采用药效团模型和分子对接方法筛选新型的组蛋白甲基转移酶G9a抑制剂

发布时间：2019-04-04 10:04

【摘要】：目的利用药效团模型和分子对接方法对商业化合物库ChemDiv中的G9afocused-libraries进行筛选,希望发现新骨架结构的G9a抑制剂。方法首先,使用Discovery studio 3.1软件分别构建基于配体的药效团模型和基于配体-受体复合物的药效团模型,并根据构建的2个模型再重新定义2个新的药效团模型。然后,构建测试集并测试药效团模型的预测能力。最后,选取最优药效团模型对G9afocused-libraries进行筛选,对筛选出的化合物使用CDOCKER分子对接进行分析与评价。结果测试结果显示,所构建的药效团模型具有一定的预测能力,通过该药效团筛选得到了2个结构新颖的潜在的G9a抑制剂。结论所构建的药效团模型具有一定的可靠性,虚拟筛选发现的G9a抑制剂还需进一步的实验证明。
[Abstract]:Aim to screen the G9afocused-libraries in the commercial chemical library ChemDiv by using the pharmacophore model and molecular docking method, and hope to find a new G9a inhibitor with a new skeleton structure. Methods firstly, the pharmacophore models based on ligand and ligand-receptor complex were constructed by using Discovery studio 3.1. and two new pharmacodynamics models were redefined according to the two models. Then, the test set is constructed and the predictive ability of the pharmacodynamics model is tested. Finally, the optimal pharmacophore model was selected to screen G9afocused-libraries, and the selected compounds were analyzed and evaluated by CDOCKER molecular docking. Results the experimental results showed that the established pharmacophore model had certain predictive ability. Two potential G9a inhibitors with novel structure were obtained by screening the pharmacophore. Conclusion the established pharmacophore model has certain reliability, and the G9a inhibitors found by virtual screening should be proved by further experiments.
【作者单位】： 四川大学生物治疗国家重点实验室;
【分类号】：R96

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