水稻中胚轴和胚芽鞘长度的全基因组关联分析

发布时间：2020-10-10 13:49

　　 机械化旱直播技术节约成本和劳动力,但是由于播种深度的差别以及其它影响,影响了出苗率和保苗的问题。长的中胚轴有利于水稻在旱直播的条件下整齐快速的出苗,目前关于具有长中胚轴特性的水稻资源报道较少,因此在旱直播的条件下影响出苗率从而影响直播稻的产量。本文旨在为培育具有长中胚轴特性的水稻材料提供理论依据,希望可以推动水稻旱直播的推广和发展。目前关于水稻中胚轴延长的遗传位点及基因还不明确,本试验材料采用平均测序深度14×,源于89个国家和地区,遗传变异丰富的3K水稻种质资源中的1569份(包括籼稻1064份,粳稻455份),选取1538份材料进行水培养和250份材料沙培养(其中219份材料重复),于两种环境下进行中胚轴长度的测量,通过对表型数据处理后得出的主要结果如下:1)定位到50个影响水稻深土直播的中胚轴QTL位点和47个胚芽鞘QTL位点,其中位于1、7、9号染色体的5个位点为已知位点,已知位点qML1是在沙培环境下检测到,已知位点qML7-8、qML7-12、qML7-14、qML9为水培环境下检测到。2)按照总样本、籼稻和粳稻进行全基因组关联分析,结果表明,在籼稻、粳稻和总样本中分别定位到32、15、38个位点,其中有5个位点在两个群体中可以定位到,(籼/总:qCL2-1/qCL2、qCL8-1/qCL8-1、qCL8-2/qCL8-2、qML6/qML6、qML11/qML11),有5个位点为已知位点qML7-8、qML7-11、qML7-14、qML9、qML1-1。
【学位单位】：安徽农业大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：S511
【部分图文】：

图 1 基于候选基因的关联分析技术路线Fig. 1 The framework of association analysis based on candidate-gene testing注：引自关联分析在作物种质资源分子评价中的应用Application of Association Analysis Molecular Evluation of Crop Germplasm Resources但是通过全基因组关联分析，使用较大数量的 SNP，可以快速较为准确我们所需性状的位点。通过分子标记与辅助育种相结合，提高育种效率，缩

图 2 基于全基因组关联分技术路线图Fig.2 Technical framework for genome-work association studies in plants引自关联分析在作物种质资源分子评价中的应用Application of Association Analysis Molecular Evluation of Crop Germplasm Resources.2 鉴定到的 QTL 和基因情况曹立勇等人通过杂交和标记，结果显示中胚轴长度在低温和适温两种条件下相

情况（图 3、图 4）。筛选到 1569 份发芽率大于 90%的用于后续试验（其中，重复材料 219 份），来自 5 大洲的 70 多个国家（图 345 份，美洲 53 份，大洋洲 6 份，欧洲 31 份，未知来。其中大洋洲 8 份，非洲 57 份，美洲 30 份，欧洲 15 份份（大陆 22 份，台湾 3 份）。籼稻 115 份，粳稻 27 份
【参考文献】

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本文编号：2835283