基于网络药理学研究中药归经与治疗疾病的关系

发布时间：2020-11-15 04:59

　　 目的:通过网络药理学的方法,以分子对接筛选2015版药典中中药的活性靶点,研究不同归经中药生物学基础,并通过已知的活性靶点与疾病的关系,挖掘不同归经中药的适应症。利用网络药理学初步探索归经理论的生物学基础,为归经理论的进一步研究提供理论基础。方法:本研究首先通过对2015版药典的整理,收集了药典中中药及其归经信息,并通过现有数据库和文献的收集整理,得到中药与化学成分数据;通过drug bank数据库收集人类蛋白靶点名称,并从PDB数据库上下载人类蛋白靶点结构,通过TTD网站呢收集蛋白靶点与疾病的关系。然后通过分子对接的方法,筛选中药的活性成分和潜在蛋白靶点。通过活性蛋白靶点挖掘中药的适应症,统计各归经中药在不同疾病中出现的频率,探索不同归经中药可能治疗的适应症,并寻找各归经中药的共同作用靶点,通过在Gene Ontology网站上富集分析,分析不同归经中药可能的生物学基础。结果:(1)通过对2015版《中国药典》的整理收集到615味中药的归经信息,通过数据库及文献整理收集到相关化学成分13144个,drugBank上收集到人类蛋白靶点名称936个,下载到蛋白结构198个,通过分子对接筛选出361味中药的1227个活性分子,86个活性蛋白靶点,筛选出了在归经中90%味中药都存在的蛋白靶点。其中肝经20个,肺经15个,胃经16个,脾经15个,肾经22个,心经23个,大肠经19个,膀胱经18个,胆经25个,小肠经23个,心包经39个,三焦经25个。(2)利用活性靶点和疾病的关系,统计中药在不同归经和疾病中的分布,大肠经中药在肌肉骨骼系统和结缔组织疾病、消化系统疾病、血液及造血器官疾病和涉及免疫机制的某些疾患中有较高的分布频率。肺经中药在眼和附器类疾病、呼吸系统疾病、精神和行为障碍疾病上有较高频率的分布。肝经中药在皮和皮肤下疾病、呼吸系统疾病、泌尿生殖系统疾病、内分泌、营养、代谢类疾病中有较高频率的分布。胆经中药在呼吸系统疾病、皮和皮肤下疾病、精神和行为障碍疾病上有较高频率分布。脾经中药在呼吸系统疾病皮和皮肤下疾病、精神和行为障碍疾病上有较高频率的分布。肾经中药在血液及造血器官疾病和涉及免疫机制的某些疾患、呼吸系统疾病、神经系统疾病上有较高分布。胃经中药在眼和附器类疾病、血液及造血器官疾病、皮和皮肤下的疾病有较高的频率分布。小肠经中药在皮和皮肤下疾病、呼吸系统疾病、精神和行为障碍疾病上有较高的频率分布。心经中药在精神和行为障碍疾病、眼和附器类疾病、呼吸系统疾病、血液及造血器官疾病和涉及免疫机制的某些疾患中有较高的分布频率。(3)通过基因富集分析,在分子功能上,肝经中药主要影响催化活性和抗氧化活性;心经中药主要影响结合功能、催化活性、及抗氧化活性,脾经中药主要影响催化活性和通道调节活性;肺经中药主要影响抗氧化活性和通道调节活性;肾经中药主要影响通道调节活性和催化活性;大肠经中药主要影响通道调节活性功能、催化活性功能和结合功能;膀胱经中药主要影响分子转导活性、催化活性和酶活性的调节;胃经中药主要影响通路调节活性和催化活性。在生物过程中,肝经中药主要影响生物体的代谢、信号、应激过程的调节;心经中药主要会影响生物体的细胞,信号、应激、多细胞过程的调节;脾经中药主要会影响生物体的细胞、信号、应激、定位过程的调节;肺经中药主要影响应激反应;肾经中药主要影响生物体信号、细胞、代谢、应激的调节过程;大肠经中药主要影响信号、细胞和应激的调节过程;膀胱经中药主要影响发育、细胞、应激、移动、细胞增殖、信号和多细胞生物过程;胃经中药主要影响通路调节活性和催化活性。(4)通过对归经与疾病共同靶点的频率分析发现:肝经中药蛋白主要分布在精神和行为障碍疾病,血液及造血器官疾病和涉及免疫机制的某些疾患和妊娠、分娩和产褥期相关疾病上;心经中药的蛋白靶点主要集中于精神和行为障碍疾病,某些传染病和寄生虫病和泌尿生殖系统疾病上;脾经中药的蛋白主要集中在内分泌、营养和代谢疾病,眼和附器疾病和耳和乳突疾病;肺经中药的蛋白主要集中在精神和行为障碍,呼吸系统疾病和循环系统疾病;肾经中药的蛋白主要集中在精神和行为障碍疾病,眼和附器疾病和泌尿生殖系统疾病;大肠经中药的蛋白主要集中在精神和行为障碍疾病,眼和附器疾病和泌尿生殖系统疾病;膀胱经中药的蛋白主要集中在精神和行为障碍疾病,妊娠、分娩和产褥期相关疾病,血液及造血器官疾病和涉及免疫机制的某些疾患;胃经中药的蛋白主要集中在精神和行为障碍疾病,妊娠、分娩和产褥期相关疾病,眼和附器疾病。
【学位单位】：北京中医药大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：R285
【部分图文】：

基于网络药理学研究中药归经与治疗疾病的关系??如图３．１．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６软件从Ｒｅａｃｔｏｍｅ数据库中导入１８８味肝经??中药的２０个共同活性靶点相互作用蛋白网络，获得了?４１９个肝经中药的潜在活??性靶点。??图３．１．１：肝经中药靶点网络图??＊＂＊Ｗ?■？?ｎｉｌ?Ｊｅｗｓ＇＂０＊??：：一??－一一？華－?鑛－＊麟??ｒ?：：二二?二二二二－：－??賴酬灌嫌酱賴偷騰??３．２心经中药－耙点网络??如图３．２．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６软件从Ｒｅａｃｔｏｍｅ数据库中导入７２味心经中??药的２３个共同活性靶点相互作用蛋白网络，获得了?４９１个心经中药的潜在活性??靶点。??图３．２．１?：心经中药靶点网络图??０＝ｚ?ｒ；＊－．?＾??＿?猶??—－??祕一?－－－??－ｗ??３．３脾经中药－耙点网络??如图３．３．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６软件Ｒｅａｃｔｏｍｅ数据库中导入脾经中药的１５??个共同活性靶点相互作用蛋白网络，获得了?４１３个肺经中药的潜在活性靶点。??３２??

基于网络药理学研宄中药归经与治疗疾病的关系??图３．３．１：脾经中药靶点网络图??ｎｍ??？＜＊？??峨?？？?？？??馨ｔ??？二?？々＿?？事？篇??髮－藝??？％．?＂＾ｍ０ｍ??＿細??麵??．?＿??Ｘ－Ｌ－??擊?難猜＿?賺聰?－??ｒ?嫌?＿?＊＊＊?－??＿雜德德—??３．４肺经中药－祀点网络??如图３．４．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６软件从Ｒｅａｃｔｏｍｅ数据库中导入１４４味肺经??中药的１５个共同活性靶点相互作用蛋白网络，获得了?３７９个肺经中药的潜在活??性靶点??图３．４．１：肺经中药－靶点网络图??＿ｒ＞ｒ－—－—－??＊２．?？麵?ｍｍｒｎｍｍｍ?一＊＂＜＂＞?＇?＇?ｗｍ

基于网络药理学研究中药归经与治疗疾病的关系??如图３．５．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６软件从Ｒｅａｃｔｏｍｅ数据库中导入９８味肾经中??药的１６个共同活性靶点相互作用蛋白网络，获得了?４５９个肾经中药的潜在活性??靶点。??图３．５．］：肾经中药靶点网络图??％？?．??：?＜?１??供?＊＊°?嫌??＿?一：??ｒｓ．＂＂?一??＊？?■??：Ｚ－Ｓｒ??－？＊？供?ｍ你?ｍｍ供?ｊｍｃ供供样?條??＊？?嫌？＂＇ｍ?＊＊??３．６胆经中药－耙点网络??如图３．６．１是利用Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ３．６软件从Ｒｅａｃｔｏｍｅ数据库中导入２０味胆经中??药的２５个共同活性靶点相互作用蛋白网络，获得了?５２２个胆经中药的潜在活性??靶点。??图３．６．１：胆经中药靶点网络图??．?ｒ？－？－?一?辦?＇??？??士—－參－：一＿＾
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本文编号：2884370