玉米泛素结合酶基因家族分析及低氮胁迫下亚家族UBC2的表达分析

发布时间：2023-04-17 05:32

　　泛素结合酶是泛素/蛋白酶体途径的重要组成部分,在蛋白质的泛素化过程中具有重要作用。本研究利用生物信息学对玉米泛素E2家族成员进行系统进化及基因结构分析。系统进化分析显示,玉米泛素结合酶基因可分为6个亚家族,各亚家族成员数目差异较大。基因数目最多的亚家族是UBC1,为22个。成员数最少的是UBC3,仅为5个。以亚家族UBC2为研究对象,发现UBC2中一共存在4对旁系同源基因,分别是ZmUBC3/ZmUBC70、ZmUBC8/ZmUBC34、ZmUBC31/ZmUBC53以及ZmUBC45/ZmUBC66。对UBC2中成员进行基因结构分析发现,互为旁系同源的基因其基因结构相似。ZmUBC45/ZmUBC66含有外显子数量最多,为9个,而ZmUBC31/ZmUBC53外显子含量最小,仅为4个。基因基序分析结果显示,ZmUBC3/ZmUBC70含有基序数量最多(8个),ZmUBC8/ZmUBC34与ZmUBC31/ZmUBC53基序含量最小(均为3个)。基因启动子作用元件分析显示,泛素E2基因启动子元件类型可分为光响应、激素响应和胁迫响应元件、组织表达相关元件以及周期性调控相关元件5大类。基因...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料及处理方法
    1.2 玉米泛素结合酶基因的基因结构及系统进化分析
    1.3 玉米泛素E2基因家族成员启动子作用元件分析
    1.4 不同组织器官的表达模式分析
    1.5 低氮胁迫下泛素E2家族基因成员的表达分析
    1.6 数据处理
2 结果与分析
    2.1 玉米泛素结合酶蛋白家族的系统进化分析
    2.2 玉米泛素结合酶家族基因的启动子作用元件分析
    2.3 玉米E2基因在不同组织的表达分析
    2.4 玉米E2基因在不同氮形态胁迫下的表达分析
3 讨论



本文编号：3792671