基于权重基因共表达网络分析（WGCNA）挖掘双酚A代替物的分子作用机制

发布时间：2021-04-26 18:35

　　评估双酚A（bisphenol A, BPA）代替物的内分泌干扰活性并挖掘其分子作用机理。采用分子对接技术模拟预测BPA代替物对人雌激素受体α（estrogen receptor,ERα）的结合活性;构建权重基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis, WGCNA）找到BPA代替物和细胞增殖之间强相关的模块和基因;构建蛋白互作网络（protein protein interaction network,PPI）,找到BPA代替物发挥雌激素活性的枢纽基因（Hub gene）;基因-疾病关联（gene-disease associations）分析找到与BPA代替物高度相关的人类疾病。结果表明,6种BPA均具有雌激素活性;WGCNA分析找到2个模块共1 090个基因与细胞增殖强相关的基因;PPI挖掘到BPA代替物发挥雌激素作用的Hub gene是孕酮受体（rrogesterone receptor,PGR）、Myb相关蛋白（Myb-related protein like 1,MYBL1）、过氧化物酶体增殖剂激活受体（per... 

【文章来源】：中国兽医学报. 2020,40(04)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 分子对接
    1.2 数据获取与标准化
    1.3 WGCNA分析
    1.4 PPI分析
    1.5 基因与疾病分析
2 结果
    2.1 分子对接
    2.2 WGCNA网络的构建
    2.3 蛋白互作
    2.4 基因-疾病关联分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]双酚A对孕鼠子宫、卵巢相关因子的影响及菟丝子黄酮的缓解作用[J]. 张石磊,马双,史万玉,钟秀会.  中国兽医学报. 2019(02)
[2]黄芩苷对双酚A致小鼠生殖损伤的保护作用[J]. 马双,宋鹏琰,韩超,钟秀会.  中国兽医学报. 2018(09)



本文编号：3161909