海南东寨港红树林植物内生放线菌药用资源勘探

发布时间：2017-11-10 11:10

  本文关键词：海南东寨港红树林植物内生放线菌药用资源勘探

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【摘要】：[目的]勘探海南东寨港真红树植物内生放线菌多样性,为发现放线菌新物种和新抗生素奠定基础。[方法]样品经表面消毒后粉碎,用10种不同培养基分离放线菌；通过PCR扩增、测定并比对16S rRNA基因序列,开展放线菌多样性分析；通过发酵、萃取等处理方法得到四类样品,包括发酵原液、乙酸乙酯提取液及水层和菌体的丙酮浸泡提取液；采用纸片扩散法对样品进行抗菌活性筛选；基于PCR的基因筛选技术探测活性菌株可能存在的NRPS、PKSI、PKSⅡ抗生素生物合成基因。[结果]经形态特征排重,从14种真红树植物样品中共得到放线菌146株,16S rRNA基因序列比对表明它们分布于13个科18个属,其中链霉菌属为优势菌属,菌株S3Cf-2 和 S3Af-1 的 16S rRNA基因序列分别与有效发表菌株Couchioplanes caeruleusDSM44103T (X93202)和Microlunatus terrae BS6T(JF806519)的相似率最高,分别为97.45%和97.43%。菌株S3Af-1已由本课题组庹利博士完成多相分类工作,证实菌株为丙酸杆菌科小月菌属的新种,命名为Microlunatus endophyticus,并撰文发表在IJSEM (International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology)。菌株S3Cf-2相关多相分类学研究工作已由本实验室刘少伟博士完成,文章正在撰写中。对其中46株放线菌发酵样品的抗菌活性检测表明,40株具有抗菌活性,总阳性率为86.96%。其中菌株S3Cf-2对金黄色葡萄球菌有很强的抑菌活性,对粪肠球菌也有较强抑菌活性；菌株S3Af-1对金黄色葡萄球菌有一定抑菌活性。活性菌株中,38株菌存在至少一种所探测的生物合成基因簇,阳性率为95%,其中14株同时具有所探测的3种抗生素生物合成基因簇。[结论]海南东寨港真红树植物中存在多样性丰富的药用放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种及新抗生素的潜力。
【学位授予单位】：北京协和医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R915

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本文编号：1166372