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蓖麻镶嵌系、雌性系间比较转录组学分析

发布时间:2023-04-01 02:33
  雌性系是蓖麻杂种优势利用的主要途径,镶嵌系是雌性系繁殖最重要、最经济有效的材料。镶嵌雄花的表达具有不稳定性,其生理和遗传机制尚不清楚,影响了它在生产上的应用效果。研究蓖麻镶嵌系与雌性系间的生理及基因差异,可为蓖麻性别分化调控及其育种应用提供参考。本试验以相同遗传背景的镶嵌系和雌性系为材料,在主穗现蕾期和盛花期分别对叶片叶绿素相对含量、净光合速率、可溶性营养物质及内源激素进行测定。在现蕾期、开花期及盛花期对花序进行转录组测序,对转录组测序clean reads数据分析、筛选与性别分化相关差异基因进行GO、KEGG、KOG注释。结果表明:1、在现蕾期,镶嵌系的可溶性糖和细胞分裂素含量显著高于雌性系(分别高于雌性系36.9%、61.5%)、赤霉素含量显著低于雌性系(达25.6%),在盛花期,镶嵌系的叶绿素相对含量、净光合速率、赤霉素、生长素和乙烯含量比雌性系显著升高,幅度高达15.2%、23.3%、13.8%、33.5%、73.8%;可溶性糖、可溶性淀粉和脱落酸显著下降,幅度分别为38.0%、54.9%、14.8%。可见,镶嵌雄花的形成先以可溶性糖和细胞分裂素增加为特征,之后伴随着营养物质消...

【文章页数】:55 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
Abstract
1 文献综述
    1.1 植物性别分化研究进展
    1.2 蓖麻性别分化研究进展
        1.2.1 蓖麻性别分化形态学研究进展
        1.2.2 蓖麻性别分化遗传研究进展
        1.2.3 外界因素对蓖麻性别分化的影响
    1.3 转录组的研究进展及应用
    1.4 本研究的目的和意义
    1.5 技术路线图
2 镶嵌系、雌性系叶片间的生理差异分析
    2.1 试验材料
    2.2 试验方法
    2.3 结果与分析
        2.3.1 镶嵌系、雌性系间叶绿素相对含量及净光合速率变化
        2.3.2 镶嵌系、雌性系间营养物质含量变化
        2.3.3 镶嵌系、雌性系间内源激素含量变化
    2.4 讨论
3 镶嵌系、雌性系花序转录组学分析
    3.1 试验材料
    3.2 材料RNA提取
    3.3 文库构建
    3.4 文库质检
    3.5 生物信息学分析
        3.5.1 质控分析
        3.5.2 比对参考基因组
        3.5.3 基因表达分析和相关性分析
        3.5.4 差异表达基因筛选
        3.5.5 差异基因GO分析
        3.5.6 差异基因KEGG分析
        3.5.7 差异基因KOG注释
    3.6 结果与分析
        3.6.1 蓖麻花序RNA质量检测
        3.6.2 质控分析数据统计
        3.6.3 参考基因组比对情况分析
        3.6.4 基因表达量及样品间相关性分析
        3.6.5 差异表达基因分析
        3.6.6 差异基因GO分析
        3.6.7 差异基因KEGG分析
        3.6.8 差异基因KOG注释
    3.7 讨论
4 结论
参考文献
附录Ⅰ
附录Ⅱ
附录Ⅲ
附录Ⅳ
附录Ⅴ
附录Ⅵ
致谢
作者简介
导师简介



本文编号:3776288

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