基因组分析导向发现海洋链霉菌IMB3-202产生的吲哚咔唑生物碱

发布时间：2020-12-06 15:17

　　耐药细菌的不断出现与传播,使得感染性疾病的临床治疗面临巨大挑战,研制新型抗耐药菌的药物迫在眉睫。传统的从土壤放线菌中发现新结构抗生素的几率日趋下降,而海洋微生物中一系列结构新颖的先导化合物的发现,使海洋放线菌引起了广泛的关注。基因组测序技术的进步使得从基因水平上预测微生物次级代谢产物的结构成为可能。因此,基于基因组序列分析、发现海洋放线菌中新活性天然产物成为近年的研究热点。本研究是以基因组分析为导向,预测一株海洋来源的放线菌—链霉菌（Streptomyces sp.）IMB3-202的次级代谢产物,并对其进行分离、纯化和结构鉴定,以期获得新型的抗耐药菌活性化合物。利用AntiSMASH3.0对菌株基因组进行生物信息学分析,发现其基因组中,存在一条与吲哚咔唑类化合物生物合成基因相似的基因簇,提示该菌株具有产生吲哚咔唑化合物的潜能;对菌株IMB3-202的发酵培养基和发酵条件进行优化,确定了其最佳培养条件;采用多种色谱方法对发酵产物进行系统的分离纯化,从中分离纯化得到4个吲哚咔唑类化合物（1～4）;利用UV、IR、MS、1D和2DNMR等波谱方法进行结构鉴定,其结构分别确定为星形孢菌素（1... 

【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章页数】：94 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１从海洋微生物中发现的先导化合物??ＦｉｇｕｒｅｌＬｅａｄ?ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ?ｆｒｏｍ?ｍａｒｉｎｅ?ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ??近年来，基因测序技术的发展使得通过基因组测序分析和发现微??

??图２－１部分海洋放线菌粗提物的活性结果??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ａｎｔｉｂａｃｔｅｒｉａｌ?ａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ?ｏｆ?ｃｕｌｔｕｒｅ?ｅｘｔｒａｃｔｓ?ｆｒｏｍ??ｍａｒｉｎｅ－ｄｅｒｉｖｅｄａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｓ??ｃ．?ｖｎｍｏ??ｗ?＇????＇＜?？＜－．?ｒ?－?＊?ｔ?＞??Ｉ］?Ｉ?１??？?ＪＬ?．?Ｊｉ??：—二４〔，冬?—，?４－?＿７??ＪＬ」ＷＪＬ?」ｍｂ６??ｍ?ＪＵ?Ａ?ＩＭＢ

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【参考文献】：
期刊论文
[1]吲哚咔唑类化合物及其衍生物的抗肿瘤活性[J]. 陈苏婷,尤启冬.  化学进展. 2008(Z1)
[2]一种简单、有效的适于PCR操作的放线菌DNA提取方法[J]. 姜淑梅,张龙,戴世鲲,李翔.  生物技术. 2007(01)



本文编号：2901594