水稻直立短穗突变体esp的转录组研究

发布时间：2023-04-20 03:03

　　【目的】克隆水稻直立短穗基因Erect and Short Panicle(ESP),分析其参与的基因调控途径,解析ESP控制株型、穗长等农艺性状的分子机理。【方法】以直立短穗突变体esp及其野生型为材料,成熟期进行株高、穗长、粒长等表型测定;构建籼粳杂交F2定位群体,挑选与突变表型一致的F2单株,利用与突变性状连锁的分子标记对目的基因进行定位;对野生型和突变体进行基因组测序,结合定位结果,找到突变位点,克隆ESP;利用生物信息学软件进行进化树和基因表达分析;提取野生型和突变体幼穗中的RNA并建库,GO(gene ontology)聚类分析表达差异基因,同时根据KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)数据库,分析野生型和突变体中植物激素信号转导和内质网蛋白加工相关基因的表达变化,并通过qRT-PCR验证。【结果】通过表型观察和农艺性状调查,与野生型相比,直立短穗突变体esp株高降低,穗长变短,穗型由弯曲变为直立,每穗粒数减少,粒长变短,粒宽和千粒重增加;有效穗数无显著差异。利用突变体esp与PA64构建籼粳F2定位群体,将目的基因定位于...

【文章页数】：14 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 农艺性状调查
    1.3 基因定位与克隆
    1.4 生物信息学分析
    1.5 转录组分析
    1.6 RNA提取、反转录以及q RT-PCR分析
2 结果
    2.1 直立短穗突变体esp的表型分析
    2.2 ESP的克隆
    2.3 ESP及其同源蛋白的序列分析
    2.4 ESP组织表达分析
    2.5 突变体esp和野生型幼穗的转录组分析
    2.6 ESP突变对植物激素信号转导和内质网代谢途径的调控
    2.7 转录组验证
3 讨论
4 结论



本文编号：3794757