小麦株高相关基因TaDwarf11的克隆与功能分析
发布时间:2020-12-25 00:42
我国是世界上小麦生产与消费大国,小麦生产在国家粮食安全方面占据着举足轻重的地位。在当今环境下,提高小麦产量是保障我国粮食安全的一个重要途径。小麦株高是影响小麦产量的一个重要因素,株高相关基因的发掘与研究,对小麦育种有着重要的意义。本研究以中国春为材料,使用同源克隆方法,依据水稻P450蛋白家族基因Dwarf11序列,在小麦中克隆得到了TaDwarf11基因,并对其进行了时空表达、标记开发、基因定位及功能分析等研究得到了以下重要结论:1.依据基因数据库比对得到序列设计引物,在小麦中国春的gDNA与cDNA中进行了PCR片段扩增与测序验证,得到了完整的TaDwarf11序列,其cDNA全长为1428bp,gDNA全长为3607bp,含有9个长度分别为215bp、325bp、154bp、235bp、89bp、75bp、107bp、125bp和102bp的外显子,以及8个长度分别为365bp、241bp、157bp、91bp、281bp、189bp、470bp和386bp的内含子。所编码的蛋白质含有475个氨基酸,存在一个P450结构域。2.该基因在小麦根、茎、叶、幼穗中均有表达,但相对表达量...
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:49 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
TaDwarf11基因结构
图 2-2 TaDwarf11 蛋白序列与 Dwarf11 蛋白序列比对Fig. 2-2 Protein sequence alignment of TaDwarf11 and Dwarf11Dwarf11149TaDwarf11150EEEERRLLFFQQCCSSYYPPRRPPIIHHGGIILLGGKKSSSSMMLLVVVVLLGGEEDDHHKKRRLLRRNNLLAALLAALLVVTTSSTTKKLLKKPPSSYYDwarf11199TaDwarf11194LLGGDDIIEEKRIIAALLHHIIVVGGSSWWHHGGKKSGK.D.K.G.M.V.NGVSIIATFFCCEEEEAARRKKFFAAFFSSVVIIVVKKQQVVLLGGLLSSDwarf11249TaDwarf11244PPEEEEPPVVTTAAMMIILLEEDDFFLLATFFMMKKGGLLIISSFFPPLLYRIIPPGGTTPPYYAAKKAAVVQQAARRAERRIISSSSTTVVKKGGIIIIDwarf11299TaDwarf11294EEEERRRRNKAAGDSCSCNKKRGDDDFFLLDNVVLLLLSSSTNDEELLSSDDEEEEKKVVSSFFVVLLDDSSLLLLGGGGYYEETTTTSSLLLMIISSMMDwarf11349TaDwarf11344VVVVYYFFLLGGQQSS
图 2-4 P450 蛋白系统发育分析Fig. 2-4 Phylogenetic analysis of P450 proteinsDwarf11 基因 SNP 位点的发现国春、天麦 989 等不同小麦品种中扩增 TaDwarf11 序列后,通过比显子 138bp 处存在 T-C 碱基差异(图 2-5)。通过在多个小麦品种中现该 SNP 位点的存在具有普遍性。中 国 春50天 麦 98950AATTGGGGTTGGGGGGGGGGTTGGGGGGCCGGAATTCCTTTTGGTTGGCCTTGGGGCCTTGGCCTTCCCCGGGGCCGGAATTCCCCTTGGCCTTCCGGCC中 国 春100天 麦 989100CCTTTTGGCCTTCCCCTTGGAACCTTCCTTGGGGTTGGCCTTGGAAGGCCCCAACCTTTTCCCCTTGGCCCCTTTTTTGGCCTTCCCCTTCCAAAACCCC中 国 春150天 麦 989150CCCCAAAAGGGGCCTTCCCCGGAAGGGGGGGGCCAAGGCCTTTTTTGGGGAATTGGGGCCCCCCCCTTTTGGTTCTGGGGCCGGAAGGAACCCCCCTTCC中 国 春200天 麦 989200AAGGGGTTTTCCCCTTCCAACCCCCCCCTTCCAACCGGCCCCTTCCCCAAAACCAACCGGCCTTGGGGGGTTA
本文编号:2936615
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:49 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
TaDwarf11基因结构
图 2-2 TaDwarf11 蛋白序列与 Dwarf11 蛋白序列比对Fig. 2-2 Protein sequence alignment of TaDwarf11 and Dwarf11Dwarf11149TaDwarf11150EEEERRLLFFQQCCSSYYPPRRPPIIHHGGIILLGGKKSSSSMMLLVVVVLLGGEEDDHHKKRRLLRRNNLLAALLAALLVVTTSSTTKKLLKKPPSSYYDwarf11199TaDwarf11194LLGGDDIIEEKRIIAALLHHIIVVGGSSWWHHGGKKSGK.D.K.G.M.V.NGVSIIATFFCCEEEEAARRKKFFAAFFSSVVIIVVKKQQVVLLGGLLSSDwarf11249TaDwarf11244PPEEEEPPVVTTAAMMIILLEEDDFFLLATFFMMKKGGLLIISSFFPPLLYRIIPPGGTTPPYYAAKKAAVVQQAARRAERRIISSSSTTVVKKGGIIIIDwarf11299TaDwarf11294EEEERRRRNKAAGDSCSCNKKRGDDDFFLLDNVVLLLLSSSTNDEELLSSDDEEEEKKVVSSFFVVLLDDSSLLLLGGGGYYEETTTTSSLLLMIISSMMDwarf11349TaDwarf11344VVVVYYFFLLGGQQSS
图 2-4 P450 蛋白系统发育分析Fig. 2-4 Phylogenetic analysis of P450 proteinsDwarf11 基因 SNP 位点的发现国春、天麦 989 等不同小麦品种中扩增 TaDwarf11 序列后,通过比显子 138bp 处存在 T-C 碱基差异(图 2-5)。通过在多个小麦品种中现该 SNP 位点的存在具有普遍性。中 国 春50天 麦 98950AATTGGGGTTGGGGGGGGGGTTGGGGGGCCGGAATTCCTTTTGGTTGGCCTTGGGGCCTTGGCCTTCCCCGGGGCCGGAATTCCCCTTGGCCTTCCGGCC中 国 春100天 麦 989100CCTTTTGGCCTTCCCCTTGGAACCTTCCTTGGGGTTGGCCTTGGAAGGCCCCAACCTTTTCCCCTTGGCCCCTTTTTTGGCCTTCCCCTTCCAAAACCCC中 国 春150天 麦 989150CCCCAAAAGGGGCCTTCCCCGGAAGGGGGGGGCCAAGGCCTTTTTTGGGGAATTGGGGCCCCCCCCTTTTGGTTCTGGGGCCGGAAGGAACCCCCCTTCC中 国 春200天 麦 989200AAGGGGTTTTCCCCTTCCAACCCCCCCCTTCCAACCGGCCCCTTCCCCAAAACCAACCGGCCTTGGGGGGTTA
本文编号:2936615
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