基于基因表达谱的苯扎贝特抗肺腺癌活性的研究

发布时间：2020-12-18 17:22

　　肺癌发病率约有三分之一为肺腺癌。肺腺癌的治疗手段已经取得较大的进步,但患者预后仍然较差。肺腺癌发病初期无明显临床症状,发现时已经发生转移或者处于晚期阶段,只能采取以化疗为主的治疗手段。但传统的化疗药物通常存在毒性较大,副作用较强等缺陷,发现新的高效低毒的治疗药物,对延长肺腺癌病人的生命及降低死亡率有着迫切的临床需要和极其重要社会意义。本研究内容主要分为两个部分:第一部分:肺腺癌关键基因及通路分析1.差异表达基因分析:从基因表达综合数据库（GEO）下载三个肺腺癌基因表达谱数据集,GSE27262、GSE75037和GSE83213。采用R语言程序以及limma包分别对三个数据集进行基因差异表达分析,RRA包去除不同平台间批次差异,最终获得共同差异表达基因172个,其中上调基因56个,下调基因116个（P<0.05,|log2Fold change|≥2）。2.肺腺癌关键基因的获得及其表达与预后的关系:将筛选出的差异表达基因通过Cytoscape构建其编码的蛋白之间相互作用网络模型,并采用Cytoscape插件Cytohubba筛选出有代表性的10个关键基因TK1,EGFR,TPX2... 

【文章来源】：广西科技大学广西壮族自治区

【文章页数】：77 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

基因表达标准化，A表示GSE27262数据标准化，B表示GSE75037数据标准化，C表示GSE83213数据标准化

表达的火山图，A. GSE27262, B.GSE75037, C.GSE83213。差异倍数大于rential expression of Volcano-plot. A GSE27262 data, B GSE75037 data, C GSEd a corrected P-value≤0.05.

异表达的火山图，A. GSE27262, B.GSE75037, C.GSE83213。差异倍数大于 2 fferential expression of Volcano-plot. A GSE27262 data, B GSE75037 data, C GSE83 and a corrected P-value≤0.05.

【参考文献】：
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博士论文
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硕士论文
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本文编号：2924322