5-甲基胞嘧啶DNA糖基化酶的表达对大麦种子醇溶蛋白组成的影响
发布时间:2021-03-30 03:41
大麦(Hordeum vulgare,2n=14),自花授粉,禾本科、大麦属,是我国主要种植作物之一。与小麦的营养成分近似,但谷蛋白含量较少,β-葡聚糖和可溶性纤维含量略高,在我国主要分布在长江流域、黄河流域和青藏高原。大麦籽粒醇溶蛋白作为种子胚乳中主要的贮藏蛋白质之一,其含量不仅对啤酒酿造、饲料加工产生一定的影响,甚至也能成为乳糜泻疾病的重要抗原来源。本研究选用三个国外品种:来自美国的Steptoe和Morex以及来自澳大利亚的Clipper作为实验材料。利用大麦醇溶蛋白启动子区域具有不同的甲基化机制差异,构建5-甲基胞嘧啶DNA糖基化酶(DME)的沉默子,并转化大麦,主要得到以下结论:1.以大麦Morex品种为材料,扩增高分子量醇溶蛋白(D-hordein)的启动子Hor3-1,通过使用不同保真性能的酶,最终确定有4个碱基差异的位点是由品种特异性造成的。之后,对得到的序列进行CpG岛的预测,得出该序列的GC频率介于0.41.2之间,绝大部分位点高于阈值0.6,而CpG岛的GC含量介于40%50%,低于显著水平。通过对顺式调控元件的预测得出...
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:59 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
经典位点特异性DNA维持甲基化模型的示意图(JeltschAandJurkowskaRZ2014)
第一章 文献综述 基化的基因转化细胞后发现它们的转录是失活的 (S rensen M B et al. 1996)。rensen 等人 (1992) 通过基因组测序显示,lys3a 可能在大麦胚乳的早期分化作用,因为通过对 B 组分启动子的检测,缺少或抑制相关基因启动子与反相互作用的特定位点不能引起甲基化差异。虽然胚乳 Z 蛋白的基因启动子和白启动子的序列几乎没有同源性,但 lys3a 突变体中它们的 mRNA 水平都发明 Lys3 基因产物参与在转录激活之前。因此可以假设,大麦醇溶蛋白基因中的甲基化导致其维持在无活性状态,这种无活性状态可能形成无转录活性然后通过去甲基化过程,Lys3 产物将基因从无活性染色质构象转变为活性染从而导致基因转录得以实现。实际上,通过用 5-氮杂胞苷处理似乎可以将染与核酸酶结合更敏感的构象,同时转录的激活也依赖于有反式作用因子的存
1-4 植物中几种小 RNA 介导的转基因沉默路径的对比 (Wesley S V et al. 200.1-4 Comparison of several small RNA-mediated transgene silencing pathways in p非编码基因转录后,通过 DCL1 处理成 21 个核苷酸的 miRNA。DCL2,DCL3 和 DCL4 分pRNAi,VIGS) 或由 RDR 家族的成员从 ssRNA 产生的长 dsRNA(共抑制,VIGS) 加工成 siRNA。21 个核苷酸的 siRNA 和 miRNA 指导 AGO1 切割靶转录物,而 24 个核苷酸的 siRN修饰。每个 DCL 蛋白与特异性 dsRNA 结合蛋白 DRB (DCL1 的 HYL1,其他未显示) 相互re transcribed from non-coding genes and processed by DCL1 to 21-nucleotide miRNAs. Long dd repeat constructs (hpRNAi, VIGS) or generated from ssRNA by a member of the RDR family (rocessed by DCL2, DCL3 or DCL4 to 22-, 24- or 21-nucleotide siRNAs, respectively. 21-nucls guide cleavage of target transcripts by AGO1, while 24-nucleotide siRNAs guide A modification. Each DCL protein interacts with a specific dsRNA binding protein, DRB (HYown).遗传转化应用叶植物包括大量的农业重要作物,如玉米、小麦、水稻和大麦等,通良这些作物的农艺性状已成为研究的热点之一。将外源基因片段通过主基因组并稳定表达的转基因技术已经日益多样化,这种技术的不断
【参考文献】:
期刊论文
[1]我国大麦价格波动特征及其影响因素分析[J]. 贾小玲,孙致陆,李先德. 中国农业资源与区划. 2018(01)
[2]RNAi技术在作物中的应用及安全评价研究[J]. 焦悦,付伟,翟勇. 作物杂志. 2018(01)
[3]青稞B-hordein基因对小麦面粉加工特性的影响[J]. 马兴芹,余水洋,龙海,梁俊俊,潘志芬,邓光兵,余懋群. 麦类作物学报. 2014(06)
[4]利用RNAi技术沉默大麦B-Hordein基因的研究[J]. 李静雯,张正英,李淑洁. 麦类作物学报. 2014(02)
[5]拟南芥的印记基因和印记表达调控[J]. 张红宇,徐培洲,杨华,吴先军. 遗传. 2010(07)
[6]DNA去甲基化与基因激活过程[J]. 柯跃斌,夏菠,梁明婵,梅树江. 癌变.畸变.突变. 2010(02)
[7]植物Dof转录因子及其生物学功能[J]. 徐慧妮,王康,李昆志. 生物技术通报. 2010(01)
[8]生物信息学在基因组研究中的应用[J]. 陈力学. 国外医学.临床生物化学与检验学分册. 2003(06)
[9]RNA干涉与基因沉默[J]. 汤富酬,薛友纺. 遗传. 2001(02)
博士论文
[1]类大麦属物种种子贮藏蛋白基因的分子克隆[D]. 郭志富.四川农业大学 2008
[2]青稞B组醇溶蛋白基因与上游调控区的克隆及基因表达[D]. 韩兆雪.中国科学院研究生院(成都生物研究所) 2007
硕士论文
[1]以色列野生大麦自然群体与世界不同国家栽培大麦品种的遗传多样性分析[D]. 高永钢.西北农林科技大学 2010
[2]酿造大麦醇溶蛋白生化特性研究[D]. 徐凯.大连工业大学 2008
本文编号:3108789
【文章来源】:西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:59 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
经典位点特异性DNA维持甲基化模型的示意图(JeltschAandJurkowskaRZ2014)
第一章 文献综述 基化的基因转化细胞后发现它们的转录是失活的 (S rensen M B et al. 1996)。rensen 等人 (1992) 通过基因组测序显示,lys3a 可能在大麦胚乳的早期分化作用,因为通过对 B 组分启动子的检测,缺少或抑制相关基因启动子与反相互作用的特定位点不能引起甲基化差异。虽然胚乳 Z 蛋白的基因启动子和白启动子的序列几乎没有同源性,但 lys3a 突变体中它们的 mRNA 水平都发明 Lys3 基因产物参与在转录激活之前。因此可以假设,大麦醇溶蛋白基因中的甲基化导致其维持在无活性状态,这种无活性状态可能形成无转录活性然后通过去甲基化过程,Lys3 产物将基因从无活性染色质构象转变为活性染从而导致基因转录得以实现。实际上,通过用 5-氮杂胞苷处理似乎可以将染与核酸酶结合更敏感的构象,同时转录的激活也依赖于有反式作用因子的存
1-4 植物中几种小 RNA 介导的转基因沉默路径的对比 (Wesley S V et al. 200.1-4 Comparison of several small RNA-mediated transgene silencing pathways in p非编码基因转录后,通过 DCL1 处理成 21 个核苷酸的 miRNA。DCL2,DCL3 和 DCL4 分pRNAi,VIGS) 或由 RDR 家族的成员从 ssRNA 产生的长 dsRNA(共抑制,VIGS) 加工成 siRNA。21 个核苷酸的 siRNA 和 miRNA 指导 AGO1 切割靶转录物,而 24 个核苷酸的 siRN修饰。每个 DCL 蛋白与特异性 dsRNA 结合蛋白 DRB (DCL1 的 HYL1,其他未显示) 相互re transcribed from non-coding genes and processed by DCL1 to 21-nucleotide miRNAs. Long dd repeat constructs (hpRNAi, VIGS) or generated from ssRNA by a member of the RDR family (rocessed by DCL2, DCL3 or DCL4 to 22-, 24- or 21-nucleotide siRNAs, respectively. 21-nucls guide cleavage of target transcripts by AGO1, while 24-nucleotide siRNAs guide A modification. Each DCL protein interacts with a specific dsRNA binding protein, DRB (HYown).遗传转化应用叶植物包括大量的农业重要作物,如玉米、小麦、水稻和大麦等,通良这些作物的农艺性状已成为研究的热点之一。将外源基因片段通过主基因组并稳定表达的转基因技术已经日益多样化,这种技术的不断
【参考文献】:
期刊论文
[1]我国大麦价格波动特征及其影响因素分析[J]. 贾小玲,孙致陆,李先德. 中国农业资源与区划. 2018(01)
[2]RNAi技术在作物中的应用及安全评价研究[J]. 焦悦,付伟,翟勇. 作物杂志. 2018(01)
[3]青稞B-hordein基因对小麦面粉加工特性的影响[J]. 马兴芹,余水洋,龙海,梁俊俊,潘志芬,邓光兵,余懋群. 麦类作物学报. 2014(06)
[4]利用RNAi技术沉默大麦B-Hordein基因的研究[J]. 李静雯,张正英,李淑洁. 麦类作物学报. 2014(02)
[5]拟南芥的印记基因和印记表达调控[J]. 张红宇,徐培洲,杨华,吴先军. 遗传. 2010(07)
[6]DNA去甲基化与基因激活过程[J]. 柯跃斌,夏菠,梁明婵,梅树江. 癌变.畸变.突变. 2010(02)
[7]植物Dof转录因子及其生物学功能[J]. 徐慧妮,王康,李昆志. 生物技术通报. 2010(01)
[8]生物信息学在基因组研究中的应用[J]. 陈力学. 国外医学.临床生物化学与检验学分册. 2003(06)
[9]RNA干涉与基因沉默[J]. 汤富酬,薛友纺. 遗传. 2001(02)
博士论文
[1]类大麦属物种种子贮藏蛋白基因的分子克隆[D]. 郭志富.四川农业大学 2008
[2]青稞B组醇溶蛋白基因与上游调控区的克隆及基因表达[D]. 韩兆雪.中国科学院研究生院(成都生物研究所) 2007
硕士论文
[1]以色列野生大麦自然群体与世界不同国家栽培大麦品种的遗传多样性分析[D]. 高永钢.西北农林科技大学 2010
[2]酿造大麦醇溶蛋白生化特性研究[D]. 徐凯.大连工业大学 2008
本文编号:3108789
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