基于网络药理学探讨牛蒡子药理作用机制

发布时间：2021-11-22 04:04

　　目的:基于网络药理学方法探讨牛蒡子的药理作用机制。方法:本研究利用TCMSP、UniProt、CTD等数据库分析牛蒡子的化学成分、靶点、疾病,并利用DAVID数据库进行基因本体（gene ontology,GO）富集分析及基因组百科全书（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路分析,并采用Cytoscape软件绘图。结果:检索数据分析选出8个备选化合物、筛选出相关的50个靶蛋白,这些化合物及靶蛋白与354类疾病密切关联;GO富集分析显示最为密切的生物过程与细胞炎症、凋亡相关;KEGG富集分析显示最具显著性的通路与心血管、糖尿病、肿瘤有关。结论:本研究系统地探讨牛蒡子的主要成分最为相关的靶点及其作用机制,为临床研究提供了新的思路。 

【文章来源】：中医学报. 2020,35(09)

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

化合物-靶点蛋白网络关系图

检索与基因相关的疾病共有354种。度值靠前的基因为血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、白蛋白基因(albumin,ALB)、芳香烃受体(aryl hydrocarbon receptor,AHR)、BCL2、对氧磷酶1(paraoxonase1,PON1),度值分别为:71、67、54、51、50。在疾病中,度值靠前的是:前列腺肿瘤、乳腺肿瘤、糖尿病、高血压、胃肿瘤,分别为:20、18、12、12、11,见图2。2.4 构建蛋白互作网络(PPI)及hub蛋白的提取

将靶蛋白对应的基因导入String数据库,以互作分数(interaction score)≥0.4为参照,获取PPI网络,共获取50个节点,280条边,平均度值为11.2,见图3。用cytohubba插件获得hub蛋白,hub蛋白包括:ALB、VEGFA、MAPK8、AR、CASP3、ESR1、MYC、RELA、CTNNB1、AHR,见图4。图4 PPI网络中的hub蛋白

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3510897