大麦LBD基因家族分析及功能验证
发布时间:2021-01-30 21:39
大麦种植历史悠久,是世界第四大禾谷类作物,可作为食用、饲用、啤用和保健食品的原材料。长江流域是我国大麦的主产地之一,该地区降雨量多,严重影响大麦产量与品质。耐湿大麦品种受到湿害胁迫,产生大量不定根来应对湿害胁迫对植株生长的影响。已有研究表明,LBD转录因子在调控植物侧生器官发育等方面起重要作用。本文在全基因组水平分析了大麦LBD基因家族成员,通过构建植物LBD基因的系统进化树,筛选并克隆到与大麦不定根发育相关的LBD基因,利用转基因方法进行基因功能验证,以期为大麦耐湿性品种改良及分子设计育种奠定基础。主要研究结果如下:1.在全基因组水平,大麦7条染色体共鉴定出24个LBD基因。根据基因编码蛋白的结构差异,24个基因分为两类,其中19个基因为Class Ⅰ,5个基因为Class Ⅱ。系统进化树分析结果显示,HvLBD19基因与调控植物不定根发育的相关基因OsARL1、ZwRTCL和ZmRTCS具有较高的同源性。RT-PCR分析显示,湿害胁迫后大麦根节和不定根中HvLBD19基因表达量显著高于对照。基因瞬时表达结果显示,HvLBD19蛋白位于细胞核内。2.克隆HvLBD19基因全长编码区序...
【文章来源】:扬州大学江苏省
【文章页数】:61 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.2//vZ5D基因的染色体定位??Fig.?2.2.?Distribution?on?chromosomes?of?HvLBD?gene?family??3.2系统进化树和基因结构分析??
在拟南芥中,LBD蛋白N端有一个保守的LOB结构域,而这个保守结构域包含C和??GAS?blocks两个区段。在本研究中,序列比对结果表明,大麦Z/vZ万D基因在L0B结构域??也包含C和GAS?block两个区段(图2.4A)。在大麦打vZ5D基因中,所有的HvLBD蛋白??序列中均检测到一个保守的CX2CX6CX3C锌指结构域,而仅有8个I类蛋白中发现??LX6LX3LX6L亮氨酸拉链样结构域(图2.4B)。??h>-lbdi?fift??:■?r-r?ii?Jir.77.7tb?^?\?!-v?^?.?i^M:m??Hv13D2?V!?Pin....?,V\%?i?Y.?.p:i^.?*^11?!?:?^ifviicvc.?:?lAF^rm??HVL8D3??A.'VT.I?IKmm??HvLBlM?vn??tF?T.^'i!-??HvLHDS?.?;?r?l?.?:■?>,C?v.::铽:、.:,??i{vLar??v??f??'??^?.?r-f.-?ib??x?.?%■??hvlboio?塌心響丫識?<^v?.f.wn???^??Hvmmi?r|'v嚳:雜鄕:.....?m:-?ten广,?t??hvlbdi6?mm-.ijm?■?■??<?^vi??HvLBI^!2?VF?ifrfFr?W?K.W-'A?.?Wt.?U?.^1?^?.^V?,?:?<?..?U\-f>.?M:I??HvI.BDl.1?fifeip;||^?,:?VI?if;'ACE?争雜“说撕>*C
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【参考文献】:
期刊论文
[1]淹水胁迫对黄瓜幼苗生长及不定根解剖结构的影响[J]. 于斌,朱进,周国林,黎紫仪,彭玉全. 北方园艺. 2018(03)
[2]淹水胁迫对水稻植株抗氧化酶变化的影响[J]. 黄万勇,卢成,郑世宗,温进化. 排灌机械工程学报. 2017(11)
[3]淹水对滴水观音抗氧化系统和丙二醛的影响[J]. 夏红霞,朱启红. 三峡生态环境监测. 2016(03)
[4]甘蓝型油菜湿害相关基因BnLDH-1的克隆和表达分析[J]. 吴金海,周玉堂,谢伶俐,张学昆,许本波. 河南农业科学. 2016(03)
[5]水涝胁迫下芝麻内源激素及表型响应[J]. 江诗洋,黎冬华,张艳欣,魏鑫,张秀荣,王林海. 中国油料作物学报. 2015(05)
[6]红豆杉TcLBDs基因的克隆与表达分析[J]. 李艳艳,杨艳芳,王俊青,王帅,刘洪伟,邱德有. 林业科学. 2015(10)
[7]成熟期水盐胁迫对番茄产量和贮藏期品质的影响[J]. 陆红飞,郭相平,甄博,王振昌,于晓飞. 灌溉排水学报. 2015(06)
[8]白茅解剖结构和屏障结构特征研究[J]. 杨朝东,李守峰,邓仕明,姚兰,袁龙义,张霞. 草业学报. 2015(03)
[9]苗期湿害胁迫下不同基因型芝麻的反应差异研究[J]. 潘华,周红英,孙建,颜廷献,饶月亮,颜小文,乐美旺. 江西农业学报. 2015(01)
[10]水分胁迫及钾肥对樱桃番茄产量和品质的影响[J]. 李建设,周筠,高艳明. 东北农业大学学报. 2013(10)
博士论文
[1]基于全基因组的玉米LBD转录因子家族分析及密码子使用模式分析[D]. 张岳民.山东农业大学 2014
[2]水稻高亲和硝酸盐转运蛋白基因OsNRT2.3a/b生物学功能分析[D]. 唐仲.南京农业大学 2012
[3]大豆耐淹性鉴定及其形态解剖特征、遗传与QTL定位[D]. 王芳.南京农业大学 2007
硕士论文
[1]甘蓝型油菜苗期耐湿相关性状的全基因组关联分析[D]. 荆蓉蓉.西南大学 2017
[2]生长素对淹水胁迫下盐地碱蓬不定根产生的影响[D]. 贾玉辉.山东师范大学 2014
[3]分蘖期淹涝胁迫对水稻农艺和品质性状及生理特性的影响[D]. 赵启辉.江西农业大学 2013
[4]水稻生长过程对涝害的响应与恢复模型研究[D]. 张建华.福建农林大学 2013
[5]甘蓝型油菜耐湿差异性表达基因的筛选及分析[D]. 谭筱玉.华中农业大学 2012
[6]淹水胁迫下microRNA介导的玉米不定根生长及抗氧化机制研究[D]. 张丹凤.河北农业大学 2009
本文编号:3009631
【文章来源】:扬州大学江苏省
【文章页数】:61 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.2//vZ5D基因的染色体定位??Fig.?2.2.?Distribution?on?chromosomes?of?HvLBD?gene?family??3.2系统进化树和基因结构分析??
在拟南芥中,LBD蛋白N端有一个保守的LOB结构域,而这个保守结构域包含C和??GAS?blocks两个区段。在本研究中,序列比对结果表明,大麦Z/vZ万D基因在L0B结构域??也包含C和GAS?block两个区段(图2.4A)。在大麦打vZ5D基因中,所有的HvLBD蛋白??序列中均检测到一个保守的CX2CX6CX3C锌指结构域,而仅有8个I类蛋白中发现??LX6LX3LX6L亮氨酸拉链样结构域(图2.4B)。??h>-lbdi?fift??:■?r-r?ii?Jir.77.7tb?^?\?!-v?^?.?i^M:m??Hv13D2?V!?Pin....?,V\%?i?Y.?.p:i^.?*^11?!?:?^ifviicvc.?:?lAF^rm??HVL8D3??A.'VT.I?IKmm??HvLBlM?vn??tF?T.^'i!-??HvLHDS?.?;?r?l?.?:■?>,C?v.::铽:、.:,??i{vLar??v??f??'??^?.?r-f.-?ib??x?.?%■??hvlboio?塌心響丫識?<^v?.f.wn???^??Hvmmi?r|'v嚳:雜鄕:.....?m:-?ten广,?t??hvlbdi6?mm-.ijm?■?■??<?^vi??HvLBI^!2?VF?ifrfFr?W?K.W-'A?.?Wt.?U?.^1?^?.^V?,?:?<?..?U\-f>.?M:I??HvI.BDl.1?fifeip;||^?,:?VI?if;'ACE?争雜“说撕>*C
?_??t??-____?,:丨丨丨?*?m?exon?-—mtrwi??图2.3?基因的进化树和基因结构分析??Fig.?2.3.?The?phylogenetic?tree?and?gene?structure?analysis?of?the?HvLBD?genes??3.3大麦LBD蛋白的序列比对和保守结构域分析??在拟南芥中,LBD蛋白N端有一个保守的LOB结构域,而这个保守结构域包含C和??GAS?blocks两个区段。在本研究中,序列比对结果表明,大麦Z/vZ万D基因在L0B结构域??也包含C和GAS?block两个区段(图2.4A)。在大麦打vZ5D基因中,所有的HvLBD蛋白??序列中均检测到一个保守的CX2CX6CX3C锌指结构域,而仅有8个I类蛋白中发现??LX6LX3LX6L亮氨酸拉链样结构域(图2.4B)。??h>-lbdi?fift??:■?r-r?ii?Jir.77.7tb?^?\?!-v?^?.?i^M:m??Hv13D2?V!?Pin....?,V\%?i?Y.?.p:i^.?*^11?!?:?^ifviicvc.?:?lAF^rm??HVL8D3??A.'VT.I?IKmm??HvLBlM?vn??tF?T.^'i!-??HvLHDS?.?;?r?l?.?:■?>,C?v.::铽:、.:,??i{vLar??v??f??'??^?.?r-f.-?ib??x?.?%■??hvlboio?塌心響丫識?<^v?.f.wn???^??Hvmmi?r|'v嚳:雜鄕:.....?m:-?ten广
【参考文献】:
期刊论文
[1]淹水胁迫对黄瓜幼苗生长及不定根解剖结构的影响[J]. 于斌,朱进,周国林,黎紫仪,彭玉全. 北方园艺. 2018(03)
[2]淹水胁迫对水稻植株抗氧化酶变化的影响[J]. 黄万勇,卢成,郑世宗,温进化. 排灌机械工程学报. 2017(11)
[3]淹水对滴水观音抗氧化系统和丙二醛的影响[J]. 夏红霞,朱启红. 三峡生态环境监测. 2016(03)
[4]甘蓝型油菜湿害相关基因BnLDH-1的克隆和表达分析[J]. 吴金海,周玉堂,谢伶俐,张学昆,许本波. 河南农业科学. 2016(03)
[5]水涝胁迫下芝麻内源激素及表型响应[J]. 江诗洋,黎冬华,张艳欣,魏鑫,张秀荣,王林海. 中国油料作物学报. 2015(05)
[6]红豆杉TcLBDs基因的克隆与表达分析[J]. 李艳艳,杨艳芳,王俊青,王帅,刘洪伟,邱德有. 林业科学. 2015(10)
[7]成熟期水盐胁迫对番茄产量和贮藏期品质的影响[J]. 陆红飞,郭相平,甄博,王振昌,于晓飞. 灌溉排水学报. 2015(06)
[8]白茅解剖结构和屏障结构特征研究[J]. 杨朝东,李守峰,邓仕明,姚兰,袁龙义,张霞. 草业学报. 2015(03)
[9]苗期湿害胁迫下不同基因型芝麻的反应差异研究[J]. 潘华,周红英,孙建,颜廷献,饶月亮,颜小文,乐美旺. 江西农业学报. 2015(01)
[10]水分胁迫及钾肥对樱桃番茄产量和品质的影响[J]. 李建设,周筠,高艳明. 东北农业大学学报. 2013(10)
博士论文
[1]基于全基因组的玉米LBD转录因子家族分析及密码子使用模式分析[D]. 张岳民.山东农业大学 2014
[2]水稻高亲和硝酸盐转运蛋白基因OsNRT2.3a/b生物学功能分析[D]. 唐仲.南京农业大学 2012
[3]大豆耐淹性鉴定及其形态解剖特征、遗传与QTL定位[D]. 王芳.南京农业大学 2007
硕士论文
[1]甘蓝型油菜苗期耐湿相关性状的全基因组关联分析[D]. 荆蓉蓉.西南大学 2017
[2]生长素对淹水胁迫下盐地碱蓬不定根产生的影响[D]. 贾玉辉.山东师范大学 2014
[3]分蘖期淹涝胁迫对水稻农艺和品质性状及生理特性的影响[D]. 赵启辉.江西农业大学 2013
[4]水稻生长过程对涝害的响应与恢复模型研究[D]. 张建华.福建农林大学 2013
[5]甘蓝型油菜耐湿差异性表达基因的筛选及分析[D]. 谭筱玉.华中农业大学 2012
[6]淹水胁迫下microRNA介导的玉米不定根生长及抗氧化机制研究[D]. 张丹凤.河北农业大学 2009
本文编号:3009631
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