海洋生物基因组数据库中新型降钙素序列挖掘、优化与功能验证

发布时间：2020-12-08 07:37

　　背景:我国已逐步进入老年社会,骨质疏松症是老年人尤其是中老年妇女的常见病,尽管降钙素是临床上用来治疗骨质疏松症的有效药物,但其也存在着诸如成本高、半衰期较短、免疫原性高等问题。因此,发掘更高效的降钙素具有重要临床意义。目的:通过对多种新型海洋来源的降钙素基因序列进行序列对比、进化树分析、活性检测,发现高效新型降钙素,为临床应用奠定基础;建立高通量挖掘验证活性多肽的技术平台,为发现新功能多肽提供技术储备。内容:1、利用生物信息学方法从海洋生物基因组数据库中挖掘不同物种的降钙素序列。2、分析各降钙素序列差异、化学合成、质谱分析及活性验证。3、总结活性规律,并在此基础上设计优化新的降钙素序列及功能验证。4、通过对降钙素的研究初步建立海洋生物活性多肽的筛选平台。方法:1、利用鲑鱼降钙素序列进行BLAST获得其他物种的降钙素序列,由两部分组成:NCBI非冗余蛋白库和华大基因水生生物基因组数据库。2、通过clustal omega软件进行序列比对,结合物种选取具有代表性的序列使用MEGA7软件构建进化树。3、根据进化树结果,结合物种分类选择包括鲑鱼降钙素在内的13条序列进行化学合成。4、按照中国药... 

【文章来源】：中国人民解放军海军军医大学上海市 211工程院校

【文章页数】：98 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

鲑鱼降钙素的空间3D结构

MEGA7 软件构建的降钙素进化树。进化树使用邻接法和最大别构建，然后生成一个共识树。进化距离使用 JTT 矩阵法计算代表遗传距离Evolutionary relationships of calcitonins. Phylogenetic analysis waA7 software using the Neighbor-Joining method and Maximum Lhe evolutionary distances were computed using the JTT matrix-basular evolutionary tree of the calcitonin peptides was also drawn by are. The numbers at internal nodes and branches indicate the percentstrap values (1000 replicates). Scale length represented genetic dis树结果显示，根据距离关系和物种，我们可以将这 27 条序列分二组和第五组中各选择 3 条序列，从第一组和第三组中各选择中选择 1 条序列，再加上人降钙素和鲑鱼降钙素共计 13 条用于性检测。序列及物种信息见表 5。

Gga的MS/HPLC结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]海洋动物活性多肽和多糖的研究进展[J]. 孟春英,王茂剑,张健,王共明,侯志刚.  齐鲁渔业. 2015 (05)
[2]对骨质疏松性慢性疼痛:如何认知和预防?[J]. 位新维,陈志信.  中国组织工程研究. 2014(38)
[3]鲑鱼降钙素柔性脂质体大鼠鼻腔给药的降血钙效应[J]. 陈铭,邓秋,李馨儒,刘艳.  药学学报. 2007(06)
[4]蛋白多肽类药物的药代动力学研究概况[J]. 樊蓉,张纯,高申.  药学实践杂志. 2006(03)
[5]利用烟草表达一种新型鲑鱼降钙素的初步研究[J]. 王晓晔,普颖颖,宋杰,王国丰,钱虹妹,林娟,赵凌侠,唐克轩.  扬州大学学报. 2006(01)
[6]聚乙二醇修饰蛋白质类药物的研究现状及展望[J]. 徐静.  国外医学(预防、诊断、治疗用生物制品分册). 2004(02)
[7]鲑鱼降钙素重组杆状病毒载体的构建及表达[J]. 刘颖,王正坤,梁东春,郭刚,张镜宇.  现代口腔医学杂志. 2003(01)
[8]美国国家卫生院有关骨质疏松症的预防、诊断和治疗的共识文件[J]. 秦岭,张戈.  中国骨质疏松杂志. 2002(02)
[9]人修饰型降钙素和鼠酰胺化酶基因在昆虫细胞中的偶联表达[J]. 杨冠珍,陈珍珍,崔大敷,李伯良,吴祥甫.  生物工程学报. 2002(01)
[10]鲑鱼降钙素在链霉菌中的分泌表达[J]. 洪斌,李元,李嗣英,姜蓉.  遗传学报. 1998(04)



本文编号：2904723