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Phoma sp.XZ068的基因组分析及其杂萜产物的生物合成研究

发布时间:2020-12-16 11:48
  真菌次级代谢产物作为药物先导化合物的重要来源,近年来成为药物研发的热点领域之一。本课题组前期从低温来源茎点霉属真菌Phoma sp.XZ068中获得了一系列具有环庚三烯酚酮-倍半萜骨架结构的杂萜类化合物,体外活性评价表明该类化合物具有良好的细胞毒活性,其中eupenifeldin对神经胶质瘤细胞的增殖具有显著的抑制活性,有望成为治疗神经胶质瘤药物的先导分子。为深入研究该类化合物的生物合成,本研究对产生菌Phoma sp.XZ068进行了全基因组测序及生物信息学分析,并在此基础上开展了 eupenifeldin类杂萜的生物合成研究。本研究基于Phoma sp.XZ068的全基因组数据对其基因组特征进行了描述,并分析预测了该菌株可能的生存策略,同时对该菌株次级代谢产物的生物合成基因簇进行了预测及转录验证,揭示了该菌株在大米培养基上合成的次级代谢产物结构类型较为丰富。在此基础上,结合生物信息学分析、基因敲除实验及发酵产物的化学分析,鉴定了 eupenifeldin的生物合成基因簇eup,并对簇内各基因的功能进行了预测及验证。通过体外酶学功能验证及体内基因高表达实验,对簇中与eupenifel... 

【文章来源】:中国科学技术大学安徽省 211工程院校 985工程院校

【文章页数】:131 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

Phoma sp.XZ068的基因组分析及其杂萜产物的生物合成研究


图1.7在构巢曲霉中进行青霉素生物合成途径的重构[25]??对于现有真菌次级代谢产物基因簇的信息进行统计分析,结果表明真菌体内??大部分次级代谢产物由于培养条件的限制、分离方法的不适以及自身代谢网络的??

生物合成,前体化合物,生物学,麦角生物碱


?第1章???及酿酒酵母中实现了抗疟疾药物青蒿素前体化合物的生产[30"31],充分证实了合成??生物学策略应用于药物研究领域中的重要意义。麦角生物碱是一类结构多样的吲??哚生物碱,大部分该类化合物都具有较强的生理活性及药用价值,对于麦角生物??碱的合成生物学研宄也己开展,其中麦角碱cycloclavine的生物合成己在酿酒酵??母中实现(图1.9),并通过优化其前体化合物的合成途径将其产量提高至500??mg/L[32],为后续基于化合物cycloclavine的药物研发奠定了坚实的基础。??a。阳w'??

茎点霉属,天然产物,麦角碱,前体化合物


大部分该类化合物都具有较强的生理活性及药用价值,对于麦角生物??碱的合成生物学研宄也己开展,其中麦角碱cycloclavine的生物合成己在酿酒酵??母中实现(图1.9),并通过优化其前体化合物的合成途径将其产量提高至500??mg/L[32],为后续基于化合物cycloclavine的药物研发奠定了坚实的基础。??a)?Cl?Y?。阳w?j?f'????S>PP?^??X/->c〇2h??L-Tryptophan?DMAPP?HjN?HN??DMAT?/V-Me-OMAT??1??h、?,〇〇?[M???HI*?=?255?Ea?E/E**C?\?Oxkkxeductasa/??u,?A?I?Catalase??|?j?Chanoclavtne-I?aldehyde?j?^?.OH??,?T39?^??ii?I?V??hLT??Chanodavine-4??,〇〇?T?卜241?;??EasD?!?Oxidase??Chanoda>nnd-l??f|?I?A|_Ea*A?Reductase?.??w?.?A*_A???ALG?*?A(_H?by-proAje*?J?\?丄?Aj_EasH?Ooxygenase??°*???一???H?广、|?A|_EwG?Reductase?h??:

【参考文献】:
期刊论文
[1]特殊生境真菌来源的新结构活性物质研究[J]. 车永胜.  国际药学研究杂志. 2011(01)
[2]从南方山荷叶分离出一株产鬼臼毒素类似物的内生真菌[J]. 曾松荣,邵华,张玲琪.  微生物学杂志. 2004(04)
[3]一株产长春新碱内生真菌的初步研究[J]. 杨显志,张玲琪,郭波,郭仕平.  中草药. 2004(01)
[4]长春花内生真菌的分离及其发酵产生药用成分的初步研究[J]. 张玲琪,郭波,李海燕,曾松荣,邵华谷苏,魏蓉城.  中草药. 2000(11)

博士论文
[1]两株海洋真菌来源的混源萜类次级代谢产物研究[D]. 张国建.中国海洋大学 2011

硕士论文
[1]两株地中海海鞘和海绵来源的内生真菌次级代谢产物及其生物活性研究[D]. 李莉.中国科学院大学(中国科学院海洋研究所) 2018



本文编号:2920090

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