抗菌肽LL-37序列分析与结构研究

发布时间：2017-08-21 08:41

  本文关键词：抗菌肽LL-37序列分析与结构研究

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【摘要】：目的分析抗菌肽LL-37的序列和结构特征,模拟其与棕榈酰转移酶PagP三维结构的结合,为后续研究抗菌机制提供理论和实验基础。方法从PDB数据库获得抗菌肽LL-37、棕榈酰转移酶PagP的序列和结构信息,使用SWISS-MODEL、NCBI在线工具和ANTHEPROT6.6.6、AutoDock4.2等软件对抗菌肽LL-37进行序列和结构分析。结果抗菌肽LL-37序列全长为37个氨基酸,含有75.7%α螺旋和24.3%无规则卷曲,抗菌肽LL-37片段与棕榈酰转移酶PagP形成8种对接模式,其配体效率在-2.2389~-1.6100Kcal/mol之间。结论对抗菌肽LL-37的序列和结构研究,为后续针对特异靶点设计多肽药物,开展结构与活性的研究提供了新的方向。
【作者单位】： 鄂东医疗集团黄石市中心医院湖北理工学院附属医院医学检验科肾脏疾病发生与干预湖北省重点实验室;
【关键词】： 抗菌肽LL- 生物信息学 棕榈酰转移酶PagP
【基金】：湖北省自然科学基金项目(2015CFB627) 黄石市科技计划项目(2013A077-4)
【分类号】：R915
【正文快照】： 抗菌肽LL-37广泛分布于人体上皮细胞和血液细胞中,其具有广谱抗菌活性,可以抗多种革兰阳性菌、革兰阴性菌和真菌,而且还可通过免疫调节、促进创伤修复、诱导血管生成等,是机体固有免疫防御系统的重要组成部分[1-2]。有报道指出革兰阴性菌细胞外膜的棕榈酰转移酶PagP可以从磷脂

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1 具英花;于爱鸣;解智慧;孙秀华;;葡萄糖胺抑制LL-37诱导的人脐带血管内皮细胞活化[J];解剖科学进展;2010年03期

2 张，

本文编号：711914