利用CRISPR/Cas9技术编辑淀粉合成基因Pullulan
发布时间:2022-05-06 20:06
水稻(Oryza.Sativa)是世界主要的粮食作物。水稻成熟种子中胚乳约占总质量的90%。胚乳细胞的发育状况直接决定着水稻的产量和品质。稻米胚乳垩白直接影响稻米外观品质、碾磨加工品质和蒸煮食味品质。因此研究胚乳发育进程及淀粉合成机理对于实现水稻的高产、优质具有重要的意义。利用CRISPR/Cas9技术对调控稻米脱支酶基因PUL定点编辑,获得了一套有重要育种价值的pul突变体。首先设计两个guide RNA(gRNA)靶位点,crispr-PUL-T1和crispr-PUL-T2以定点编辑PUL基因的外显子区域;然后,将这两个靶点分别构建在中间载体SK-gRNA上;最后,用一步法连接两个中间组装到线性化的最终载体pC1300 Cas9上。1农杆菌转化及T0转基因植株突变验证将构建好的双靶点pC1300 Cas9::PUL1+2载体通过热激转化到农杆菌EHA105中,然后转化水稻品种ZH11的愈伤组织。CTAB法提取T0植株的叶片的基因组DNA,并对靶序列位点附近片段设引物,进行PCR酶切验证和Sanger测序分析。结果表明,T0
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
英文缩略表
第一章 引言
1.1 胚乳发育
1.1.1 胚乳发育与淀粉
1.1.2 胚乳发育与蛋白
1.1.3 胚乳细胞中的程序性死亡过程
1.2 淀粉代谢相关基因研究进展
1.2.1 淀粉的合成相关基因
1.2.1.1 淀粉的结构
1.2.2 糖转运过程与淀粉合成
1.2.3 PUL研究进展
1.3 基因编辑技术研究进展
1.3.1 ZFNs系统
1.3.2 TALENs系统
1.3.3 CRISPR/Cas9系统
1.4 本实验研究的目的
第二章 实验材料与方法
2.1 实验材料与试剂
2.1.1 水稻材料
2.1.2 质粒载体
2.1.3 菌株种类
2.1.4 主要试剂
2.2 实验方法
2.2.1 PUl的CRISPR/Cas9载体构建
2.2.1.1. 靶序列选择及引物设计
2.2.1.2. SK-gRNA中间载体构建
2.2.1.3 pC1300-Cas9最终载体构建
2.2.2 农杆菌介导水稻愈伤遗传转化
2.2.3 阳性转基因植株验证
2.2.4 突变检测
2.2.5 农艺性状考察
2.2.6 稻米生理生化品质
2.2.7 粒重和淀粉合成相关基因表达
第三章 结果与分析
3.1 gRNA靶位点选择及引物设计
3.2 SK-gRNA和pC1300 Cas9::PUL载体的鉴定
3.3 PUL的编辑及后代的鉴定分析
3.4 农艺性状
3.5 稻米品质分析
3.6 相关基因表达
第四章 结论与讨论
参考文献
附图
致谢
个人简历
【参考文献】:
期刊论文
[1]Rice caryopsis development Ⅱ: Dynamic changes in the endosperm[J]. Xiaoba Wu,Jinxin Liu,Dongqi Li,Chun-Ming Liu. Journal of Integrative Plant Biology. 2016(09)
[2]Quantitative Trait Loci for Grain Chalkiness and Endosperm Transparency Detected in Three Recombinant Inbred Line Populations of Indica Rice[J]. MEI De-yong,ZHU Yu-jun,YU Yong-hong,FAN Ye-yang,HUANG De-run,ZHUANG Jie-yun. Journal of Integrative Agriculture. 2013(01)
[3]A Kelch Motif-Containing Serine/Threonine Protein Phosphatase Determines the Large Grain QTL Trait in Rice[J]. Zejun Hu,Haohua He,Shiyong Zhang,Fan Sun,Xiaoyun Xin,Wenxiang Wang,Xi Qian,Jingshui Yang,Xiaojin Luo. Journal of Integrative Plant Biology. 2012(12)
[4]Identification of a Stable Quantitative Trait Locus for Percentage Grains with White Chalkiness in Rice (Oryza sativa)[J]. Tao Guo1, Xiaolu Liu2, Xiangyuan Wan1, Jianfeng Weng1, Shijia Liu1, Xi Liu1, Mingjiang Chen1, Jingjing Li1, Ning Su2, Fuqing Wu2, Zhijun Cheng2, Xiuping Guo2, Cailin Lei2, Jiulin Wang2, Ling Jiang1 and Jianmin Wan1,21Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/Jiangsu Plant Gene Engineering Research Center, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China 2Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(08)
[5]稻米垩白形成的研究进展[J]. 彭勃,陈光辉. 作物研究. 2009(05)
[6]利用近红外透射光谱技术同步测定糙米的多项品质指标初报[J]. 孙成效,段彬伍,谢黎虹,陈能. 中国水稻科学. 2006(04)
[7]杂交稻米质性状的亲本配合力分子标记鉴定[J]. 刘小川,王渭霞,陈深广,余柳青. 中国水稻科学. 2005(01)
[8]水稻胚乳的发育及其养分输入的途径[J]. 王忠,李卫芳,顾蕴洁,陈刚,石火英,高煜珠. 作物学报. 1995(05)
[9]谷类作物胚乳性状遗传控制的鉴别[J]. 莫惠栋. 遗传学报. 1995(02)
博士论文
[1]水稻胚乳垩白形成机制的生理生化与转录组水平解析[D]. 刘晓璐.中国农业科学院 2010
本文编号:3651127
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
英文缩略表
第一章 引言
1.1 胚乳发育
1.1.1 胚乳发育与淀粉
1.1.2 胚乳发育与蛋白
1.1.3 胚乳细胞中的程序性死亡过程
1.2 淀粉代谢相关基因研究进展
1.2.1 淀粉的合成相关基因
1.2.1.1 淀粉的结构
1.2.2 糖转运过程与淀粉合成
1.2.3 PUL研究进展
1.3 基因编辑技术研究进展
1.3.1 ZFNs系统
1.3.2 TALENs系统
1.3.3 CRISPR/Cas9系统
1.4 本实验研究的目的
第二章 实验材料与方法
2.1 实验材料与试剂
2.1.1 水稻材料
2.1.2 质粒载体
2.1.3 菌株种类
2.1.4 主要试剂
2.2 实验方法
2.2.1 PUl的CRISPR/Cas9载体构建
2.2.1.1. 靶序列选择及引物设计
2.2.1.2. SK-gRNA中间载体构建
2.2.1.3 pC1300-Cas9最终载体构建
2.2.2 农杆菌介导水稻愈伤遗传转化
2.2.3 阳性转基因植株验证
2.2.4 突变检测
2.2.5 农艺性状考察
2.2.6 稻米生理生化品质
2.2.7 粒重和淀粉合成相关基因表达
第三章 结果与分析
3.1 gRNA靶位点选择及引物设计
3.2 SK-gRNA和pC1300 Cas9::PUL载体的鉴定
3.3 PUL的编辑及后代的鉴定分析
3.4 农艺性状
3.5 稻米品质分析
3.6 相关基因表达
第四章 结论与讨论
参考文献
附图
致谢
个人简历
【参考文献】:
期刊论文
[1]Rice caryopsis development Ⅱ: Dynamic changes in the endosperm[J]. Xiaoba Wu,Jinxin Liu,Dongqi Li,Chun-Ming Liu. Journal of Integrative Plant Biology. 2016(09)
[2]Quantitative Trait Loci for Grain Chalkiness and Endosperm Transparency Detected in Three Recombinant Inbred Line Populations of Indica Rice[J]. MEI De-yong,ZHU Yu-jun,YU Yong-hong,FAN Ye-yang,HUANG De-run,ZHUANG Jie-yun. Journal of Integrative Agriculture. 2013(01)
[3]A Kelch Motif-Containing Serine/Threonine Protein Phosphatase Determines the Large Grain QTL Trait in Rice[J]. Zejun Hu,Haohua He,Shiyong Zhang,Fan Sun,Xiaoyun Xin,Wenxiang Wang,Xi Qian,Jingshui Yang,Xiaojin Luo. Journal of Integrative Plant Biology. 2012(12)
[4]Identification of a Stable Quantitative Trait Locus for Percentage Grains with White Chalkiness in Rice (Oryza sativa)[J]. Tao Guo1, Xiaolu Liu2, Xiangyuan Wan1, Jianfeng Weng1, Shijia Liu1, Xi Liu1, Mingjiang Chen1, Jingjing Li1, Ning Su2, Fuqing Wu2, Zhijun Cheng2, Xiuping Guo2, Cailin Lei2, Jiulin Wang2, Ling Jiang1 and Jianmin Wan1,21Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/Jiangsu Plant Gene Engineering Research Center, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China 2Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(08)
[5]稻米垩白形成的研究进展[J]. 彭勃,陈光辉. 作物研究. 2009(05)
[6]利用近红外透射光谱技术同步测定糙米的多项品质指标初报[J]. 孙成效,段彬伍,谢黎虹,陈能. 中国水稻科学. 2006(04)
[7]杂交稻米质性状的亲本配合力分子标记鉴定[J]. 刘小川,王渭霞,陈深广,余柳青. 中国水稻科学. 2005(01)
[8]水稻胚乳的发育及其养分输入的途径[J]. 王忠,李卫芳,顾蕴洁,陈刚,石火英,高煜珠. 作物学报. 1995(05)
[9]谷类作物胚乳性状遗传控制的鉴别[J]. 莫惠栋. 遗传学报. 1995(02)
博士论文
[1]水稻胚乳垩白形成机制的生理生化与转录组水平解析[D]. 刘晓璐.中国农业科学院 2010
本文编号:3651127
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3651127.html
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