基于2b-RAD技术的糯玉米品种‘沪玉糯3号’特异SNP分子标记开发

发布时间：2025-01-15 15:28

　　 利用2b-RAD (type IIB endonucleases restriction-site associated DNA)技术对糯玉米品种‘沪玉糯3号’及其亲本进行简化基因组测序。通过与玉米‘B73’参考基因组序列进行比对,在3个糯玉米样品的共同测序标签内筛选出20 498个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,并基于RADtyping分型策略对它们进行基因型分型。对其中20 333个位于玉米10条染色体上的SNP位点的基因型进行分析,开发出6个可用于‘沪玉糯3号’品种特异性鉴定的SNP分子标记。

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【部分图文】：

图1 SNPs在糯玉米样品中的分布

‘申W22’、‘申W48’和‘沪玉糯3号’在糯玉米10条染色体上无差异的SNP位点有6220个,差异SNP位点14113个(图2-A)。各染色体上样品间无差异SNP位点占样品间差异SNP位点数的比例为31.13%～56.23%,平均比例为44.60%(图2-B)。此外,‘沪玉....

图2‘沪玉糯3号’及其亲本的基因型分析

图1SNPs在糯玉米样品中的分布2.4‘沪玉糯3号’的品种特异性鉴定

图3‘沪玉糯3号’品种特异性鉴定

经重复性TouchdownPCR扩增验证,本研究从19对AC-PCR引物中筛选出S1-1和S1-2、S2-1和S2-2、S3-1和S3-2、S4-1和S4-2、S5-1和S5-2、S6-1和S6-2共6对引物对在‘沪玉糯3号’及其亲本间扩增出稳定、清晰的差异条带。这6对引物不仅....

本文编号：4027499