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水稻组蛋白去乙酰化酶OsHDA706和OsHDA714的功能研究

发布时间:2020-07-30 07:21
【摘要】:表观遗传学的主要研究内容包括DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑因子等。组蛋白修饰是指组蛋白N末端氨基酸残基上的各种修饰,如甲基化、乙酰化和磷酸化等。这些修饰能够通过影响染色质状态,从而调控基因的表达,是表观遗传调控的重要机制之一。组蛋白乙酰化是研究比较多的一种修饰,组蛋白乙酰化的添加和去除分别是由组蛋白乙酰转移酶(Histone acetyltransferases,HATs)和组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDACs)调控。组蛋白去乙酰化酶可分为三个亚家族:RPD3/HDA1家族、HD2家族和SIR2家族。本实验室前期研究表明,水稻SIR2家族组蛋白去乙酰化酶OsSRT1通过对糖酵解途径中甘油醛-3-磷酸脱氢酶(OsGAPDH1)去乙酰化,进而抑制其转录活性,并且OsSRT1还抑制了OsGAPDH1蛋白在细胞核内的积累,从而调控糖酵解代谢,最终影响水稻植株体内的能量代谢。为了研究其它组蛋白去乙酰化酶是否与能量代谢相关,我们以RPD3/HDAI家族中两个组蛋白去乙酰化酶OsHDA706和OsHDA714为对象,通过反向遗传学、生物信息学和分子生物学等方法来研究OsHDA706和OsHDA714的生物学功能及其参与的代谢途径,试图阐明其在水稻生长发育、基因表达以及代谢调控中的作用机理。本研究的主要结果如下:1.OsHDA706和OsHDA 714的表达谱分析发现这两个基因在水稻的成熟叶、剑叶以及茎杆等组织部位表达量较高,而在愈伤、胚乳和幼穗等组织中的表达量低。通过基因表达节律性分析发现OsHDA706有一定的昼夜节律性,而OsHDA714没有昼夜节律性。2.利用CRISPR/Cas9技术创建了OsHDA 706和OsHAD714突变体材料。表型考察发现hda706的种子表现出提前成熟的表型,超量表达植株(OA706)表现出植株变矮和分蘖减少的表型;而OsHDA714的突变体植株(hda714)表现出种子结实率变低,植株株型更紧凑的表型,而超量表达植株(OX714)未发现明显表型。3.亚细胞定位软件预测OsHDA706和OsHDA714蛋白位于细胞质。通过原生质体瞬时转化和烟草瞬时表达实验证实OsHDA706定位于在细胞质中,OsHDA714同时定位于细胞质和内质网中。这说明水稻中组蛋白去乙酰化酶的核质分布不具有细胞特异性,并且为代谢酶乙酰化调控代谢酶的酶活机制提供了证据。4.通过对野生型水稻材料进行不同的胁迫处理,检测OsHDA706和OsHDA714的表达水平,结果显示在300 mM NaCl和热胁迫(42℃)处理下,OsHDA706的表达上升,而在冷胁迫(4)处理时,OsHDA706的表达受到了抑制。而OsHDA 714不受 NaCl(300 mM)、热胁迫(42℃)、PEG6000(20%)和 Mannitol(200 mM)等逆境胁迫的诱导表达。5.对野生型水稻材料进行能量胁迫处理,检测OsHDA706和OsHDA714的表达水平,结果显示除2%葡萄糖(Glucose)处理外,在暗处理和缺氮培养液处理下,OsHDA706的表达水平均上升。在2%Glucose和缺氮的能量胁迫处理下,OsHDA714表达量变化不大,但暗处理9h后OsHDA 714的表达受到了抑制。通过hda706和hda714突变体植株进一步验证了上述结果。因此说明OsHDA706的表达受碳(黑暗)和氮(完全缺氮)能量相关处理的诱导。6.通过酵母双杂交实验,分别筛选到两个与OsHDA706和OsHDA714产生互作的蛋白——烯酰辅酶A水合酶(ECH)和葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)。此外,通过亚细胞定位的结果表明OsHDA706、OsHDA714分别与互作蛋白ECH和G6PDH共定位。
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S511;Q943.2
【图文】:

基因组序列,引物,示意图,阳性克隆


CRISPR-P(Lei邋et邋al邋2014;邋Liu邋et邋al邋2017)。将目的基因的基因组序列或编码区序列逡逑复制到网站首页,执行搜索功能,在靠近基因编码区序列的5'端,选择可能的逡逑脱靶位点最少且Score的分值最高的点作为靶位点,并设计引物(图2A)。以逡逑U3启动子构建的T-A克隆质粒为模板和引物OsU3-F/HDA706CRP-R、逡逑HDA706CRP-F+OsU3-R、OsU3-F/HDA714CRP-R、HDA714CRP-F+OsU3-R邋进行逡逑PCR反应。将对应基因的PCR产物切胶纯化回收,两两混合作为模板(图2B),逡逑使用引物OsU3-F/OsU3-R进行下一轮PCR反应。构建T-A克隆的中间载体,最逡逑后筛选含有811bp外源片段的正确阳性克隆。再使用没wl酶切克隆质粒,最后逡逑连接到用你》1酶切开的pCXUN-Cas9载体上,筛选含有外源片段的阳性克隆。逡逑14逡逑

结构域,去乙酰化


(^//几47收却仅有1个外显子(表1)。对本研宄中RPD3/HDA1超家族基因的逡逑结构域进行分析,结果显示a5//ZX47你和都包含有一个去乙酰化的逡逑结构域(图3)。逡逑OSHDA706邋逦1逦逦:]—逡逑OsHDA714邋- ̄ ̄I逦ZH-逡逑I逦 ̄1邋HDAC邋domain邋■邋Low邋complexity逡逑图3.邋OsHDA706和OsHDA714的结构域逡逑Fig.邋3邋The邋domains邋of邋OsHDA706邋and邋OsHDA714逡逑22逡逑

茎杆,叶鞘,基因芯片,花药


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本文编号:2775220

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