油菜产量相关性状的联合连锁分析和全基因组关联分析
发布时间:2022-05-08 08:46
油菜是世界上主要的油料作物之一,是植物食用油和饲用蛋白的主要来源。随着人口的不断增加和生活水平的不断提高,世界范围内对食用植物油和蛋白的需求日益增长,必须不断提高油菜籽产量来满足人类的需求。随着耕地面积的不断减少,通过扩大种植面积进一步增加油菜籽总产量的可能性较小,比较有效的途径是提高单位面积油菜籽的产量。其中,解析产量相关性状的遗传基础是进一步提高油菜产量的前提。本研究中,我们以本实验室前期构建的包含15个重组自交系(RIL)群体的油菜巢式关联作图(Brassica napus Nested association mapping,BN-NAM)群体,对有效分枝数、第一分枝高度、每角果粒数、主花序有效长度、主花序角果数、株高、角果长和千粒重等8个产量相关性状进行了连锁分析和全基因组关联分析。主要结果如下:1.BN-NAM群体产量相关性状的表型统计分析:于2015-2017年分别在蔡甸、阳逻、鄂州种植BN-NAM群体,并调查了有效分枝数、第一分枝高度、每角果粒数、主花序有效长度、主花序角果数、株高、角果长和千粒重等8个产量相关性状。表型数据分析发现,8个产量相关性状都存在广泛的表型变异...
【文章页数】:100 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略词表
1 文献综述
1.1 植物数量性状遗传解析
1.1.1 连锁分析研究进展
1.1.2 常用的连锁群体
1.1.3 关联分析研究进展
1.1.4 常用的关联群体
1.2 产量相关性状研究进展
1.2.1 甘蓝型油菜产量相关性状QTL研究进展
1.2.2 甘蓝型油菜产量相关性状的调控基因研究进展
1.2.3 其他作物产量相关性状研究进展
1.3 本研究的目的与意义
2 材料与方法
2.1 群体构建
2.2 群体遗传图谱构建
2.3 BN-NAM群体全基因组关联图谱的构建
2.4 实验设计及田间性状考察
2.5 表型数据分析
2.6 QTL定位
2.7 全基因组关联分析
3 结果与分析
3.1 BN-NAM群体产量相关性状的表型统计分析
3.1.1 表型变异
3.1.2 相关性分析
3.2 15个RIL群体8 个产量相关性状的QTL分析
3.2.1 有效分枝数
3.2.2 第一分枝高度
3.2.3 每角果粒数
3.2.4 主花序有效长度
3.2.5 主花序角果数
3.2.6 株高
3.2.7 角果长
3.2.8 千粒重
3.3 BN-NAM群体产量相关性状的GWAS分析
3.3.1 有效分枝数
3.3.2 第一分枝高度
3.3.3 每角果粒数
3.3.4 主花序有效长度
3.3.5 主花序角果数
3.3.6 株高
3.3.7 角果长
3.3.8 千粒重
3.3.9 与不同产量相关性状共同关联位点
3.4 连锁分析和关联分析的比较及应用
3.4.1 连锁分析与关联分析的比较
3.4.2 结合QTL定位和GWAS分析结果预测株高性状候选基因
3.5 角果长三种基因型的GWAS分析
3.5.1 角果长三种基因型的划分
3.5.2 角果长三种类型的GWAS分析
4 讨论
4.1 甘蓝型油菜产量相关性状的相关性
4.2 连锁分析和关联分析的比较分析
4.3 每角果粒数的位点发掘
4.4 角果长候选基因
参考文献
附录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]GS6, A Member of the GRAS Gene Family,Negatively Regulates Grain Size in Rice[J]. Lianjun Sun,Xiaojiao Li,Yongcai Fu,Zuofeng Zhu,Lubin Tan,Fengxia Liu,Xianyou Sun,Xuewen Sun,Chuanqing Sun. Journal of Integrative Plant Biology. 2013(10)
[2]数量性状基因的完备区间作图方法[J]. 王建康. 作物学报. 2009(02)
[3]甘蓝型油菜产量及相关性状的QTL分析[J]. 易斌,陈伟,马朝芝,傅廷栋,涂金星. 作物学报. 2006(05)
[4]数量性状基因定位的混合线性模型分析方法[J]. 朱军. 遗传. 1998(S1)
博士论文
[1]甘蓝型油菜产量相关性状遗传解析[D]. 王军.中国农业科学院 2017
[2]甘蓝型油菜株型与角果相关性状的QTL分析[D]. 漆丽萍.华中农业大学 2014
[3]甘蓝型油菜产量和品质相关性状关联分析[D]. 蔡东芳.华中农业大学 2013
[4]甘蓝型油菜杂种优势及其遗传分析[D]. 沈金雄.华中农业大学 2003
硕士论文
[1]甘蓝型油菜开花时间的遗传及株高和开花时间的QTL定位[D]. 张冰冰.西北农林科技大学 2019
[2]甘蓝型油菜株高和一次有效分枝高度候选基因的筛选[D]. 杨鸿.西南大学 2019
[3]甘蓝型油菜株高遗传及株高和开花时间的QTL定位[D]. 刘霞.西北农林科技大学 2018
[4]甘蓝型油菜株高和角果长及其相关性状QTL定位[D]. 阴涛.西南大学 2015
[5]人工合成特长角甘蓝型油菜产量相关性状的遗传分析和基因定位[D]. 龙艳.四川农业大学 2003
本文编号:3651327
【文章页数】:100 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略词表
1 文献综述
1.1 植物数量性状遗传解析
1.1.1 连锁分析研究进展
1.1.2 常用的连锁群体
1.1.3 关联分析研究进展
1.1.4 常用的关联群体
1.2 产量相关性状研究进展
1.2.1 甘蓝型油菜产量相关性状QTL研究进展
1.2.2 甘蓝型油菜产量相关性状的调控基因研究进展
1.2.3 其他作物产量相关性状研究进展
1.3 本研究的目的与意义
2 材料与方法
2.1 群体构建
2.2 群体遗传图谱构建
2.3 BN-NAM群体全基因组关联图谱的构建
2.4 实验设计及田间性状考察
2.5 表型数据分析
2.6 QTL定位
2.7 全基因组关联分析
3 结果与分析
3.1 BN-NAM群体产量相关性状的表型统计分析
3.1.1 表型变异
3.1.2 相关性分析
3.2 15个RIL群体8 个产量相关性状的QTL分析
3.2.1 有效分枝数
3.2.2 第一分枝高度
3.2.3 每角果粒数
3.2.4 主花序有效长度
3.2.5 主花序角果数
3.2.6 株高
3.2.7 角果长
3.2.8 千粒重
3.3 BN-NAM群体产量相关性状的GWAS分析
3.3.1 有效分枝数
3.3.2 第一分枝高度
3.3.3 每角果粒数
3.3.4 主花序有效长度
3.3.5 主花序角果数
3.3.6 株高
3.3.7 角果长
3.3.8 千粒重
3.3.9 与不同产量相关性状共同关联位点
3.4 连锁分析和关联分析的比较及应用
3.4.1 连锁分析与关联分析的比较
3.4.2 结合QTL定位和GWAS分析结果预测株高性状候选基因
3.5 角果长三种基因型的GWAS分析
3.5.1 角果长三种基因型的划分
3.5.2 角果长三种类型的GWAS分析
4 讨论
4.1 甘蓝型油菜产量相关性状的相关性
4.2 连锁分析和关联分析的比较分析
4.3 每角果粒数的位点发掘
4.4 角果长候选基因
参考文献
附录
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]GS6, A Member of the GRAS Gene Family,Negatively Regulates Grain Size in Rice[J]. Lianjun Sun,Xiaojiao Li,Yongcai Fu,Zuofeng Zhu,Lubin Tan,Fengxia Liu,Xianyou Sun,Xuewen Sun,Chuanqing Sun. Journal of Integrative Plant Biology. 2013(10)
[2]数量性状基因的完备区间作图方法[J]. 王建康. 作物学报. 2009(02)
[3]甘蓝型油菜产量及相关性状的QTL分析[J]. 易斌,陈伟,马朝芝,傅廷栋,涂金星. 作物学报. 2006(05)
[4]数量性状基因定位的混合线性模型分析方法[J]. 朱军. 遗传. 1998(S1)
博士论文
[1]甘蓝型油菜产量相关性状遗传解析[D]. 王军.中国农业科学院 2017
[2]甘蓝型油菜株型与角果相关性状的QTL分析[D]. 漆丽萍.华中农业大学 2014
[3]甘蓝型油菜产量和品质相关性状关联分析[D]. 蔡东芳.华中农业大学 2013
[4]甘蓝型油菜杂种优势及其遗传分析[D]. 沈金雄.华中农业大学 2003
硕士论文
[1]甘蓝型油菜开花时间的遗传及株高和开花时间的QTL定位[D]. 张冰冰.西北农林科技大学 2019
[2]甘蓝型油菜株高和一次有效分枝高度候选基因的筛选[D]. 杨鸿.西南大学 2019
[3]甘蓝型油菜株高遗传及株高和开花时间的QTL定位[D]. 刘霞.西北农林科技大学 2018
[4]甘蓝型油菜株高和角果长及其相关性状QTL定位[D]. 阴涛.西南大学 2015
[5]人工合成特长角甘蓝型油菜产量相关性状的遗传分析和基因定位[D]. 龙艳.四川农业大学 2003
本文编号:3651327
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3651327.html
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