小麦降落值分子标记开发
发布时间:2022-02-13 13:32
小麦是世界上主要的粮食作物。在国际贸易中,小麦的交易量占很大比重。小麦收获前,受季风气候的影响,会发生穗上发芽的现象。小麦籽粒发芽,使淀粉降解,严重影响小麦的品质。发芽的小麦籽粒,α-淀粉酶的活性增强,负向影响小麦降落值。降落值大小是小麦等级区分、交易价格和储存方式的重要依据。本论文主要利用NCBI网站中α-淀粉酶基因以及EST序列,尝试开发与小麦降落值相关的分子标记。主要结果如下:1)按照AACCI/No.56-81.03(1972)国际标准方法测定小麦降落值。测定406份普通小麦材料的降落值,方差分析结果表明,该群体小麦降落值在不同品种间存在极显著差异,重复间差异不显著,可用于分子标记的开发。2)将α-淀粉酶基因α-AMY1(NCBI基因登陆号:KJ470678)、α-AMY2(KX449614)和α-AMY3(M16991)及EST(cv065403)进行序列比对,共设计出360对TRAP引物。利用降落值极高和极低的小麦品种共20份进行引物筛选,从360对引物中筛选出20对特征引物,扩增效率高、重复性好、条带清晰且易于区分。20对引物共扩增出187个位点,68个多态性位点,173...
【文章来源】:安徽农业大学安徽省
【文章页数】:90 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
6份小麦品种两年降落值的分布直方图
图 4-2 2016 年 320 份小麦降落值分布直方图Fig 4-2 Number of 320 Wheat falling number distribution histograms in 2016从图 4-2 可以看出,320 份自然群体材料的小麦降落值有 294 个小麦品种的降落值达到 220S 以上,占所有品种的 91.82%,说明 320 份材料的小麦籽粒发芽的程度低小麦的质量较好。有 4 个品种的降落值小于 150S,这些品种在同等环境下生长说明这 4 个品种的籽粒发芽严重,属于易发芽的品种。4.2小麦基因组DNA质量检测406 份小麦自然群体材料的 DNA 质量是本试验的研究基础,开发分子标记要求有较好质量的 DNA。本试验用于提取基因组 DNA 的是小麦的籽粒,因此采取的是 SDS-饱和酚法。小麦籽粒提取的 DNA 后,加入 1μL 的 RNA 酶,减少 RNA对基因组 DNA 影响。小麦基因组 DNA 母液溶解至少一天以后,取 2μLDNA 母液,利用 1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳,406 份中的部分 DNA 检测电泳结果如图 4-3。在使用之前,取 10μL 的 DNA 母液,加入 90μL 的灭菌水稀释到 1ml。
图 4-3 部分材料基因组 DNA 琼脂糖凝胶电泳检测图Fig4-3 Genomic DNA agarose gel electrophoresis in partial material detection map测结果表明,406 份小麦基因组 DNA 电泳的条带较为整齐,无明显基本上也无 RNA 的污染,提取的 DNA 的质量较好,满足分子生物NA 质量的要求,可以直接用于分子标记的 PCR 实验。在使用之前, 母液,加入 90μL 的灭菌水稀释到 1ml,使 DNA 的浓度约为 50nAP-PCR扩增引物的筛选与分析用小麦α-淀粉酶的同工酶基因序列及EST序列设计TRAP标记的固用 α-AMY1 基因、α-AMY2 基因及 α-AMY3 基因分别设计 7 条固定引粉酶基因的 EST 序列设计 3 条固定引物,共设计 24 条固定引物。到 15 条随机引物,共 360 对 TRAP 引物。为了选出扩增条带较为清用 TRAP-PCR 程序特定的退火温度进行 PCR 扩增。琼脂糖凝胶电泳。电泳结果表明,其中 244 对引物组合扩增的条带不清楚甚至没有
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用TRAP标记分析83份烟草种质资源遗传多样性及遗传演化关系[J]. 王一伊,向秋燕,阎文昭,蒲志刚,邢小军,刘东阳,冯俊彦. 西南农业学报. 2016(03)
[2]小麦穗发芽抗性鉴定及相关分子标记的有效性验证[J]. 张兆萍,周丽敏,宋晓朋,连俊方,孙道杰. 麦类作物学报. 2015(03)
[3]世界粮食贸易格局的演变及发展趋势分析[J]. 王溶花,曾福生. 世界农业. 2015(02)
[4]小麦粒重基因TaCwi-A1功能标记CWI22、CWI21的验证及应用[J]. 相吉山,穆培源,桑伟,聂迎彬,徐红军,庄丽,崔凤娟,韩新年,邹波. 中国农业科学. 2014(13)
[5]黄瓜矮生基因(cp)连锁的简单重复序列(SSRs)和序列标签位点(STS)标记[J]. 雍建朋,李玉红,孟永娇,钟艳花,程智慧,陈鹏. 农业生物技术学报. 2013(10)
[6]DNA分子标记在木耳属真菌中的应用研究进展[J]. 杨晓兵,宋慧,刘麒,李胜南,潘祖桐. 菌物研究. 2010(03)
[7]小麦赤霉病抗性改良研究进展[J]. 马鸿翔,陆维忠. 江苏农业学报. 2010(01)
[8]粗山羊草Y189抗小麦白粉病基因SSR标记[J]. 张海泉. 河南大学学报(自然科学版). 2007(02)
[9]目标区域扩增多态性(TRAP):一种新的植物基因型标记技术[J]. 杜晓华,王得元,巩振辉. 分子植物育种. 2004(05)
[10]开发SSR引物方法之研究动态[J]. 李明芳,郑学勤. 遗传. 2004(05)
博士论文
[1]小麦类黄酮生物合成相关基因及α-淀粉酶基因遗传分析[D]. 刘泽厚.四川农业大学 2014
硕士论文
[1]不同地点间桦剥管菌的木材降解相关酶及TRAP和SRAP标记的遗传多样性分析[D]. 彭木.东北林业大学 2016
[2]普通小麦穗发芽抗性与品质特性关系研究[D]. 马丽.四川农业大学 2014
[3]鲤TRAP分子标记筛选及其遗传多样性分析[D]. 曲疆奇.南京农业大学 2010
[4]小麦α-淀粉酶活性与主要品质性状的相关性及其遗传分析[D]. 岳海凤.河南农业大学 2009
[5]甘蔗及其近缘植物遗传多样性的SRAP和TRAP标记分析[D]. 宋弦弦.福建农林大学 2009
[6]利用TRAP标记分析甘蔗遗传多样性[D]. 陈天生.福建农林大学 2008
本文编号:3623283
【文章来源】:安徽农业大学安徽省
【文章页数】:90 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
6份小麦品种两年降落值的分布直方图
图 4-2 2016 年 320 份小麦降落值分布直方图Fig 4-2 Number of 320 Wheat falling number distribution histograms in 2016从图 4-2 可以看出,320 份自然群体材料的小麦降落值有 294 个小麦品种的降落值达到 220S 以上,占所有品种的 91.82%,说明 320 份材料的小麦籽粒发芽的程度低小麦的质量较好。有 4 个品种的降落值小于 150S,这些品种在同等环境下生长说明这 4 个品种的籽粒发芽严重,属于易发芽的品种。4.2小麦基因组DNA质量检测406 份小麦自然群体材料的 DNA 质量是本试验的研究基础,开发分子标记要求有较好质量的 DNA。本试验用于提取基因组 DNA 的是小麦的籽粒,因此采取的是 SDS-饱和酚法。小麦籽粒提取的 DNA 后,加入 1μL 的 RNA 酶,减少 RNA对基因组 DNA 影响。小麦基因组 DNA 母液溶解至少一天以后,取 2μLDNA 母液,利用 1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳,406 份中的部分 DNA 检测电泳结果如图 4-3。在使用之前,取 10μL 的 DNA 母液,加入 90μL 的灭菌水稀释到 1ml。
图 4-3 部分材料基因组 DNA 琼脂糖凝胶电泳检测图Fig4-3 Genomic DNA agarose gel electrophoresis in partial material detection map测结果表明,406 份小麦基因组 DNA 电泳的条带较为整齐,无明显基本上也无 RNA 的污染,提取的 DNA 的质量较好,满足分子生物NA 质量的要求,可以直接用于分子标记的 PCR 实验。在使用之前, 母液,加入 90μL 的灭菌水稀释到 1ml,使 DNA 的浓度约为 50nAP-PCR扩增引物的筛选与分析用小麦α-淀粉酶的同工酶基因序列及EST序列设计TRAP标记的固用 α-AMY1 基因、α-AMY2 基因及 α-AMY3 基因分别设计 7 条固定引粉酶基因的 EST 序列设计 3 条固定引物,共设计 24 条固定引物。到 15 条随机引物,共 360 对 TRAP 引物。为了选出扩增条带较为清用 TRAP-PCR 程序特定的退火温度进行 PCR 扩增。琼脂糖凝胶电泳。电泳结果表明,其中 244 对引物组合扩增的条带不清楚甚至没有
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用TRAP标记分析83份烟草种质资源遗传多样性及遗传演化关系[J]. 王一伊,向秋燕,阎文昭,蒲志刚,邢小军,刘东阳,冯俊彦. 西南农业学报. 2016(03)
[2]小麦穗发芽抗性鉴定及相关分子标记的有效性验证[J]. 张兆萍,周丽敏,宋晓朋,连俊方,孙道杰. 麦类作物学报. 2015(03)
[3]世界粮食贸易格局的演变及发展趋势分析[J]. 王溶花,曾福生. 世界农业. 2015(02)
[4]小麦粒重基因TaCwi-A1功能标记CWI22、CWI21的验证及应用[J]. 相吉山,穆培源,桑伟,聂迎彬,徐红军,庄丽,崔凤娟,韩新年,邹波. 中国农业科学. 2014(13)
[5]黄瓜矮生基因(cp)连锁的简单重复序列(SSRs)和序列标签位点(STS)标记[J]. 雍建朋,李玉红,孟永娇,钟艳花,程智慧,陈鹏. 农业生物技术学报. 2013(10)
[6]DNA分子标记在木耳属真菌中的应用研究进展[J]. 杨晓兵,宋慧,刘麒,李胜南,潘祖桐. 菌物研究. 2010(03)
[7]小麦赤霉病抗性改良研究进展[J]. 马鸿翔,陆维忠. 江苏农业学报. 2010(01)
[8]粗山羊草Y189抗小麦白粉病基因SSR标记[J]. 张海泉. 河南大学学报(自然科学版). 2007(02)
[9]目标区域扩增多态性(TRAP):一种新的植物基因型标记技术[J]. 杜晓华,王得元,巩振辉. 分子植物育种. 2004(05)
[10]开发SSR引物方法之研究动态[J]. 李明芳,郑学勤. 遗传. 2004(05)
博士论文
[1]小麦类黄酮生物合成相关基因及α-淀粉酶基因遗传分析[D]. 刘泽厚.四川农业大学 2014
硕士论文
[1]不同地点间桦剥管菌的木材降解相关酶及TRAP和SRAP标记的遗传多样性分析[D]. 彭木.东北林业大学 2016
[2]普通小麦穗发芽抗性与品质特性关系研究[D]. 马丽.四川农业大学 2014
[3]鲤TRAP分子标记筛选及其遗传多样性分析[D]. 曲疆奇.南京农业大学 2010
[4]小麦α-淀粉酶活性与主要品质性状的相关性及其遗传分析[D]. 岳海凤.河南农业大学 2009
[5]甘蔗及其近缘植物遗传多样性的SRAP和TRAP标记分析[D]. 宋弦弦.福建农林大学 2009
[6]利用TRAP标记分析甘蔗遗传多样性[D]. 陈天生.福建农林大学 2008
本文编号:3623283
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3623283.html
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