基于细胞系-药物K近邻的抗癌药物敏感性预测

发布时间：2023-11-25 00:46

　　抗癌药物敏感性数据的缺失会对后续癌症数据分析产生重要影响.高通量测序技术为构建计算模型,有效预测抗癌药物敏感性提供了可能.依据已有的合理性假设:相似的细胞系对于目标药物具有相似的反应;相似的药物对于目标细胞系具有相似的反应,本文综合考虑了细胞系的基因表达和基因突变特征,给出细胞系相似性新的定义形式,结合药物相似性度量方法,提出了"细胞系-药物K近邻"计算模型,并将其成功应用于癌症细胞系百科全书(CCLE),得到的抗癌药物敏感性预测结果明显优于已有的经典模型.

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 引言
2 数据和数据处理
3 细胞系(药物)相似性度量方法
4 细胞系-药物K近邻(KNN)预测模型
5 预测结果分析与比较
    5.1 模型参数优化
    5.2 模型预测结果分析
    5.3 模型预测结果比较
6 结论



本文编号：3866932