反向对接的选择性与非选择性抑制剂找靶评价:Glide个案研究（英文）

发布时间：2021-06-09 00:48

　　反向对接作为一种靶标预测的有效工具,有许多方面仍待探究。对反向对接软件的客观评价可以帮助我们更好地了解这些工具的长处与短处,并在靶标预测的过程中起到指导作用。本研究中,我们评估了Glide（SP）针对选择性抑制剂与非选择性抑制剂的靶标预测能力。结果说明针对不同配体,对接打分的倾向可能存在差异,因此总体打分抽样对帮助我们更好地理解某对配体受体间的对接打分具有重要的意义。另外,对接时结合口袋的输入构象对对接结果存在一定的影响。Glide （SP）显示出较好的对非选择性抑制剂的靶标预测能力。然而,其对于选择性抑制剂的靶标预测准确度相对较低,说明该软件不适用于这方面的工作。针对COVID-19的案例研究表面凝血因子Xa可能是氯喹的潜在靶点。因此,我们认为对反向对接软件的进一步开发与靶点间打分差异的修正十分必要。 

【文章来源】：Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences. 2020,29(10)CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1. Introduction
2. Materials and methods
    2.1. Evaluation of datasets
    2.2. Structure preparation
    2.3. Molecular descriptors
    2.4. Molecular docking
3. Results and discussion
    3.1. Physicochemical property analysis
    3.2. Overall scoring sampling
    3.3. Influence of protein conformation changes
    3.4. Prediction precision of the general inhibitors
    3.5. Prediction precision of the selective inhibitors
    3.6. A case study about COVID-19
4. Conclusions



本文编号：3219560