基于高通量测序技术的胆管癌患者肠道菌群多样性分析

发布时间：2022-11-12 15:14

　　目的:肠道菌群在消化系统恶性肿瘤的发病机制中发挥着重要的作用,然而肠道菌群在胆管癌发病机制中的作用仍不明确,本研究通过16SrDNA高通量测序技术对胆管癌患者与健康人群的肠道菌群物种构成及多样性进行分析,分析胆管癌患者的肠道微生态变化,寻找胆管癌与肠道菌群的潜在关联,为探讨胆管癌的病因、发病机制等与肠道菌群的关系提供一定的理论基础。方法:选取2018年8月到2019年8月就诊于青岛大学附属青岛市市立医院消化内科、肝胆外科的胆管癌患者,共20例,选择同时期行健康查体的20例健康志愿者作为对照组,收集两组人群的粪便标本,提取DNA并进行PCR扩增,对其产物进行纯化、定量和均一化形成测序文库,基于Illumina Hi Seq2500测序平台,采用双末端测序的方法,构建小片段文库进行测序,通过对Reads拼接、过滤,OTUs聚类,进行物种注释及丰度分析,揭示两组人群肠道菌群的物种构成,并进行α多样性、β多样性及组间物种差异性分析等。结果:1.两组样本共得到2534941个有效序列数,其中胆管癌组共获得1272740个,对照组共获得1262201个。2.在门水平上,厚壁菌门（Firmicute... 

【文章页数】：58 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

胆管癌组（A）与对照组(B)OTU的数目

图240份样本在门水平物种分布柱状图

胆管癌组（A）与对照组(B)在门水平上相对丰度


本文编号：3706601