Analysis of Agronomic Characters and Genetic Diversity of SS
发布时间:2020-12-22 06:10
藜麦为觅科藜属一年生草本双子叶植物,具有耐低温、耐干旱贫瘠以及耐盐碱的特性。作物种质资源是育种工作的基础,评价藜麦种质资源多样性对藜麦种质资源的收集、管理、利用及藜麦核心种质的开发具有重要意义,本研究对藜麦种质资源农艺性状和SSR分子标记的遗传多样性分析,主要结果如下:(1)对50份藜麦材料的10项农艺性状的多样性研究结果表明,藜麦不同品种间各农艺性状的差异较大,变异系数最大的为产量。农艺性状的聚类分析,将50份藜麦种质分为4类。对藜麦材料的数量性状主成分分析表明穗重、穗粒重、千粒重及籽粒直径是藜麦种质农艺性状变异的主要因素。(2)筛选出的12对SSR引物,对24份藜麦种质的基因组进行多态性扩增,共检测到193个等位基因位点,平均每对引物产生15.8个等位基因位点,12对SSR引物的Nei’s(1973)遗传多样性(H)平均值为0.3091。Shannon’s信息指数平均值为0.4840。说明供试材料的SSR多态性丰富。聚类分析将供试材料可分为5类,供试材料平均遗传距离(GS)为0.3640。(3)藜麦农艺性状与SSR分子标记多样性比较表明,农艺性状相近的藜麦材料其遗传距离不一定较近,...
【文章来源】:内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】:40 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
CTAB法提取DNA经0.8%琼脂糖凝胶电泳(Marker为DL2000)
具有显著的差异,又含有距离较近的材料,根据植物学与形态学性状进行选择取的材料应具有代表性,不能选择亲缘关系较近的材料,亲缘关系较近的材料成引物筛选时丢失有价值的引物序列。所选材料应具有的一定共性和个性。另面我们所选取的筛选引物的材料数目不能过少,所选材料数目过少则看不出引间的差异,不利于引物的筛选,而我们选择筛选引物材料数目过多时,会增加要的劳动量,并且前期准备所需要时间增加,对试验也没有实质性的帮助。因选引物所选用的样品材料应从质(既有差异,又有共性)和量(3~6 份)两方虑[42]。利用 4 份材料对 30 对 SSR 引物进行了 PCR 扩增,如图 3 所示(其它胶板见)引物筛选的 PAGE 检测胶板可看出 10 对引物对 4 份材料扩增片段长度一般0bp~300bp 之间,多态性扩增带数为 13 条,谱带清晰且重复稳定性较好,最据 30 对 SSR 引物的 PAGE 检测结果选择出 12 对引物并对供试的 24 份藜麦材行 PCR 扩增反应。
图 4 引物 1 和 2 扩增 24 个样本的 PAGE 检测电泳图Fig4 PAGE electrophoresis of amplifying 24 samples of primers 1 and 2筛选的 12 对 SSR 引物在供试的 24 份材料中共得出总等位基因位点数为 19其中等位基因位点数为 190 个,多态位点百分率高达 98.45%,片段扩增长度一 120bp~300bp。每对引物的扩增效率存在差异,12 对引物可检测出的等位基因范围是 5~27 个,平均每对引物检测到 15.8 个等位基因位点,多态位点百分率是 71.43%~100%,平均多态位点率为 5.72%。引物编号为 P3 与 P19 的引物检到的等位基因位点数最多为 27 个,其次是编号为 P23、P2、P25 的引物序列检到的等位基因位点数为 26、17、15 其中引物 P1 检测到的等位基因位点数最少 个。
【参考文献】:
期刊论文
[1]小麦种质资源农艺性状变异及其遗传多样性分析[J]. 张帅,庞玉辉,王征宏,王黎明,陈春燕,曾占奎,王春平. 作物杂志. 2018(02)
[2]中早熟藜麦品种条藜1号的选育[J]. 沈宝云,李志龙,郭谋子,胡静,张俊莲,张世辉,王海龙,康小华,陈霞珍,马绍丽,袁海丽. 中国种业. 2017(10)
[3]藜麦生物学特性及应用[J]. 杨发荣,黄杰,魏玉明,李敏权,何学功,郑健. 草业科学. 2017(03)
[4]藜麦味噌酿造工艺及其酱粉的研制[J]. 刘晓艳,杨国力. 中国调味品. 2017(02)
[5]西瓜起源与演化研究进展[J]. 张慧娜,齐秀玲,申晓萍,巫桂芬. 中国农学通报. 2016(35)
[6]藜麦研究现状与发展前景[J]. 李娜娜,裴艳婷,宫永超,蒲艳艳,刘保民,辛富刚,刘世华,丁汉凤. 山东农业科学. 2016(10)
[7]藜麦功能成分研究及利用[J]. 雷洁琼. 青海畜牧兽医杂志. 2016(03)
[8]青海藜麦的发展现状与发展中存在的问题[J]. 刘洋,闫殿海,张玉清,党斌,姚有华,毛玉金,张宏亮,迟德钊. 青海农林科技. 2015(04)
[9]藜麦研究进展及发展前景[J]. 顾娴,黄杰,魏玉明,金茜,杨发荣. 中国农学通报. 2015(30)
[10]不同高粱种质资源形态多样性及其形态标记聚类分析[J]. 王洋,张明生,李祥栋,任明见,高翔. 贵州农业科学. 2014(06)
博士论文
[1]燕麦种质资源遗传多样性研究[D]. 齐冰洁.内蒙古农业大学 2009
[2]大豆种质资源遗传多样性研究[D]. 周恩远.东北农业大学 2009
[3]珍珠黄杨遗传多样性及其资源保护与利用[D]. 黄焱.南京林业大学 2008
硕士论文
[1]内蒙古益稷生物科技有限公司藜麦系列产品市场营销策略研究[D]. 李晓峰.内蒙古大学 2017
[2]青檀种质资源遗传多样性分析及诱变育种[D]. 朱翠翠.山东农业大学 2016
[3]利用关联分析挖掘甘蓝型油菜千粒重优异等位变异[D]. 冯旭东.贵州大学 2016
[4]黄枝油杉遗传多样性、种子萌发和光合特性研究[D]. 谢伟玲.广西师范大学 2016
[5]阴山南北麓耕地质量与影响因素关系评价研究[D]. 庞欣超.内蒙古师范大学 2011
[6]利用DNA分子标记研究梨、樱桃种质资源遗传多样性[D]. 路娟.南京农业大学 2010
[7]燕麦种质农艺性状、耐盐和AFLP分子标记的遗传多样性分析[D]. 张向前.内蒙古农业大学 2010
[8]番茄无离层基因的分子标记研究及种质资源的筛选[D]. 王超.东北农业大学 2010
[9]番茄Mi-1基因SNP标记开发及种质资源的筛选[D]. 李亚玲.东北农业大学 2010
[10]川渝地区野生鹅观草种质遗传多样性研究[D]. 肖苏.四川农业大学 2008
本文编号:2931279
【文章来源】:内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】:40 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
CTAB法提取DNA经0.8%琼脂糖凝胶电泳(Marker为DL2000)
具有显著的差异,又含有距离较近的材料,根据植物学与形态学性状进行选择取的材料应具有代表性,不能选择亲缘关系较近的材料,亲缘关系较近的材料成引物筛选时丢失有价值的引物序列。所选材料应具有的一定共性和个性。另面我们所选取的筛选引物的材料数目不能过少,所选材料数目过少则看不出引间的差异,不利于引物的筛选,而我们选择筛选引物材料数目过多时,会增加要的劳动量,并且前期准备所需要时间增加,对试验也没有实质性的帮助。因选引物所选用的样品材料应从质(既有差异,又有共性)和量(3~6 份)两方虑[42]。利用 4 份材料对 30 对 SSR 引物进行了 PCR 扩增,如图 3 所示(其它胶板见)引物筛选的 PAGE 检测胶板可看出 10 对引物对 4 份材料扩增片段长度一般0bp~300bp 之间,多态性扩增带数为 13 条,谱带清晰且重复稳定性较好,最据 30 对 SSR 引物的 PAGE 检测结果选择出 12 对引物并对供试的 24 份藜麦材行 PCR 扩增反应。
图 4 引物 1 和 2 扩增 24 个样本的 PAGE 检测电泳图Fig4 PAGE electrophoresis of amplifying 24 samples of primers 1 and 2筛选的 12 对 SSR 引物在供试的 24 份材料中共得出总等位基因位点数为 19其中等位基因位点数为 190 个,多态位点百分率高达 98.45%,片段扩增长度一 120bp~300bp。每对引物的扩增效率存在差异,12 对引物可检测出的等位基因范围是 5~27 个,平均每对引物检测到 15.8 个等位基因位点,多态位点百分率是 71.43%~100%,平均多态位点率为 5.72%。引物编号为 P3 与 P19 的引物检到的等位基因位点数最多为 27 个,其次是编号为 P23、P2、P25 的引物序列检到的等位基因位点数为 26、17、15 其中引物 P1 检测到的等位基因位点数最少 个。
【参考文献】:
期刊论文
[1]小麦种质资源农艺性状变异及其遗传多样性分析[J]. 张帅,庞玉辉,王征宏,王黎明,陈春燕,曾占奎,王春平. 作物杂志. 2018(02)
[2]中早熟藜麦品种条藜1号的选育[J]. 沈宝云,李志龙,郭谋子,胡静,张俊莲,张世辉,王海龙,康小华,陈霞珍,马绍丽,袁海丽. 中国种业. 2017(10)
[3]藜麦生物学特性及应用[J]. 杨发荣,黄杰,魏玉明,李敏权,何学功,郑健. 草业科学. 2017(03)
[4]藜麦味噌酿造工艺及其酱粉的研制[J]. 刘晓艳,杨国力. 中国调味品. 2017(02)
[5]西瓜起源与演化研究进展[J]. 张慧娜,齐秀玲,申晓萍,巫桂芬. 中国农学通报. 2016(35)
[6]藜麦研究现状与发展前景[J]. 李娜娜,裴艳婷,宫永超,蒲艳艳,刘保民,辛富刚,刘世华,丁汉凤. 山东农业科学. 2016(10)
[7]藜麦功能成分研究及利用[J]. 雷洁琼. 青海畜牧兽医杂志. 2016(03)
[8]青海藜麦的发展现状与发展中存在的问题[J]. 刘洋,闫殿海,张玉清,党斌,姚有华,毛玉金,张宏亮,迟德钊. 青海农林科技. 2015(04)
[9]藜麦研究进展及发展前景[J]. 顾娴,黄杰,魏玉明,金茜,杨发荣. 中国农学通报. 2015(30)
[10]不同高粱种质资源形态多样性及其形态标记聚类分析[J]. 王洋,张明生,李祥栋,任明见,高翔. 贵州农业科学. 2014(06)
博士论文
[1]燕麦种质资源遗传多样性研究[D]. 齐冰洁.内蒙古农业大学 2009
[2]大豆种质资源遗传多样性研究[D]. 周恩远.东北农业大学 2009
[3]珍珠黄杨遗传多样性及其资源保护与利用[D]. 黄焱.南京林业大学 2008
硕士论文
[1]内蒙古益稷生物科技有限公司藜麦系列产品市场营销策略研究[D]. 李晓峰.内蒙古大学 2017
[2]青檀种质资源遗传多样性分析及诱变育种[D]. 朱翠翠.山东农业大学 2016
[3]利用关联分析挖掘甘蓝型油菜千粒重优异等位变异[D]. 冯旭东.贵州大学 2016
[4]黄枝油杉遗传多样性、种子萌发和光合特性研究[D]. 谢伟玲.广西师范大学 2016
[5]阴山南北麓耕地质量与影响因素关系评价研究[D]. 庞欣超.内蒙古师范大学 2011
[6]利用DNA分子标记研究梨、樱桃种质资源遗传多样性[D]. 路娟.南京农业大学 2010
[7]燕麦种质农艺性状、耐盐和AFLP分子标记的遗传多样性分析[D]. 张向前.内蒙古农业大学 2010
[8]番茄无离层基因的分子标记研究及种质资源的筛选[D]. 王超.东北农业大学 2010
[9]番茄Mi-1基因SNP标记开发及种质资源的筛选[D]. 李亚玲.东北农业大学 2010
[10]川渝地区野生鹅观草种质遗传多样性研究[D]. 肖苏.四川农业大学 2008
本文编号:2931279
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