西藏野生大麦耐酸/铝相关microRNA的鉴定及功能分析
发布时间：2021-01-31 03:53
铝毒是限制酸性土壤中作物产量的重要因素之一。种植耐酸铝品种是提高酸性土壤中作物产量的最经济有效的方法。西藏野生大麦拥有丰富的遗传多样性,是研究耐性机理的重要种质资源。目前关于从生理和候选基因角度揭示大麦耐酸铝性的报道较多,而大麦耐酸铝胁迫相关microRNA（miRNA）鉴定工作较少。本研究采用高通量测序技术,分析比较了大麦根系miRNA表达响应酸/铝胁迫的基因型差异,以期为解析大麦miRNA介导的酸铝胁迫调控网络提供基础。主要研究结果如下:1.采用西藏野生大麦耐酸/铝基因型XZ16、酸/铝敏感基因型XZ61和国际公认耐酸/铝栽培大麦品种Dayton为材料,水培酸铝胁迫（50 μM A1,pH4.3,24 h）试验,以pH6.0及pH4.3无铝基本培养液为对照CK1和CK2,使用高通量测序从9个根文库（XZ16-CK1、XZ16-CK2、XZ61-CK1、XZ16-Al、XZ61-CK2、XZ61-Al、Dayton-CK1、Dayton-CK2、Dayton-Al）共获得216404167条clean reads。统计分析不同处理下野生大麦的小RNA的序列长度分布,结果发现小RNA的...
【文章来源】：浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：118 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１植物ｍｉＲＮＡ的合成途径（Ｂａｒｔｅｌ．?２００４）??Ｆｉｇ．?１－１?Ｐａｔｈｗａｙｓ?ｆｏｒ?ｔｈｅ?ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｏｆ?ｐｌａｎｔ?ｍｉＲＮＡｓ?（Ｂａｒｔｅｌ，?２００４）??’’?－
表３－３大麦中小ＲＮＡ分类注释??Ｔａｂｌｅ?３－３?Ｓｍａｌｌ?ＲＮＡ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｂａｒｌｅｙ??基因型?Ｇｅｎｏｔｙｐｅ?ＸＺ１６?ＸＺ６１?Ｄａｙｔｏｎ??处理?Ｔｒｅａｔｍｅｎｔ?ＣＫ１?ＣＫ２?Ａ１?ＣＫ１?ＣＫ２?Ａ１?ＣＫ１?ＣＫ２Ｃｏｕｎｔ－ａｌｌ?２６０９６３９８?２５１１６０７２?２４６０１４７６?２２８２４９０３?２３８６４１７８?２４２１９２４３?２３９５２３８５?２５６６１１８２?２３ｍｉＲＮＡ?１９５７５２７?１６０５８０４?５３１７９３?９５０１６４?１３０３７５８?６７４１５７?１４７６２６７?１４１７３９７?６ｓｉＲＮＡ?８２９７５?８９９９１?９０４２６?６９０４９?６６７８２?７６７９６?７８９２３?８１６２２?９ｓｎｏＲＮＡ?１４４６７?９９３７?１９７３８?１５４８５?１２００８?２６７４３?８０２８?１４０２９?１ｔＲＮＡ?２１７４?１２４９?１３５２．５?１９０８．５?１７０１?８３２９?１０６２．５?１８０２?ｓｎＲＮＡ?１４１６５?１２９５３?３１２９１．５?１６８３８?１１０６０．５?２２３６５?１５２９３．５?１５２５９．５?１５ｒＲＮＡ?５２８６３７?４５９９９９?４３７９４８．５?４８８３１７?５１５５１９?６４０３５５?３１５６３１．５?４１２０５３．５?４ｓＲＮＡ?２３５０５?２１１１４?９６１４?１７３４３?１６５４３?１９６７０?１２１５８?２２６５６?１ｕｎｍａｐｐｅｄ?６８８６４５７?６０８５８６８．５?６４０６８２０．５?５６１９５７５?５５０７０６３．５?６０３８１２１．５?６６９６６５２?７６５６２６４?５９１ｒｅ
图３－４大麦根中保守ｍｉＲＮＡ和ｎｏｖｅｌ?ｍｉＲＮＡ的长度分布??Ｆｉｇ．３－４?Ｌｅｎｇｔｈ?ｂａｓｅｄ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｃｏｎｓｅｎｅｄ?ａｎｄ?ｎｏｖｅｌ?ｍｉＲＮＡｓ?ｉｎ?ｂａｒｌｅｙ?ｒｏｏｔｓ??３０??
【参考文献】：
期刊论文
[1]NO对酸铝胁迫下香樟根系形态及叶绿素荧光特性研究[J]. 李茹,韦洁,李桃祯,胡厚臻,陈鑫,王艺锦,王凌晖,滕维超. 西北林学院学报. 2017(01)
[2]低pH和铝胁迫对胡椒根细胞存活和有机酸分泌的影响[J]. 祖超,杨建峰,李志刚,王灿,鱼欢,邬华松. 热带作物学报. 2016(12)
[3]酸铝胁迫对芒萁生长、光合特性和叶绿素荧光参数的影响[J]. 刘强,龙婉婉,柳正葳,吉康宁. 河南农业科学. 2016(11)
[4]菊芋对酸铝复合胁迫的生理响应[J]. 曹林,马丽,吴玉环,李学良,郭怡,章艺,郦枫,徐根娣,刘鹏. 生态环境学报. 2016(02)
[5]植物miRNA的研究方法概述[J]. 易小娅,杨瑞瑞,曾幼玲. 植物生理学报. 2015(04)
[6]植物miR168的研究进展[J]. 韩璐,栾雨时. 基因组学与应用生物学. 2014(02)
[7]利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因[J]. 南文智,吴嫚,于霁雯,范术丽,黄双领,李兴丽,张红卫,张金发,喻树迅. 棉花学报. 2013(04)
[8]第三代测序技术及其应用[J]. 张得芳,马秋月,尹佟明,夏涛. 中国生物工程杂志. 2013(05)
[9]植物microRNAs在植物发育和非生物胁迫响应中的作用[J]. 鲁晓燕,岳英,樊新民,马兵钢,赵宝龙,张虎平. 生物技术通报. 2011(04)
[10]铝胁迫对蓼科植物生长和光合、蒸腾特性的影响[J]. 刘强,尹丽,龙婉婉,肖宜安. 广西植物. 2011(02)
博士论文
[1]茶树耐铝的基因型差异及机理研究[D]. 于翠平.浙江大学 2014
[2]萝卜铅（Pb）胁迫响应的分子机制研究[D]. 王燕.南京农业大学 2014
[3]青藏高原一年生野生大麦耐铝毒机制的研究[D]. 戴华鑫.浙江大学 2013
[4]水稻镉胁迫应答相关microRNA的分离与功能研究[D]. 丁艳菲.浙江大学 2012
[5]铝胁迫下蓼属植物和饭豆根系有机酸分泌特性研究[D]. 尤江峰.浙江大学 2006
硕士论文
[1]低夜温及ABA对番茄叶片中miRNAs及其靶基因表达的影响[D]. 王孝.沈阳农业大学 2017
[2]野生和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析[D]. 马燕明.北京农学院 2016
[3]马尾松铝胁迫生理响应机制[D]. 纪雨薇.西南大学 2016
[4]酸、铝、钙、磷对土壤铝形态和杉木幼苗生长及营养吸收的影响[D]. 崔朋辉.福建农林大学 2016
[5]miR528在水稻应答砷胁迫中的功能研究[D]. 朱乐毅.浙江农林大学 2014
[6]酸铝复合胁迫对杉木幼苗生理及矿质元素吸收的影响[D]. 刘翠.福建农林大学 2013
[7]西藏野生大麦耐旱相关基因筛选及耐性生理机理的研究[D]. 单武年.浙江大学 2013
[8]银杏和叶籽银杏microRNA的鉴定与分析[D]. 付茵茵.山东农业大学 2012
[9]盐胁迫条件下不同耐盐棉花miRNA差异表达研究[D]. 李春贺.山东农业大学 2009
本文编号：3010164
【文章来源】：浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：118 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１植物ｍｉＲＮＡ的合成途径（Ｂａｒｔｅｌ．?２００４）??Ｆｉｇ．?１－１?Ｐａｔｈｗａｙｓ?ｆｏｒ?ｔｈｅ?ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｏｆ?ｐｌａｎｔ?ｍｉＲＮＡｓ?（Ｂａｒｔｅｌ，?２００４）??’’?－
表３－３大麦中小ＲＮＡ分类注释??Ｔａｂｌｅ?３－３?Ｓｍａｌｌ?ＲＮＡ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｂａｒｌｅｙ??基因型?Ｇｅｎｏｔｙｐｅ?ＸＺ１６?ＸＺ６１?Ｄａｙｔｏｎ??处理?Ｔｒｅａｔｍｅｎｔ?ＣＫ１?ＣＫ２?Ａ１?ＣＫ１?ＣＫ２?Ａ１?ＣＫ１?ＣＫ２Ｃｏｕｎｔ－ａｌｌ?２６０９６３９８?２５１１６０７２?２４６０１４７６?２２８２４９０３?２３８６４１７８?２４２１９２４３?２３９５２３８５?２５６６１１８２?２３ｍｉＲＮＡ?１９５７５２７?１６０５８０４?５３１７９３?９５０１６４?１３０３７５８?６７４１５７?１４７６２６７?１４１７３９７?６ｓｉＲＮＡ?８２９７５?８９９９１?９０４２６?６９０４９?６６７８２?７６７９６?７８９２３?８１６２２?９ｓｎｏＲＮＡ?１４４６７?９９３７?１９７３８?１５４８５?１２００８?２６７４３?８０２８?１４０２９?１ｔＲＮＡ?２１７４?１２４９?１３５２．５?１９０８．５?１７０１?８３２９?１０６２．５?１８０２?ｓｎＲＮＡ?１４１６５?１２９５３?３１２９１．５?１６８３８?１１０６０．５?２２３６５?１５２９３．５?１５２５９．５?１５ｒＲＮＡ?５２８６３７?４５９９９９?４３７９４８．５?４８８３１７?５１５５１９?６４０３５５?３１５６３１．５?４１２０５３．５?４ｓＲＮＡ?２３５０５?２１１１４?９６１４?１７３４３?１６５４３?１９６７０?１２１５８?２２６５６?１ｕｎｍａｐｐｅｄ?６８８６４５７?６０８５８６８．５?６４０６８２０．５?５６１９５７５?５５０７０６３．５?６０３８１２１．５?６６９６６５２?７６５６２６４?５９１ｒｅ
图３－４大麦根中保守ｍｉＲＮＡ和ｎｏｖｅｌ?ｍｉＲＮＡ的长度分布??Ｆｉｇ．３－４?Ｌｅｎｇｔｈ?ｂａｓｅｄ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｃｏｎｓｅｎｅｄ?ａｎｄ?ｎｏｖｅｌ?ｍｉＲＮＡｓ?ｉｎ?ｂａｒｌｅｙ?ｒｏｏｔｓ??３０??
【参考文献】：
期刊论文
[1]NO对酸铝胁迫下香樟根系形态及叶绿素荧光特性研究[J]. 李茹,韦洁,李桃祯,胡厚臻,陈鑫,王艺锦,王凌晖,滕维超. 西北林学院学报. 2017(01)
[2]低pH和铝胁迫对胡椒根细胞存活和有机酸分泌的影响[J]. 祖超,杨建峰,李志刚,王灿,鱼欢,邬华松. 热带作物学报. 2016(12)
[3]酸铝胁迫对芒萁生长、光合特性和叶绿素荧光参数的影响[J]. 刘强,龙婉婉,柳正葳,吉康宁. 河南农业科学. 2016(11)
[4]菊芋对酸铝复合胁迫的生理响应[J]. 曹林,马丽,吴玉环,李学良,郭怡,章艺,郦枫,徐根娣,刘鹏. 生态环境学报. 2016(02)
[5]植物miRNA的研究方法概述[J]. 易小娅,杨瑞瑞,曾幼玲. 植物生理学报. 2015(04)
[6]植物miR168的研究进展[J]. 韩璐,栾雨时. 基因组学与应用生物学. 2014(02)
[7]利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因[J]. 南文智,吴嫚,于霁雯,范术丽,黄双领,李兴丽,张红卫,张金发,喻树迅. 棉花学报. 2013(04)
[8]第三代测序技术及其应用[J]. 张得芳,马秋月,尹佟明,夏涛. 中国生物工程杂志. 2013(05)
[9]植物microRNAs在植物发育和非生物胁迫响应中的作用[J]. 鲁晓燕,岳英,樊新民,马兵钢,赵宝龙,张虎平. 生物技术通报. 2011(04)
[10]铝胁迫对蓼科植物生长和光合、蒸腾特性的影响[J]. 刘强,尹丽,龙婉婉,肖宜安. 广西植物. 2011(02)
博士论文
[1]茶树耐铝的基因型差异及机理研究[D]. 于翠平.浙江大学 2014
[2]萝卜铅（Pb）胁迫响应的分子机制研究[D]. 王燕.南京农业大学 2014
[3]青藏高原一年生野生大麦耐铝毒机制的研究[D]. 戴华鑫.浙江大学 2013
[4]水稻镉胁迫应答相关microRNA的分离与功能研究[D]. 丁艳菲.浙江大学 2012
[5]铝胁迫下蓼属植物和饭豆根系有机酸分泌特性研究[D]. 尤江峰.浙江大学 2006
硕士论文
[1]低夜温及ABA对番茄叶片中miRNAs及其靶基因表达的影响[D]. 王孝.沈阳农业大学 2017
[2]野生和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析[D]. 马燕明.北京农学院 2016
[3]马尾松铝胁迫生理响应机制[D]. 纪雨薇.西南大学 2016
[4]酸、铝、钙、磷对土壤铝形态和杉木幼苗生长及营养吸收的影响[D]. 崔朋辉.福建农林大学 2016
[5]miR528在水稻应答砷胁迫中的功能研究[D]. 朱乐毅.浙江农林大学 2014
[6]酸铝复合胁迫对杉木幼苗生理及矿质元素吸收的影响[D]. 刘翠.福建农林大学 2013
[7]西藏野生大麦耐旱相关基因筛选及耐性生理机理的研究[D]. 单武年.浙江大学 2013
[8]银杏和叶籽银杏microRNA的鉴定与分析[D]. 付茵茵.山东农业大学 2012
[9]盐胁迫条件下不同耐盐棉花miRNA差异表达研究[D]. 李春贺.山东农业大学 2009
本文编号：3010164
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3010164.html
最近更新
教材专著
