福建主要茶树品种（系）DNA指纹图谱研究与构建
发布时间：2021-07-07 10:34
福建具有丰富的茶树资源,作为福建重要经济作物之一,拥有悠久的茶树栽培历史。同时由于茶树品种间的杂交及长期引种栽培,积累了大量的茶树种质资源。为了鉴别福建茶树种质资源,探索出适合用于茶树遗传多样性分析的方法,本研究对共55份供试材料的遗传多样性进行分析。试验采用了 ISSR、SCOT、iPBS三种标记对55份福建主要茶树品种（品系）茶树资源的遗传多样性进行分析,并分别构建了 55份供试材料的指纹图谱。具体结果如下:（1）筛选出的11条ISSR引物对55份供试材料共检测出156个位点,其中多态性条带152条,平均每条引物扩增出14.2条,平均PPB为97.45%。获得的55份材料间的遗传相似系数在0.56～0.92之间,平均为0.72,构建了 55份茶树品种（系）的ISSR标记指纹图谱。55份供试材料共两个群体的观测等位基因数Na为1.87,有效等位基因数Ne为1.54,Nei基因多样性为0.31,香农指数Shannon为0.46,遗传分化Gst为0.05,基因流Nm为9.99。在遗传相似系数为0.68处,将55份茶树资源分成3大类。（2）本实验首次利用SCOT标记对福建茶树资源进行分析,...
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：93 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１?ｉＰＢＳ标记扩增原理（引自Ｋａｌｅｎｄａｒ等，２０１０）??Ｆｉｇｌ－１．?ＩＰＢＳ?ｍａｒｋｅｒ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｉｎｃｉｐｌｅ?（ｆｒｏｍ?Ｋａｌｅｎｄａｒ，ｅｔａｌ．２０１０）??５．２?ｉＰＢＳ分子标记应用??
福建主要茶树品种（系）ＤＮＡ指纹图谱研究与构建??６．２本研究的技术路线??５５个茶树ＤＮＡ提取???ｙ???ｘ???ｉ???ＩＳＳＲ－ＰＣＲ?ＳＣＯＴ－ＰＣＲ?ｉＰＢＳ－ＰＣＲ??反应体系优化?反应体系优化?反应体系优化???Ｙ???ｉ???Ｙ???ＩＳＳＲ引物筛选?ＳＣＯＴ引物筛选?ｉＰＢＳ引物筛选???ｙ???５???ｊ???ＩＳＳＲ－ＰＣＲ?扩增?ＳＣＯＴ－ＰＣＲ?扩增?ｉＰＢＳ－ＰＣＲ?扩增???Ｉ???ｊ???Ｉ???ＩＳＳＲ－ＰＣＲ?电泳?ＳＣＯＴ－ＰＣＲ?电泳?ｉＰＢＳ－ＰＣＲ?电泳??＋??Ｉ??Ｔ??Ｔ?士??Ｉ???聚类?ＤＮＡ指纹?聚类?ＤＮＡ指纹?聚类?ＤＮＡ指纹??分析?图谱构建?分析?图谱构建?分析?图谱构建??｜??Ｔ????—???遗传多样性、亲缘?遗传多样性、亲缘?ｉｔ传多样性、亲缘??关系分析?关系分析?关系分析???Ｙ???综合各标记分析情况，对比出最适??合用于福建茶树品种（系）亲缘关??系分析、ＤＮＡ指纹图谱构建的标??记??图１－２本研究技术路线图??Ｆｉｇ?１－２?Ｔｈｅ?ｏｕｔｌｉｎｅ?ａｎｄ?ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ?ｏｆ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ??１２??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]43份油菜菌核病抗性资源的SCoT、SSR与SRAP标记分析[J]. 张羽,张晓娟,陈进,孙晓敏,张成兵. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2017(01)
[2]SCoT标记分析陕西茶树资源的遗传多样性[J]. 陈熙,张羽,李佼,席彦军,张颜青. 茶叶科学. 2016(02)
[3]41份葡萄种质遗传多样性的ISSR和SCoT对比分析[J]. 王发明,李洁维,叶开玉,龚弘娟,莫权辉,蒋桥生,刘平平. 广西植物. 2017(01)
[4]杨梅iPBS-PCR反应体系的建立与优化[J]. 郭志海,王鹏凯,郄红丽,黄颖宏,费艳. 江苏农业科学. 2015(11)
[5]SCoT分子标记的研究现状及在茶树育种中的应用前景[J]. 李佼,李秀峰,陈曦,张羽. 茶叶通讯. 2015(03)
[6]贵州地方茶树品种资源遗传多样性RAPD分析[J]. 鄢东海,刘声传,罗显扬,魏杰,陆建良,范方媛. 中国农学通报. 2015(19)
[7]利用AFLP标记构建4种薯蓣属植物的指纹图谱[J]. 郭文,李婉琳,肖继坪,白磊,贾振华,龙雯虹,郭华春. 分子植物育种. 2015(03)
[8]凤凰单丛茶树资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 吴清韩,庄东红,朱慧,赵庆芳,杨培奎,马瑞君. 热带作物学报. 2015(03)
[9]98份甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析[J]. 昝逢刚,应雄美,吴才文,赵培方,陈学宽,马丽,苏火生,刘家勇. 中国农业科学. 2015(05)
[10]SCoT分子标记在植物研究中的应用进展[J]. 龙治坚,范理璋,徐刚,胡尚连,韩国辉. 植物遗传资源学报. 2015(02)
博士论文
[1]‘东魁’杨梅（Myrica rubra cv.Dongkui）两个变异材料的发掘及鉴定[D]. 陈方永.华中农业大学 2014
[2]铁观音茶树种性分化的分子鉴定及差异表达基因分离研究[D]. 陈志丹.福建农林大学 2013
[3]基于EST-SSR、Genomic-SSR和SCoT标记的柑橘连锁图谱构建及杂种和多倍体遗传分析[D]. 韩国辉.西南大学 2012
[4]利用ISSR和EST-SSR标记研究中国茶树资源的遗传多样性和遗传结构[D]. 姚明哲.浙江大学 2009
[5]EST-SSR和ISSR分子标记在云南茶树资源中的应用研究[D]. 刘本英.中国农业科学院 2009
[6]茶树遗传多样性分析与遗传图谱构建[D]. 黄福平.浙江大学 2005
硕士论文
[1]陕西茶树种质资源DNA指纹图谱构建[D]. 陈熙.陕西理工学院 2016
[2]扇脉杓兰遗传多样性的SCoT分析及扇脉组的亲缘地理学研究[D]. 张俊丽.华东师范大学 2016
[3]基于EST-SSR和iPBS标记的杨梅遗传多样性研究[D]. 王文婷.浙江大学 2016
[4]基于DArT技术的大黄鱼耐低温性状相关分子标记的筛选[D]. 闫松松.宁波大学 2014
[5]5种山茶属野生油茶ISSR亲缘关系研究及指纹图谱的构建[D]. 李国帅.中南林业科技大学 2014
[6]油茶种质资源多样性的ISSR分析[D]. 周兰英.湖南师范大学 2014
[7]割手密分子遗传连锁图谱的构建[D]. 杨海霞.广西大学 2013
[8]川渝选育茶树品种的RAPD和ISSR分析[D]. 迟琳.四川农业大学 2013
[9]特异茶树种质资源RAPD标记向SCAR标记转化的研究[D]. 吴永胜.四川农业大学 2012
[10]30份四川茶树主要种质资源遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析[D]. 席春奕.四川农业大学 2012
本文编号：3269474
【文章来源】：福建农林大学福建省
【文章页数】：93 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１?ｉＰＢＳ标记扩增原理（引自Ｋａｌｅｎｄａｒ等，２０１０）??Ｆｉｇｌ－１．?ＩＰＢＳ?ｍａｒｋｅｒ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｉｎｃｉｐｌｅ?（ｆｒｏｍ?Ｋａｌｅｎｄａｒ，ｅｔａｌ．２０１０）??５．２?ｉＰＢＳ分子标记应用??
福建主要茶树品种（系）ＤＮＡ指纹图谱研究与构建??６．２本研究的技术路线??５５个茶树ＤＮＡ提取???ｙ???ｘ???ｉ???ＩＳＳＲ－ＰＣＲ?ＳＣＯＴ－ＰＣＲ?ｉＰＢＳ－ＰＣＲ??反应体系优化?反应体系优化?反应体系优化???Ｙ???ｉ???Ｙ???ＩＳＳＲ引物筛选?ＳＣＯＴ引物筛选?ｉＰＢＳ引物筛选???ｙ???５???ｊ???ＩＳＳＲ－ＰＣＲ?扩增?ＳＣＯＴ－ＰＣＲ?扩增?ｉＰＢＳ－ＰＣＲ?扩增???Ｉ???ｊ???Ｉ???ＩＳＳＲ－ＰＣＲ?电泳?ＳＣＯＴ－ＰＣＲ?电泳?ｉＰＢＳ－ＰＣＲ?电泳??＋??Ｉ??Ｔ??Ｔ?士??Ｉ???聚类?ＤＮＡ指纹?聚类?ＤＮＡ指纹?聚类?ＤＮＡ指纹??分析?图谱构建?分析?图谱构建?分析?图谱构建??｜??Ｔ????—???遗传多样性、亲缘?遗传多样性、亲缘?ｉｔ传多样性、亲缘??关系分析?关系分析?关系分析???Ｙ???综合各标记分析情况，对比出最适??合用于福建茶树品种（系）亲缘关??系分析、ＤＮＡ指纹图谱构建的标??记??图１－２本研究技术路线图??Ｆｉｇ?１－２?Ｔｈｅ?ｏｕｔｌｉｎｅ?ａｎｄ?ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ?ｏｆ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ??１２??
２１５．３?１．９４?鬼洞白鸡冠?１４１１．５?２．００??福云?６?号?２２８．３?１．９５??２．２筛选出的ＩＳＳＲ引物及多态性分析??优化后的ＰＣＲ扩增程序及优化后扩增体系：总体积２０?ｕｌ，其中全式金２?ｘ??ＥａｓｙＴａｑ?ＰＣＲ?ＳｕｐｅｒＭｉｘ?１０?ｎＬ，５０?ｎｇ／成?ＤＮＡ?Ｉ?ｎＬ，浓度为?１００?ｕｍｏｌ／Ｌ?引物?２?ｐＬ，??ｄｄＨ２０补足总体积。采用７个有代表性茶树ＤＮＡ基因组组成的基因池对５０条??ＩＳＳＲ通用引物进行有无多态性条带的筛选试验，图２－２为部分引物多态性筛选??情况。对比扩增条带的稳定性、条带的清晰度，从５０条引物中筛选到１１条多态??性良好，扩增稳定、清晰的引物。对筛选出的１１条具有较好多态性的引物进行??退火温度的筛选，以电泳条带中有清晰条带所在温度为退火温度，最后得到１１??条引物的最适退火温度，如图２－３为引物ＵＢＣ８４１、ＵＢＣ８５３和ＵＢＣ８５４的退火??温度电泳图。对５５份供试材料进行扩增，扩增图谱２．４为引物８９２的扩增情况，??在筛选到的１１条引物中单引物ＵＢＣ８４０最多能扩增出１９条；引物ＵＢＣ８８０和??８８１扩增最少，为１１条条带；共得到１５６条ＤＮＡ谱带，平均每条引物扩增出１４．２??条条带，其中多态性谱带１５２条，平均多态性比率（ＰＰＢ）为９７．４５％；多态性位点??百分率（ＰＰＬ）最高为１００％，最低为８７．５％（如表２－５），说明供试茶树遗传资源??的多态性较为丰富。??———ａ—ＢＢＨ——??２０００ｂｐ?遼：??ｌ（）（Ｍ＞ｈｐ?…：Ｌ?．：?ｖ＇＇?ｆ＇?．?＇?，：?；■??７５０ｂｐ??５００ｂｐ?Ｉ?縛
【参考文献】：
期刊论文
[1]43份油菜菌核病抗性资源的SCoT、SSR与SRAP标记分析[J]. 张羽,张晓娟,陈进,孙晓敏,张成兵. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2017(01)
[2]SCoT标记分析陕西茶树资源的遗传多样性[J]. 陈熙,张羽,李佼,席彦军,张颜青. 茶叶科学. 2016(02)
[3]41份葡萄种质遗传多样性的ISSR和SCoT对比分析[J]. 王发明,李洁维,叶开玉,龚弘娟,莫权辉,蒋桥生,刘平平. 广西植物. 2017(01)
[4]杨梅iPBS-PCR反应体系的建立与优化[J]. 郭志海,王鹏凯,郄红丽,黄颖宏,费艳. 江苏农业科学. 2015(11)
[5]SCoT分子标记的研究现状及在茶树育种中的应用前景[J]. 李佼,李秀峰,陈曦,张羽. 茶叶通讯. 2015(03)
[6]贵州地方茶树品种资源遗传多样性RAPD分析[J]. 鄢东海,刘声传,罗显扬,魏杰,陆建良,范方媛. 中国农学通报. 2015(19)
[7]利用AFLP标记构建4种薯蓣属植物的指纹图谱[J]. 郭文,李婉琳,肖继坪,白磊,贾振华,龙雯虹,郭华春. 分子植物育种. 2015(03)
[8]凤凰单丛茶树资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 吴清韩,庄东红,朱慧,赵庆芳,杨培奎,马瑞君. 热带作物学报. 2015(03)
[9]98份甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析[J]. 昝逢刚,应雄美,吴才文,赵培方,陈学宽,马丽,苏火生,刘家勇. 中国农业科学. 2015(05)
[10]SCoT分子标记在植物研究中的应用进展[J]. 龙治坚,范理璋,徐刚,胡尚连,韩国辉. 植物遗传资源学报. 2015(02)
博士论文
[1]‘东魁’杨梅（Myrica rubra cv.Dongkui）两个变异材料的发掘及鉴定[D]. 陈方永.华中农业大学 2014
[2]铁观音茶树种性分化的分子鉴定及差异表达基因分离研究[D]. 陈志丹.福建农林大学 2013
[3]基于EST-SSR、Genomic-SSR和SCoT标记的柑橘连锁图谱构建及杂种和多倍体遗传分析[D]. 韩国辉.西南大学 2012
[4]利用ISSR和EST-SSR标记研究中国茶树资源的遗传多样性和遗传结构[D]. 姚明哲.浙江大学 2009
[5]EST-SSR和ISSR分子标记在云南茶树资源中的应用研究[D]. 刘本英.中国农业科学院 2009
[6]茶树遗传多样性分析与遗传图谱构建[D]. 黄福平.浙江大学 2005
硕士论文
[1]陕西茶树种质资源DNA指纹图谱构建[D]. 陈熙.陕西理工学院 2016
[2]扇脉杓兰遗传多样性的SCoT分析及扇脉组的亲缘地理学研究[D]. 张俊丽.华东师范大学 2016
[3]基于EST-SSR和iPBS标记的杨梅遗传多样性研究[D]. 王文婷.浙江大学 2016
[4]基于DArT技术的大黄鱼耐低温性状相关分子标记的筛选[D]. 闫松松.宁波大学 2014
[5]5种山茶属野生油茶ISSR亲缘关系研究及指纹图谱的构建[D]. 李国帅.中南林业科技大学 2014
[6]油茶种质资源多样性的ISSR分析[D]. 周兰英.湖南师范大学 2014
[7]割手密分子遗传连锁图谱的构建[D]. 杨海霞.广西大学 2013
[8]川渝选育茶树品种的RAPD和ISSR分析[D]. 迟琳.四川农业大学 2013
[9]特异茶树种质资源RAPD标记向SCAR标记转化的研究[D]. 吴永胜.四川农业大学 2012
[10]30份四川茶树主要种质资源遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析[D]. 席春奕.四川农业大学 2012
本文编号：3269474
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