中棉所63苗期杂种优势的转录组学分析

发布时间：2021-02-24 08:37

　　杂种优势通常是指杂种后代在遗传上优于其亲本的现象,是传统育种中重要的育种应用工具。强优势杂交棉中棉所63与母本中9053及父本sGK9708相比具有优良的生产性状。本研究以中棉所63、母本中9053及父本sGK9708三叶期植株为材料,首先统计并比较一批随机三叶期中棉所63与亲本之间的整株个体鲜重、干重以及根部鲜重、干重的数据;其次通过高通量测序方法检测三种材料在转录水平上的差异,进一步发掘mRNA及lncRNA转录水平与杂种优势的关系。基于杂种优势的上位假说,本研究对中棉所63中表达量显著高于亲本或显著低于亲本的基因进一步进行GO分类和KEGG通路分析,以解释有哪些基因在三叶期参与了杂种优势的形成;最后我通过荧光定量PCR的方法进一步验证了45个在杂种优势形成过程中显著变化的基因。研究结果表明:在三叶期,中棉所63整株个体的鲜重、干重与亲本相比均优于亲本,同时根系鲜重、干重也优于亲本,可见中棉所63在苗期植株整体及根系发育均较亲本发达。高通量测序数据表明:中棉所63与父本之间显著上调的差异表达转录本（包含lncRNA及mRNA）有13117个,显著下调的差异表达转录本有10674个;... 

【文章来源】：河南大学河南省

【文章页数】：85 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

样本三叶期采样照片

图 3-4 总 RNA 电泳检测结果9708 总 RNA 样品；泳道 4-6 为中 9053 总 RNA 样品；泳道 7-9 是中棉所样品；M 是 DNAMarker DM2000。Figure 3-4 Total RNA electrophoresis results完整性检测NA 文库测序之前，需要利用 Agilent 2100 进行 RNA 样品的完本的一个 RNA 样品为例，检测结果如图 3-5 所示。结果显示标 RIN 值（RNA Integrity Number）为 8.7，达到 RNA 测序的

图 3-4 总 RNA 电泳检测结果 总 RNA 样品；泳道 4-6 为中 9053 总 RNA 样品；泳道 7-9 是中样品；M 是 DNAMarker DM2000。Figure 3-4 Total RNA electrophoresis results性检测 文库测序之前，需要利用 Agilent 2100 进行 RNA 样品一个 RNA 样品为例，检测结果如图 3-5 所示。结果IN 值（RNA Integrity Number）为 8.7，达到 RNA 测

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]棉花多基因组的比对图谱构建与功能进化分析[D]. 杨南山.华北理工大学 2017



本文编号：3049108