RNA结合蛋白作为氯福克酚药靶的机制初探

发布时间：2021-01-21 02:18

　　目的探索氯福克酚靶向RNA结合蛋白的抗胶质瘤机制。方法 Biotin pull-down实验检测RNA结合蛋白N-ras上游蛋白（UNR）与靶基因Krüppel样因子13（KLF13）mRNA各片段的结合,以及氯福克酚对UNR与下游靶基因KLF13 mRNA片段结合能力的影响;氯福克酚靶点稳定性的药物亲和反应（DARTS）样品质谱检测结果与转录组芯片分析相结合,筛选其他RNA结合蛋白作用靶点,并对其他下游靶基因进行预测分析。结果氯福克酚可以增强UNR与KLF13 mRNA片段的结合;氯福克酚还可与其他RNA结合蛋白相互作用,参与mTOR信号通路以及由肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体（TRAIL）激活的凋亡信号通路。结论氯福克酚可通过作用于RNA结合蛋白而起到抗胶质瘤的效果。 

【文章来源】：基础医学与临床. 2020,40(05)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

氯福克酚增强UNR与KLF13 mRNA之间的互作

氯福克酚作用于UNR的下游靶基因预测分析

本实验室前期筛选出了一种以RNA结合蛋白UNR为靶点的可有效治疗胶质瘤的潜在新药氯福克酚,但药靶UNR调控靶基因KLF13表达的具体机制尚不清楚。为了证明靶基因KLF13 mRNA与药靶UNR之间存在互作, 克隆并制备了包含UNR潜在结合位点的6条探针,体外pull-down筛选到了2条包含GAAGGA、GAAGAA序列的KLF13 mRNA所在探针片段可结合UNR,利用pull-down实验进一步发现氯福克酚处理可增强其中一条探针与UNR的结合能力,这提示氯福克酚可能主要通过该探针所在片段,增强UNR与KLF13 mRNA的结合能力。为了找寻氯福克酚抗胶质瘤的其他重要作用靶点以及下游途径,通过氯福克酚DARTS样品质谱检测结果结合转录组芯片分析,发现除了UNR蛋白外,另外3个经典RNA结合蛋白XPO7、LARS和EIF3B也可以作为氯福克酚的靶点,这4个RBP均具有可结合RNA的保守结构域[6]。利用网上已公开的数据进一步预测分析发现,氯福克酚还可能通过调控mTOR信号通路以及TRAIL激活的凋亡信号通路而起到抗胶质瘤的效果,但氯福克酚治疗胶质瘤的这些潜在机制还尚未进一步证实。图4 氯福克酚作用于其他经典RBPs的下游靶基因预测分析


本文编号：2990253