干旱胁迫下两个玉米自交系雄穗花器官分化期的转录组分析

发布时间：2022-07-07 13:34

　　【目的】运用现代分子生物学及高通量测序技术,在全基因组水平鉴定耐旱相关的基因,研究玉米雄穗花器官分化期对干旱胁迫的响应机理,为抗旱育种将提供新的理论基础。【方法】以干旱胁迫15 d和正常浇水的耐旱自交系"PHBA6"和干旱敏感自交系"吉63"花器官分化期的雄穗进行Illumina HiSeq 2000高通量测序分析,将测序得到的Unigene与玉米参考基因组进行比对,利用RPKM来衡量样本间的基因表达丰度,以|log₂foldchange|≥1,P<0.05,FDR≤0.001筛选出样本间的差异表达基因,并通过Gene Onto 1ogy （GO）数据库、 KEGG pathway数据库对筛选出的差异表达基因的功能和参与的调控路径进行分析。【结果】与正常水分处理相比,耐旱自交"PHBA6"和干旱敏感自交系"吉63"在干旱胁迫下分别有1 394个和1 300个显著差异表达基因,其中共有差异表达基因831个,包括上下调表达趋势是一致的822个基因和9个具有相反的表达模式基因。除这些基因外,各自分别还有563个和469个基因型特异的干旱响应基因,这些特异的干旱响应... 

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

特异响应基因的富集功能

代谢途径显著性富集的代谢通路

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于昌7-2导入系发掘干旱胁迫下玉米产量相关QTL位点[J]. 李晶晶,王利锋,马娟,曹言勇,王浩,王丽艳,贾腾蛟,董春林,李会勇.  玉米科学. 2019(04)
[2]玉米耐旱QTL定位研究进展[J]. 郝转芳,李新海,张世煌.  玉米科学. 2007(02)
[3]玉米开花期耐旱相关性状的遗传及育种策略[J]. 刘贤德,李新海,张世煌.  玉米科学. 2002(03)

博士论文
[1]玉米高密度重组图谱构建及耐旱相关性状的遗传解析[D]. 李春辉.中国农业科学院 2015
[2]玉米抗旱性指标的筛选及其遗传特性研究[D]. 李凤海.沈阳农业大学 2011

硕士论文
[1]基于玉米根系转录组测序的耐旱基因挖掘及Zmhdz6的功能分析[D]. 郝陆洋.中国农业科学院 2018



本文编号：3656512