薏苡油脂合成关键基因克隆及其生物信息学分析

发布时间：2023-02-11 14:43

　　【目的】掌握薏苡二酰甘油酰基转移酶基因(ClDGAT)、内质网油酸脱饱和酶基因(ClFAD2)和硬脂酸脱饱和酶基因(ClSAD)的生物信息学特性,明确薏苡油脂代谢调控机制,为今后开展以提高薏苡含油量和改良脂肪酸组成为目标的育种研究提供理论依据。【方法】利用RT-PCR和RACE克隆薏苡油脂合成关键基因(ClDGAT、ClFAD2和ClSAD),通过染色体步移技术获得ClFAD2和ClSAD基因启动子序列,并以ExPASy ProtParam tool、SMART、TMHMM Server v.2.0和SOPMA等在线软件进行生物信息学分析。【结果】从薏苡叶片中成功克隆获得ClDGAT、ClFAD2和ClSAD基因,NCBI登录号分别为MK589802、MK589803和MK589804。其中,ClDGAT基因cDNA序列全长1842 bp,其开放阅读框(ORF)为1539 bp,编码512个氨基酸;ClFAD2基因cDNA序列全长1768 bp,其ORF为1164 bp,编码387个氨基酸,无内含子;ClSAD基因cDNA序列全长1727 bp,其ORF为1182 bp,编码393个氨...

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 DNA提取及cDNA合成
    1.3 油脂合成关键基因cDNA序列克隆
    1.4 ClFAD2和ClSAD基因组序列及其启动子扩增
    1.5 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 ClDGAT、ClFAD2和ClSAD基因克隆及测序分析结果
    2.2 ClDGAT、ClFAD2和ClSAD蛋白理化性质预测分析结果
    2.3 ClDGAT、ClFAD2和ClSAD蛋白功能域及其结构预测结果
    2.4 ClDGAT、ClFAD2和ClSAD蛋白氨基酸序列进化分析结果
    2.5 ClFAD2和ClSAD基因启动子序列分析结果
3 讨论
4 结论



本文编号：3740583