以婷,刘丽益,张静. 中国优生与遗传杂志. 2016(11)
[6]线粒体DNA突变与遗传性聋[J]. 王芳,刘星辰,郭玉芬. 听力学及言语疾病杂志. 2016(04)
[7]孕前耳聋基因筛查和耳聋预防[J]. 查树伟,查佶,许豪勤,吕年青. 中国计划生育学杂志. 2016(04)
[8]河南省100例非综合征型聋患者聋基因突变分析[J]. 杨爱利,耿曼英,张慧,郭小艳,汤建芬,韩富根. 临床耳鼻咽喉头颈外科杂志. 2015(22)
[9]中国云南地区非综合征型感音神经性耳聋GJB2和GJB3基因突变分析[J]. 马静,林垦,毛志勇,李正才,赵丽萍,张铁松. 中国耳鼻咽喉颅底外科杂志. 2015(02)
[10]多重PCR技术在植物生物学研究中的应用进展[J]. 任素贤,艾鹏飞,宋层孝,陈文静,宋建军. 安徽农业科学. 2015(06)
博士论文
[1]遗传性耳聋基因诊断新技术的研究和应用与非综合征性耳聋家系的分子遗传学研究[D]. 门美超.中南大学 2011
本文编号：3214815
【文章来源】：上海交通大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
研究路线图
上海交通大学工程硕士学位论文表 2-1 不同饱和盐溶液的相对湿度Table2-1Relative humidity of different saturated salt solutionsSatutated saltsolutionsRelative humidity at different temperatures (℃)15 20 25 30 40CaCl2 6H2O 0.35 0.32 0.29 0.26K2CO3 2H2O 0.44 0.45Ca(NO3)2 4H2O 0.60 0.55 0.50 0.45NaBr 2H2O 0.61 0.59 0.57 0.55NaCl 0.75 0.75 0.75 0.75 0.75KCl 0.86 0.85 0.85
c)图 2-2 遗传性耳聋基因 SNP 分型基因芯片探针分布a: 一张耳聋基因芯片上有 6 个相同的 Array，每个 Array 用围栏分离成单独的区域，每个区域能检测一个样本；b：芯片杂交后，通过结合的 cy3 标记特异荧光探针读取荧光信号，每个 Array 上的探针组合均相同；c：探针在芯片上的位置信息，P 为阳性对照，N 为阴性对照，B 为空白对照。Fig. 2-2 Layout of oligonucleotide probes in the hereditary deafness gene SNP chipa:A microarray was composed of six identical arrays, each of which is separted by a rectangle intoscanning area of a sample;b: After hybridization, the fluorescence signal was read by thecombination of the cy3 marker specific fluorescent probe, and each array had same combinationof triplicate oligonucletide probes; c: Position information of probe on the chip. P means PositiveProbe, N denotes Negative Probe, B represents Blank (Spotting buffer).
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘肃省375例非综合征型聋患者聋病易感基因突变检测分析[J]. 段世宏,郭玉芬,冯秀云,刘增平,袁逸铭,李勇. 听力学及言语疾病杂志. 2017(04)
[2]宁波地区非综合征型耳聋患儿耳聋基因热点突变筛查分析[J]. 高薇薇,卢文翔,张雷,白云飞. 浙江医学. 2017(12)
[3]广西地区222例感音神经性聋患者常见耳聋基因筛查结果分析[J]. 刘闽,胥亮,刘水霞,史敏,唐凤珠,瞿申红,梁建平,陆秋天,彭璐,景艳,李凤提. 听力学及言语疾病杂志. 2017(01)
[4]贵州省356例非综合征型聋患者常见致聋基因突变分析[J]. 杨雪,王幼勤,郭洪源,兰莉,刘宇清,曹祖威,陶方英,杨可婕. 听力学及言语疾病杂志. 2017(01)
[5]遗传性耳聋基因芯片检测方法的建立[J]. 李维,王以婷,刘丽益,张静. 中国优生与遗传杂志. 2016(11)
[6]线粒体DNA突变与遗传性聋[J]. 王芳,刘星辰,郭玉芬. 听力学及言语疾病杂志. 2016(04)
[7]孕前耳聋基因筛查和耳聋预防[J]. 查树伟,查佶,许豪勤,吕年青. 中国计划生育学杂志. 2016(04)
[8]河南省100例非综合征型聋患者聋基因突变分析[J]. 杨爱利,耿曼英,张慧,郭小艳,汤建芬,韩富根. 临床耳鼻咽喉头颈外科杂志. 2015(22)
[9]中国云南地区非综合征型感音神经性耳聋GJB2和GJB3基因突变分析[J]. 马静,林垦,毛志勇,李正才,赵丽萍,张铁松. 中国耳鼻咽喉颅底外科杂志. 2015(02)
[10]多重PCR技术在植物生物学研究中的应用进展[J]. 任素贤,艾鹏飞,宋层孝,陈文静,宋建军. 安徽农业科学. 2015(06)
博士论文
[1]遗传性耳聋基因诊断新技术的研究和应用与非综合征性耳聋家系的分子遗传学研究[D]. 门美超.中南大学 2011
本文编号：3214815
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/yank/3214815.html
最近更新
教材专著
