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赤子爱胜蚓Calreticulin的cDNA和氨基酸序列分析

发布时间:2021-01-16 06:13
  目的分析赤子爱胜蚓Calreticulin的cDNA和氨基酸序列。方法从本院构建的赤子爱胜蚓cDNA文库中经测序获得其Calreticulin cDNA序列。采用生物信息学分析工具DNAMAN、NCBI ORF finder、ExPASy Protparam、ExPASY Protscale、NCBI Conserved Domains、SignalP 4. 1 Server、TMHMM Server v. 2. 0、SOSUI、NetPhos 3. 1 Server、PSORT、SOPMA、ExPASy COILS、SWISS-MODEL分别对Calreticulin的cDNA序列、氨基酸序列、一级结构基本理化性质、亲/疏水性、保守结构域、信号肽、跨膜区、可溶性、磷酸化修饰、亚细胞定位、二级结构、卷曲螺旋域以及三级结构进行预测及分析。结果赤子爱胜蚓Calreticulin cDNA序列长476 bp,其中包含354 bp的开放阅读框,编码118个氨基酸残基;Calreticulin由19种氨基酸组成,呈酸性,为稳定的可溶性亲水蛋白;具有1段Calreticulin超家族保守结构域;不... 

【文章来源】:中国生物制品学杂志. 2020,33(01)

【文章页数】:7 页

【部分图文】:

赤子爱胜蚓Calreticulin的cDNA和氨基酸序列分析


DNAMAN分析Calreticulin的cDNA序列

赤子爱胜蚓Calreticulin的cDNA和氨基酸序列分析


TMHMM分析Calreticulin的跨膜性

序列,序列,碱基,一级结构


Calreticulin mRNA序列的ORF始于cDNA序列的第123位碱基,止于第477位碱基,共编码118个氨基酸残基,见图2。2.3 Calreticulin的一级结构和理化性质

【参考文献】:
期刊论文
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[3]人过氧化物氧还蛋白的生物信息学分析[J]. 杨莹莹,赵南晰,安丽萍,孙晶波,郭笑.  北华大学学报(自然科学版). 2018(06)
[4]蚯蚓的药用价值研究进展[J]. 王东,杨欢,王瑞辉.  生物资源. 2018(05)
[5]芦荟大黄素对胃癌SGC-7901细胞株钙联蛋白/钙网蛋白循环及内质网应激凋亡的影响[J]. 宋吉宁,董锦忠,陈文礼.  中国临床研究. 2018(06)
[6]蚯蚓提取物对伊莎雪佛黑鸡生产性能及免疫功能的影响[J]. 李娟,邱时秀,雷春龙,李丛艳,许祯莹,梅秀丽,吴永胜.  黑龙江畜牧兽医. 2018(08)
[7]蚯蚓的化学成分与应用价值研究进展[J]. 涂清波,林颖,苏鹏亮,陆冬莺,马宇凡,王赛男,徐丹.  安徽农业科学. 2017(34)
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[9]蚯蚓提取物作用的研究进展[J]. 吴泽宇,孙晋民,王俭,蔡冬梅.  山西医药杂志. 2015(13)
[10]蚯蚓提取物对动物创伤愈合作用的研究进展[J]. 殷建建,胡群,易子晴,刘洋,易丹,李文平.  中国兽医杂志. 2015(06)

硕士论文
[1]Calreticulin诱导鼻咽癌CNE2细胞EMT相关信号通路研究[D]. 朱军辉.南华大学 2018
[2]蚯蚓活性蛋白抗结肠癌DLD-1细胞作用机制的研究[D]. 马远娜.山东大学 2014



本文编号:2980303

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