炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素生物合成相关基因簇P450的功能分析
发布时间:2021-04-01 07:48
炭样小单孢菌JXNU-1(M.carbonacea JXNU-1)是实验室前期由瑶湖农田土壤样品中分离出的一株稀有放线菌,它可以产生一种核苷类的广谱抗生素JX,其基因簇P450为抗生素JX合成相关基因簇,但它的具体功能仍不清楚基因敲除是常用的基因功能研究手段,它通过移除目的基因构建基因缺失菌株,通过比较基因缺失菌株与野生型菌株的表现型差异研究目的基因的功能。本文通过构建基因簇P450缺失突变株炭样小单孢菌JXNU-ΔP450以及回复突变株炭样小单孢菌JXNU-re,研究基因簇P450在炭样小单孢菌JXNU-1产抗生素JX的生物合成中的作用,具体过程和结果如下:1.以温敏型质粒pKC1139作为模板,导入炭样小单孢菌JXNU-1目的基因上下游片段作为同源交换臂以及质粒pIJ790上氯霉素抗性标记基因cat,成功构建炭样小单孢菌JXNU-1基因敲除载体pFD306,经测序验证后,通过电转化导入野生型炭样小单孢菌JXNU-1受体菌,再通过抗性筛选、目的基因PCR扩增及扩增产物测序验证,成功构建基因缺失株炭样小单孢菌JXNU-ΔP450,并通过PCR产物验证以及测序验证确定了目的基因簇的缺失。...
【文章来源】:江西师范大学江西省
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
同源重组技术替换目的基因Fig.1-1Replacedesirablegenebyhomologousrecombination
图 1-2 锌指蛋白结构Fig.1-2 Structure of the zinc finger proteinNA、RNA 这类核酸结合,还能结合 DNA白或自身,在转录和翻译水平上调控基因
图 1-4TALE蛋白结构Fig.1-4 Structure of the TALE proteinTALE 识别 DNA 的机制在于不同的 RVD 能够相对特异地分别识别 A、TC、G 4 种碱基中的一种。通过对天然 TALE 的研究发现,有 20 多种不同的 RVD
【参考文献】:
期刊论文
[1]抑制性消减杂交法筛选炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素合成相关基因[J]. 江云,黄运红,李非,龙中儿. 基因组学与应用生物学. 2016(10)
[2]CRISPR/Cas9基因编辑技术最新研究进展[J]. 谢亚磊,刘千琪,刘戟. 生命的化学. 2016(01)
[3]Red/ET同源重组技术在载体构建中的应用[J]. 曾吉祥. 生物技术世界. 2015(07)
[4]一株具有广谱抗菌活性炭样小单孢菌的全基因组序列测定[J]. 江云,黄运红,李非,龙中儿. 微生物学通报. 2015(11)
[5]CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术研究进展[J]. 李聪,曹文广. 生物工程学报. 2015(11)
[6]靶向核酸酶介导基因编辑技术的发展[J]. 项光海,王皓毅. 生命科学. 2015(01)
[7]基因组挖掘技术在海洋放线菌天然产物研究开发中的应用及展望[J]. 陈亮宇,王玉梅,赵心清. 微生物学通报. 2013(10)
[8]小单孢菌科研究进展[J]. 张晓敏,刘秋,刘限,王皓,闫建芳,刘长建,齐晓辉,白湜. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2013(09)
[9]大肠杆菌-链霉菌穿梭型BAC载体的构建及功能验证[J]. 戴素琴,周围,邢玉华,刘体颜,谭俊杰,曲国龙,王微,刘刚,陈惠鹏,张部昌. 军事医学. 2013(08)
[10]CRISPR/Cas9介导的基因组定点编辑技术[J]. 方锐,畅飞,孙照霖,李宁,孟庆勇. 生物化学与生物物理进展. 2013(08)
硕士论文
[1]炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素合成相关基因筛选[D]. 江云.江西师范大学 2016
[2]纺锤链霉菌SD-07遗传转移体系的建立及产多烯大环内酯类抗生素基因簇的初步研究[D]. 王先坤.山东大学 2014
[3]冰城链霉菌属间接转移体系及南昌霉素中断菌株的构建[D]. 贺祖宏.东北农业大学 2012
[4]链霉菌769遗传转化体系的建立和优化[D]. 张红丹.吉林农业大学 2011
[5]nsdA基因中断及orfX基因整合表达对阿维链霉菌次级代谢的影响[D]. 范与庆.华中农业大学 2007
[6]稀有放线菌的分离及其发酵产物的农用活性研究[D]. 沈玲.西北农林科技大学 2006
[7]黑暗链霉菌基因转移系统的研究[D]. 吴胜.沈阳药科大学 2001
本文编号:3112958
【文章来源】:江西师范大学江西省
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
同源重组技术替换目的基因Fig.1-1Replacedesirablegenebyhomologousrecombination
图 1-2 锌指蛋白结构Fig.1-2 Structure of the zinc finger proteinNA、RNA 这类核酸结合,还能结合 DNA白或自身,在转录和翻译水平上调控基因
图 1-4TALE蛋白结构Fig.1-4 Structure of the TALE proteinTALE 识别 DNA 的机制在于不同的 RVD 能够相对特异地分别识别 A、TC、G 4 种碱基中的一种。通过对天然 TALE 的研究发现,有 20 多种不同的 RVD
【参考文献】:
期刊论文
[1]抑制性消减杂交法筛选炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素合成相关基因[J]. 江云,黄运红,李非,龙中儿. 基因组学与应用生物学. 2016(10)
[2]CRISPR/Cas9基因编辑技术最新研究进展[J]. 谢亚磊,刘千琪,刘戟. 生命的化学. 2016(01)
[3]Red/ET同源重组技术在载体构建中的应用[J]. 曾吉祥. 生物技术世界. 2015(07)
[4]一株具有广谱抗菌活性炭样小单孢菌的全基因组序列测定[J]. 江云,黄运红,李非,龙中儿. 微生物学通报. 2015(11)
[5]CRISPR/Cas9介导的基因编辑技术研究进展[J]. 李聪,曹文广. 生物工程学报. 2015(11)
[6]靶向核酸酶介导基因编辑技术的发展[J]. 项光海,王皓毅. 生命科学. 2015(01)
[7]基因组挖掘技术在海洋放线菌天然产物研究开发中的应用及展望[J]. 陈亮宇,王玉梅,赵心清. 微生物学通报. 2013(10)
[8]小单孢菌科研究进展[J]. 张晓敏,刘秋,刘限,王皓,闫建芳,刘长建,齐晓辉,白湜. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2013(09)
[9]大肠杆菌-链霉菌穿梭型BAC载体的构建及功能验证[J]. 戴素琴,周围,邢玉华,刘体颜,谭俊杰,曲国龙,王微,刘刚,陈惠鹏,张部昌. 军事医学. 2013(08)
[10]CRISPR/Cas9介导的基因组定点编辑技术[J]. 方锐,畅飞,孙照霖,李宁,孟庆勇. 生物化学与生物物理进展. 2013(08)
硕士论文
[1]炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素合成相关基因筛选[D]. 江云.江西师范大学 2016
[2]纺锤链霉菌SD-07遗传转移体系的建立及产多烯大环内酯类抗生素基因簇的初步研究[D]. 王先坤.山东大学 2014
[3]冰城链霉菌属间接转移体系及南昌霉素中断菌株的构建[D]. 贺祖宏.东北农业大学 2012
[4]链霉菌769遗传转化体系的建立和优化[D]. 张红丹.吉林农业大学 2011
[5]nsdA基因中断及orfX基因整合表达对阿维链霉菌次级代谢的影响[D]. 范与庆.华中农业大学 2007
[6]稀有放线菌的分离及其发酵产物的农用活性研究[D]. 沈玲.西北农林科技大学 2006
[7]黑暗链霉菌基因转移系统的研究[D]. 吴胜.沈阳药科大学 2001
本文编号:3112958
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