阿那白滞素与白细胞介素-1β的分子作用机制

发布时间：2021-01-29 10:00

　　阿那白滞素（Anakinra）是一类重要的白细胞介素-1β的抑制剂,对于治疗多种疾病引起的并发症具有重要作用。采用分子对接和分子动力学方法研究了Anakinra抑制白细胞介素-1β的分子作用机制。结果表明,Anakinra可由氢键作用结合于白细胞介素-1β的表面,它的结合使白细胞介素-1β的结构趋于稳定,从而抑制其生物活性。Anakinra的结合没有明显改变白细胞介素-1β的亲水性和疏水性,白细胞介素-1β内部氢键数目的改变是稳定性发生改变的主要原因。 

【文章来源】：精细与专用化学品. 2020,28(09)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

IL-1β与Anakinra对接后的最优结构

分别以IL-1β与Anakinra分子对接前后的结构为初始结构进行了20ns的分子动力学模拟。为了确定模拟过程中结构的稳定性,对模拟过程中IL-1β和Anakinra分子结构的均方根偏差(RMSD)进行了计算。IL-1β与Anakinra对接前后的结构在分子模拟过程中的均方根偏差结果见图2。从图2中可见,IL-1β的结构在经过3ns的运动之后达到了稳定,RMSD的波动范围在0.15nm之内。然而,在经过15ns的运动之后,RMSD值又出现了波动,表明IL-1β蛋白具有较大的柔性,这可能是其保持活性的主要原因。在IL-1β与Anakinra对接之后的结构的模拟的过程中,Anakinra分子的RMSD值在0～3ns内出现了明显的波动,表明初始的对接结构并不是最稳定的结构。然而,在经过3ns的运动之后,Anakinra分子的RMSD值较为稳定,表明达到了稳定结构,经过20ns的运动之后依然保持了良好的稳定性。IL-1β经过3ns的运动之后也达到了稳定,RMSD值的波动维持在0.1nm之内,并且在20ns的运动范围之内依然保持了良好的稳定性,这可能是由于Anakinra的对接使IL-1β的结构更加稳定,降低了蛋白的柔性,从而抑制了IL-1β蛋白的活性。2.3 分子模拟过程中的结构分析

IL-1β与Anakinra对接前后


本文编号：3006696