石斛属植物叶绿体基因组研究及其代表种逆境下光合作用途径探讨

发布时间：2022-01-23 13:01

　　兰科是单子叶植物中最大的科,含有5个亚科,880个属,约25,000个种。很多兰科植物具有较高的观赏和药用价值。然而关于兰科5亚科间的系统发育关系还未明确,主要的争论在于其3个单雄蕊类群:树兰亚科、兰亚科和香荚兰亚科是否为单系类群。此外,有关兰科植物叶绿体基因组高变序列的研究仍然较少。因此,本研究测序获得了细茎石斛（Dendrobium moniliforme）,斑叶兰（Goodyera schlechtendaliana）,杏黄兜兰（Paphiopedilum armeniaclum）和香荚兰（Vanilla aphylla）四个物种的完整叶绿体基因组并结合已发表的49个兰科叶绿体基因组进行了分析。分析结果表明,四个叶绿体基因组不仅在IR和SC的长度上有差异,而且在ndh基因的剩余长度也不一致。基于比较分析发现在兜兰属（Paphiopedilum）和香荚兰属（Vanilla）属植物中IR的扩增和ndh基因的丢失有关。其次,兰科植物叶绿体基因组的高变区域具有属间特异性,经过仔细筛选,本研究推荐:5’trnK-rps16,trnS-trnG和rps16-trnQ-trnQ可以作为树兰亚科... 

【文章来源】：南京师范大学江苏省 211工程院校

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图１－２烟草叶绿体基因组图谱

Ｉ：?＇?１５５，９３９?ｂｐ?ｌ?ＩＩＩ??ｎ?ｉｍ??图１－２烟草叶绿体基因组图谱。此图引自Ｗａｋａｓｕｇｉ?ｅｔ?ａｌ．?（１９９８）。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－２?Ｐｌａｓｔｏｍｅ?ｍａｐ?ｏｆ?ｔｏｂａｃｃｏ．?Ａｒｒｏｗｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｔｈｅ?ｇｅｎｅ?ｂｏｘｅｓ?ａｎｄ?ｇｅｎｅ?ｎａｍｅｓ?ｓｈｏｗ?ｔｈｏｓｅ??ｏｐｅｒｏｎｓ?ｋｎｏｗｎ?ｔｏ?ｏｃｃｕｒ?ｉｎ?ｔｏｂａｃｃｏ?ｃｐＤＮＡ．??虽然叶绿体基因组图谱常以环形表示，但多数叶绿体基因组在细胞中却很可??能是以线性或者分叉形式存在的，并随发育时期不同而变化（Ｂｅｎｄｉｃｈ２００４）。??１．１．３叶绿体基因组的进化??尽管陆生植物的叶绿体基因组在基因含量和基因组结构方面十分保守，但是??在漫长的进化过程中还是发生了一些结构上的变化。这些变化主要包含：基因和??内含子的丢失，ＩＲ的变化和倒位（ｉｎｖｅｒｓｉｏｎ）等。??１．１．３．１基因和内含子的丟失??古细菌蓝藻被原始真核细胞俘获后，很多功能不再重要，因此大多数基因在??早期的内共生过程中已经丢失，然而在其不断进化的历程中，仍有很多基因丢失??的事件发生。在裸子植物中属植物的叶绿体基因组普遍丢失了?〇ｃｃ￡？，??７外／（５

＾?ＩＰｉｎａｉｅｓ?Ｊ??图１－５基于８１个叶绿体基因对６４个种构建的ＭＬ树。??此图引自?Ｊａｎｓｅｎ?ｅｔ?ａｌ．?（２００７）。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－５?ＭＬ?ｔｒｅｅ?ｏｆ?６４?ｔａｘａ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?８１?ｐｌａｓｔｉｄ?ｇｅｎｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ．??１．２．２叶绿体基因组在物种鉴定方面的研究??叶绿体基因组的结构保守，且基因多是单拷贝基因，易于设计出通用性高的??引物用于ＤＮＡ序列扩増。因此，叶绿体基因组的片段序列常用于物种鉴定方面??的研宄。然而植物中片段序列的变异度不足，未能筛选出与动物中ＣＯＩ序列类??似的通用条形码序列，因此经常联合多个变异度较高的片段进行物种鉴别。这些??高变的片段除了有生命条形码联盟（ＣＢＯＬ）建议的ｍｏ／尺，ＡｃＺ之外（ＣＢＯＬ??Ｐｌａｎｔ?Ｗｏｒｋｉｎｇ?Ｇｒｏｕｐ?２００９），还有一些片段也常被认为具备较髙的序列变异度，??如：／＊／？〇Ｃ７

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3604402