马铃薯结薯相关MADS-box转录因子的鉴定与分析
发布时间:2022-01-02 00:16
马铃薯(Solanum tuberosum L.)作为重要的粮食作物,具有产量高、适应性强等特点。马铃薯块茎既是经济器官又是繁殖器官,研究马铃薯块茎形成机理有利于提高马铃薯的产量和品质,对马铃薯的生产具有重要的应用及理论的指导意义。光周期响应的CO-FT途径调控开花、季节性生长和储藏器官形成等多个发育转变过程,FT同源基因St SP6A介导环境光周期信号进而调控块茎形成。但St SP6A如何进一步调节匍匐茎顶端膨大的机制尚不清楚。基于顶端分生组织中保守的FT-AP1调控模块,本研究鉴定了马铃薯全基因组中所有的MADS-box基因,明确其基因结构及在不同光周期条件下的表达模式,筛选出可能参与介导St SP6A信号调控光周期诱导的储藏器官形成过程的MADS-box转录因子,为后续探究马铃薯St SP6A的信号转导提供基础。主要实验结果如下:1)利用plant TFDB数据库,鉴定出马铃薯中132个MADS-box转录因子,聚类、染色体位置和基因结构分析结果表明,MADS-box转录因子聚于两个亚族:MIKC-type和M-type,M-type进一步分为Mα、Mγ、Mβ三个亚家族;MADS...
【文章来源】:华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
pGreenⅡ0800载体结构图
马铃薯结薯相关 MADS-box 转录因子的鉴定与分析图 1 pGreenⅡ0800 载体结构图Fig.1 pGreenⅡ0800 yector structure diagram
T+TD ID 后五位数字,其基因信息包括了 PGSC 数据库编号、染色体位置、蛋、基因亚族及外显子个数(附录Ⅰ)。基于马铃薯系统发育关系(图 4a)将 MAD因子分为了两个亚家族:MIKC-type 与 M-type。在 132 个马铃薯 MADS-box中,MIKC-type 蛋白亚族有 36 个 MADS-box 基因,M-type 蛋白亚族有 DS-box 基因,该亚家族 MADS-box 基因个数几乎是 MIKC-type 蛋白亚族的 2 Mα 亚家族中有 61 个 MADS-box 基因,Mβ 亚家族有 24 个 MADS-box 基因族有 11 个 MADS-box 基因。马铃薯 MADS-box 转录因子家族基因编码蛋白质2aa-495aa 之间,平均长度约为 193aa。其中 MIKC-type 蛋白质平均长度约为 20ype 蛋白质平均长度约为 188aa。为了进一步研究马铃薯 MADS-box 转录因子家族进化关系及预测其家族的功能asttree 与 itol 软件,我们将拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的 108 个 MADS-马铃薯中 132 个 MADS-box 基因构建系统发育树(图 3)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]近年马铃薯产业形势与2017年展望[J]. 杨宗辉,于群,刘合光. 农业展望. 2017(09)
[2]赤霉素调控植物块茎形态建成的研究进展[J]. 周芸伊,张静,王亚伦,肖冬,王爱勤,何龙飞. 作物杂志. 2016(04)
[3]蔗糖调节马铃薯块茎形成机制的研究进展[J]. 巩慧玲,孙梦遥,冯再平,袁惠君. 中国蔬菜. 2016(03)
[4]光周期诱导马铃薯块茎形成的分子机理研究进展[J]. 谢婷婷,柳俊. 中国农业科学. 2013(22)
[5]马铃薯抗寒性研究进展[J]. 魏亮,李飞,徐建飞,刘杰,段绍光,于卓,金黎平. 贵州农业科学. 2012(02)
[6]糖类及其衍生物对马铃薯块茎形成的影响[J]. 罗玉,李灿辉. 昆明学院学报. 2011(06)
[7]植物MADS-box基因FRUITFULL(FUL)研究进展[J]. 褚婷婷,谢华,徐勇,马荣才. 中国生物工程杂志. 2010(09)
[8]马铃薯的传播与产业发展研究[J]. 彭涛,康霞. 甘肃农业. 2010(02)
[9]不同培育温度对马铃薯生长及产量的影响[J]. 王晓宇,郭华春. 中国马铃薯. 2009(06)
[10]植物MADS-box基因研究进展[J]. 马辉,张智俊,罗淑萍. 生物技术通报. 2006(06)
本文编号:3563092
【文章来源】:华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:77 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
pGreenⅡ0800载体结构图
马铃薯结薯相关 MADS-box 转录因子的鉴定与分析图 1 pGreenⅡ0800 载体结构图Fig.1 pGreenⅡ0800 yector structure diagram
T+TD ID 后五位数字,其基因信息包括了 PGSC 数据库编号、染色体位置、蛋、基因亚族及外显子个数(附录Ⅰ)。基于马铃薯系统发育关系(图 4a)将 MAD因子分为了两个亚家族:MIKC-type 与 M-type。在 132 个马铃薯 MADS-box中,MIKC-type 蛋白亚族有 36 个 MADS-box 基因,M-type 蛋白亚族有 DS-box 基因,该亚家族 MADS-box 基因个数几乎是 MIKC-type 蛋白亚族的 2 Mα 亚家族中有 61 个 MADS-box 基因,Mβ 亚家族有 24 个 MADS-box 基因族有 11 个 MADS-box 基因。马铃薯 MADS-box 转录因子家族基因编码蛋白质2aa-495aa 之间,平均长度约为 193aa。其中 MIKC-type 蛋白质平均长度约为 20ype 蛋白质平均长度约为 188aa。为了进一步研究马铃薯 MADS-box 转录因子家族进化关系及预测其家族的功能asttree 与 itol 软件,我们将拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的 108 个 MADS-马铃薯中 132 个 MADS-box 基因构建系统发育树(图 3)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]近年马铃薯产业形势与2017年展望[J]. 杨宗辉,于群,刘合光. 农业展望. 2017(09)
[2]赤霉素调控植物块茎形态建成的研究进展[J]. 周芸伊,张静,王亚伦,肖冬,王爱勤,何龙飞. 作物杂志. 2016(04)
[3]蔗糖调节马铃薯块茎形成机制的研究进展[J]. 巩慧玲,孙梦遥,冯再平,袁惠君. 中国蔬菜. 2016(03)
[4]光周期诱导马铃薯块茎形成的分子机理研究进展[J]. 谢婷婷,柳俊. 中国农业科学. 2013(22)
[5]马铃薯抗寒性研究进展[J]. 魏亮,李飞,徐建飞,刘杰,段绍光,于卓,金黎平. 贵州农业科学. 2012(02)
[6]糖类及其衍生物对马铃薯块茎形成的影响[J]. 罗玉,李灿辉. 昆明学院学报. 2011(06)
[7]植物MADS-box基因FRUITFULL(FUL)研究进展[J]. 褚婷婷,谢华,徐勇,马荣才. 中国生物工程杂志. 2010(09)
[8]马铃薯的传播与产业发展研究[J]. 彭涛,康霞. 甘肃农业. 2010(02)
[9]不同培育温度对马铃薯生长及产量的影响[J]. 王晓宇,郭华春. 中国马铃薯. 2009(06)
[10]植物MADS-box基因研究进展[J]. 马辉,张智俊,罗淑萍. 生物技术通报. 2006(06)
本文编号:3563092
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