基于基因表达数据筛选神经干细胞促分化作用和Dami细胞增殖抑制作用化合物的研究
发布时间：2021-07-04 05:30
药物筛选一般采用基于药物作用机制和基于作用药靶结构的筛选方式,利用细胞与动物模型,来确定作用效果和作用机制。随着高通量测序技术及基因芯片技术的大规模应用,以及合成化学高通量方法的普及,药物筛选进入了高通量时代,越来越多的新靶标和潜在靶点被发现,这些都得益于基因组数据库的完善和生物信息学自动化操作系统对数据库的分析。本研究利用不同细胞模型高通量转录组测序所得到的基因表达差异数据,采用生物信息分析方法结合基因-药物相互作用数据库和基因表达表型注释数据库,参照药物化合物数据库,筛选细胞模型相对应的基因特异性靶向化合物,利用细胞学方法对化合物干预细胞模型的效果进行验证,从而建立基于基因表达数据的目标化合物筛选和活性验证研究体系。本研究按不同细胞模型分为以下两部分。1.基于基因表达数据筛选具有促神经干细胞分化作用化合物的研究干细胞是一类具有自我复制和多向分化特点的细胞。以骨髓间充质干细胞（mesenchymal stem cells,MSCs）分化为神经干细胞（neural stem cells,NSCs）的研究已经成为干细胞研究的前沿领域。NSCs移植也是未来治疗神经系统疾病的重要方法。NSC...
【文章来源】：东北师范大学吉林省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：266 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
DGIdb数据库检索差异表达基因Figure1.SearchingdifferentiallyexpressedgenesinDGIdbdatabase
24图 2. TSPO 基因匹配化合物及评分Figure 2. TSPO gene matching compounds and their scoring values5． NSCs 培养和诱导分化（1）诱导 NSCs 定向分化实验分组：1）依替福辛诱导组；2）依替福辛+ bFGF 诱导组；3）bFGF+Hepari诱导组；4）正常培养对照组。用分化培养基（DMEM:F12+1%FBS+B27）包被24 孔板，过夜。将 NSCs 接种于 25ml 培养瓶中。分别加入不同组分化培养基诱导分化 3 天及 7 天。换液后放置于 37℃5%CO2培养箱中培养，每 3 天半量换液，40X 显微镜下观察，诱导培养 14 天进行免疫荧光细胞染色鉴定。（2）免疫荧光观察诱导后神经细胞1）取出诱导细胞培养板 PBS 洗 5 分钟 2 次。
三、实验结果（一） MSCs 分离培养及 NSCs 细胞实验1. MSCs 培养MSCs 在低糖培养基中培养 24 小时后可见细胞贴壁生长，呈椭圆形，透亮。培养 3 天后可见多边形细胞。培养 7 天后，细胞迅速增殖，细胞表现不均一，胞核大，贴壁生长。培养 10 天后，细胞呈放射状，形态不完全统一（图 3）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]小鼠胚胎脑源与脊髓源神经干细胞增殖能力的比较[J]. 赵瑜,袁婧,刘建军,鲁琳. 昆明医科大学学报. 2017(09)
[2]表皮干细胞的生物学特性及其潜在应用[J]. 刘雪婷,白春雨,关伟军,马月辉. 生物技术通报. 2016(01)
[3]Acupuncture inhibits Notch1 and Hes1 protein expression in the basal ganglia of rats with cerebral hemorrhage[J]. Wei Zou,Qiu-xin Chen,Xiao-wei Sun,Qing-bin Chi,Hong-yu Kuang,Xue-ping Yu,Xiao-hong Dai. Neural Regeneration Research. 2015(03)
[4]2011年中国恶性肿瘤发病和死亡分析[J]. 陈万青,郑荣寿,曾红梅,邹小农,张思维,赫捷. 中国肿瘤. 2015(01)
[5]测序技术的研究进展[J]. 郝甜甜,李强飞,李国治,陈禹翰,邓卫东. 畜牧与饲料科学. 2014(03)
[6]脂肪干细胞研究进展与应用前景[J]. 周紫微,赵宇. 安徽医科大学学报. 2013(07)
[7]基于神经氨酸酶结构的流感病毒抑制剂的计算机辅助药物设计[J]. 刘磊,马英,王润玲,王树青,徐为人. 天津医科大学学报. 2013(03)
[8]药物基因组学的机遇与挑战[J]. 孙忠实. 中国医院用药评价与分析. 2012(05)
[9]小议2010国内外生命科学重要进展[J]. 孙明伟,高福. 遗传. 2011(02)
[10]Effects of cotransplantated Schwann cells and neural stem cells in a rat model of Alzheimer’s disease[J]. Yan Zhan1, 2, Dihui Ma2, Yu Zhang2 1Department of Neurology, Affiliated Hospital of Hebei University, Baoding 071000, Hebei Province, China 2Department of Neurology, First Clinical Hospital of Jilin University, Changchun 130021, Jilin Province, China. Neural Regeneration Research. 2011(04)
硕士论文
[1]依硫磷酸通过抑制细胞周期进程抗白血病作用的实验研究[D]. 张文英.中国人民解放军医学院 2012
[2]依硫磷酸抑制白血病细胞生物学活性、保护骨髓基质细胞及对化疗药物抗白血病作用影响的实验研究[D]. 刘璇.河北医科大学 2011
[3]ABCA1及MTP基因多态性对辛伐他汀调脂效应的影响[D]. 李颖.天津医科大学 2006
本文编号：3264138
【文章来源】：东北师范大学吉林省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：266 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
DGIdb数据库检索差异表达基因Figure1.SearchingdifferentiallyexpressedgenesinDGIdbdatabase
24图 2. TSPO 基因匹配化合物及评分Figure 2. TSPO gene matching compounds and their scoring values5． NSCs 培养和诱导分化（1）诱导 NSCs 定向分化实验分组：1）依替福辛诱导组；2）依替福辛+ bFGF 诱导组；3）bFGF+Hepari诱导组；4）正常培养对照组。用分化培养基（DMEM:F12+1%FBS+B27）包被24 孔板，过夜。将 NSCs 接种于 25ml 培养瓶中。分别加入不同组分化培养基诱导分化 3 天及 7 天。换液后放置于 37℃5%CO2培养箱中培养，每 3 天半量换液，40X 显微镜下观察，诱导培养 14 天进行免疫荧光细胞染色鉴定。（2）免疫荧光观察诱导后神经细胞1）取出诱导细胞培养板 PBS 洗 5 分钟 2 次。
三、实验结果（一） MSCs 分离培养及 NSCs 细胞实验1. MSCs 培养MSCs 在低糖培养基中培养 24 小时后可见细胞贴壁生长，呈椭圆形，透亮。培养 3 天后可见多边形细胞。培养 7 天后，细胞迅速增殖，细胞表现不均一，胞核大，贴壁生长。培养 10 天后，细胞呈放射状，形态不完全统一（图 3）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]小鼠胚胎脑源与脊髓源神经干细胞增殖能力的比较[J]. 赵瑜,袁婧,刘建军,鲁琳. 昆明医科大学学报. 2017(09)
[2]表皮干细胞的生物学特性及其潜在应用[J]. 刘雪婷,白春雨,关伟军,马月辉. 生物技术通报. 2016(01)
[3]Acupuncture inhibits Notch1 and Hes1 protein expression in the basal ganglia of rats with cerebral hemorrhage[J]. Wei Zou,Qiu-xin Chen,Xiao-wei Sun,Qing-bin Chi,Hong-yu Kuang,Xue-ping Yu,Xiao-hong Dai. Neural Regeneration Research. 2015(03)
[4]2011年中国恶性肿瘤发病和死亡分析[J]. 陈万青,郑荣寿,曾红梅,邹小农,张思维,赫捷. 中国肿瘤. 2015(01)
[5]测序技术的研究进展[J]. 郝甜甜,李强飞,李国治,陈禹翰,邓卫东. 畜牧与饲料科学. 2014(03)
[6]脂肪干细胞研究进展与应用前景[J]. 周紫微,赵宇. 安徽医科大学学报. 2013(07)
[7]基于神经氨酸酶结构的流感病毒抑制剂的计算机辅助药物设计[J]. 刘磊,马英,王润玲,王树青,徐为人. 天津医科大学学报. 2013(03)
[8]药物基因组学的机遇与挑战[J]. 孙忠实. 中国医院用药评价与分析. 2012(05)
[9]小议2010国内外生命科学重要进展[J]. 孙明伟,高福. 遗传. 2011(02)
[10]Effects of cotransplantated Schwann cells and neural stem cells in a rat model of Alzheimer’s disease[J]. Yan Zhan1, 2, Dihui Ma2, Yu Zhang2 1Department of Neurology, Affiliated Hospital of Hebei University, Baoding 071000, Hebei Province, China 2Department of Neurology, First Clinical Hospital of Jilin University, Changchun 130021, Jilin Province, China. Neural Regeneration Research. 2011(04)
硕士论文
[1]依硫磷酸通过抑制细胞周期进程抗白血病作用的实验研究[D]. 张文英.中国人民解放军医学院 2012
[2]依硫磷酸抑制白血病细胞生物学活性、保护骨髓基质细胞及对化疗药物抗白血病作用影响的实验研究[D]. 刘璇.河北医科大学 2011
[3]ABCA1及MTP基因多态性对辛伐他汀调脂效应的影响[D]. 李颖.天津医科大学 2006
本文编号：3264138
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