基于随机游走的疾病相关非编码RNA关联关系预测模型的研究

发布时间：2025-03-17 23:30

　　近年来,Lnc RNA(长非编码RNA)已被证明与许多严重种危害人类健康的严重疾病的发生和发展密切相关。然而,由于传统生物实验具有实验的高成本和高耗时等原因,大多数Lnc RNA与疾病的关联尚未被发现。因此,建立有效且合理的计算模型来预测Lnc RNA和疾病之间的潜在关联是非常紧迫和必要的。在生物信息学中,利用有效的预测模型来揭示疾病与Lnc RNA之间的潜在关联已经成为近些年的一个研究热点,并被很多研究人员所高度关注。本文先介绍了研究方向的背景知识和国内外研究现状,之后提出了两种基于随机游走的模型来预测Lnc RNA-疾病的潜在关联关系,具体内容如下:(1)首先,我们从数据库中得到了已知的Lnc RNA-疾病关联数据并进行预处理。(2)随后,我们提出了一种新的基于局部随机游走的预测模型LRWHLDA用于推断人类与疾病之间的潜在联系。在LRWHLDA中,我们首先通过整合疾病-疾病,Lnc RNA-Lnc RNA与已知的Lnc RNA-疾病这三种关联建立了一个新的异构网络,该异构网络包含了两类节点和三类链接,该异构网络的设置使得LRWHLDA可以在缺乏已知的Lnc RNA-疾病关联的情况下...

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第1章 绪论
    1.1 课题的研究背景和研究意义
    1.2 疾病与Lnc RNA关联研究的国内外现状
        1.2.1 疾病相关的关联因子预测问题的简要介绍
        1.2.2 疾病相关Lnc RNA的预测问题研究现状
    1.3 本文的主要研究工作
    1.4 本文的主体结构
第2章 基于异构网络预测潜在Lnc RNA-疾病的基础
    2.1 引言
    2.2 Lnc RNA与疾病相关性数据资源的收集和预处理
        2.2.1 Lnc RNA相关数据资源介绍
        2.2.2 疾病相关数据资源介绍
        2.2.3 已知疾病-Lnc RNA关联数据库资源的预处理
    2.3 利用网络中链接的拓扑特性计算节点相似度的常用方法
    2.4 小结
第3章 基于局部随机游走的潜在Lnc RNA与人类疾病的关联预测模型研究
    3.1 引言
    3.2 数据库资源的预处理
    3.3 Lnc RNA与人类疾病的异构网络的构建
        3.3.1 人类疾病之间的同类相似性
        3.3.2 Lnc RNA与 Lnc RNA的同类网络节点相似性
        3.3.3 用于局部性游走的异构网络的建立
    3.4 随机游走过程
    3.5 模型性能评估
    3.6 对比实验
    3.7 实际案例分析
    3.8 小结
第4章 用于预测Lnc RNA-疾病关联的目标收敛集游走模型
    4.1 引言
    4.2 数据库资源的预处理
    4.3 整合的疾病相似性和整合的Lnc RNA相似性
    4.4 计算模型TCSRWRLD的构造
        4.4.1 异构网络的构造
        4.4.2 TCS(目标收敛集)的建立
        4.4.3 在Lnc RNA-疾病异构网络上的随机游走
    4.5 预测结果的交叉验证
    4.6 对比实验
    4.7 案例分析
    4.8 小结
第5章 工作总结与展望
    5.1 本文工作总结
    5.2 本文展望
参考文献
致谢
附录 A 在学期间发表的学术论文与研究成果



本文编号：4035644