小麦祖先种A组/D组与水稻基因组比较分析

发布时间：2020-12-26 18:55

　　为深入研究小麦祖先种乌拉尔图小麦、粗山羊草的遗传基础、分子结构、进化关系,试验将水稻基因组作为参考基因组进行Blast全基因组比较分析,筛选出8 259条长度4 kb以上的水稻同源核苷酸序列用circos软件和mauve软件作图。结果表明,小麦祖先种和水稻中存在大量同源核苷酸序列的同线性和共线性排列;祖先种与水稻基因共线性分析表明,3个物种间存在染色体上的共线性,共线性比例达80%以上,并用基因共线性关系对小麦祖先种染色体进化进行了阐述。 

【文章来源】：山西农业科学. 2019年06期

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 核苷酸序列全局比对
        1.2.2 核苷酸序列局部比对
        1.2.3基因比对
2 结果与分析
    2.1 核苷酸序列全局比对
    2.2 核苷酸序列局部比对
    2.3 基因比对分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦基因组研究现状与展望[J]. 傅向东,刘倩,李振声,张爱民,凌宏清,童依平,刘志勇.  中国科学院院刊. 2018(09)
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[3]无油樟与葡萄、拟南芥、水稻基因组的多倍化及共线性分析[J]. 张岚,袁敏,王振怡,潘玉欣.  江苏农业科学. 2018(08)
[4]人工合成小麦农艺性状与SSR标记的关联分析（英文）[J]. 张思妮,王震,赵丹阳,夏雪娇,翟晓光,张拓,杨二航,丁勤,马翎健.  农业生物技术学报. 2018(04)
[5]小麦基因组学研究进展[J]. 刘淑娟,朱艳,张晓军,李欣,郭慧娟,畅志坚,乔麟轶.  山西农业科学. 2018(03)
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[7]小麦相关功能基因的全基因组电子定位及基因注释[J]. 王长彪,韩斌,刘江,崔婷,任永康,赵兴华,董艳辉,李亚丽,唐朝晖.  山西农业科学. 2016(07)
[8]小麦及其近缘种基因组测序研究进展与发展趋势[J]. 凌宏清.  麦类作物学报. 2016(04)
[9]小麦和水稻auxin基因家族的生物信息学比较分析[J]. 张俊红,孟成生,张彩英,史峥,王笑颖,李爱丽,马峙英.  华北农学报. 2009(06)

博士论文
[1]水稻基因组序列分析及比较基因组研究[D]. 张玉军.中国科学院研究生院（上海生命科学研究院） 2003



本文编号：2940279