罗非鱼集约化养殖池塘中nifh-基因编码固氮细菌的群落结构多样性的鉴定和分类

发布时间：2020-06-10 18:36

【摘要】：本文调查研究水体、沉积物和土壤(来自中国江苏宜兴三个不同强度单养、混养的奥利亚罗非鱼池塘)固氮相关的微生物群落和特性。这些微生物被认为可以显著减少、消除硝态氮淋失或在水产养殖设施中产生污染进而促进植物生长。专注提高鱼的产量,我们选择生物学方法提高水质量和获取环境效应的信息,研究促进植物(蔬菜)生长和鱼类生产相关的微生物功能机制的特征和定义。illumina公司采用功能基因分析方法进行菌种鉴定,通过探究DNA序列基因确定细菌总数,进而进行环境细菌分布评估。在池塘1,2(单一系统)和池塘3(混养系统)中微生物群落的nifH-基因编码被认为能促进植物生长,减少池塘硝态氮和含氮废物污染,根据分类学确定他们最可能的属为固氮螺菌属,固氮弓菌属,厌氧粘细菌,固氮菌属,地杆菌属,红微菌属,脱硫杆菌属,脱硫球茎菌属,脱硫弧菌属,甲基单胞菌属,荚硫菌属和无类别的丰佑菌科。夏天生化指标定义池塘退化被认为与不同池塘微生物群落有关,确定环境因素对固氮细菌存活的影响。记录月平均温度范围(27.3-34.2℃),溶解氧(6.31-8.99mg/L),pH值(7.18-7.98)观察池塘最优养殖。营养水平显著差异P0.05)的池塘间,研究的环境因素中,氨氮是记录的对群落影响最大的指标,在1,2,3不同池塘水体微生物中有显著的差别,分别为3.18,1.98 and 3.41 mg/L.不同水体中化学需氧量(P0.05)分别为14.06,14.28 and 12.16 mg/L;沉积物和泥土中总有机碳(P0.05)含量在1,2,3,池塘中分别为4.33,4.93 and 4.16 mg/kg,表明池塘系统中能量呈上升趋势。在 1,2,3 湿重分别为 3.02 x 107,4.06 x 107 and 4.85 x 107 copies/g 池塘中,建立沉积物土壤丰度的微生物编码nifH基因的结果定量分析;在同样的池塘中建立水体微生物丰度湿度分别为3.65 x 10~6,2.66 x 10~6 and 3.11 x 10~6 copies/g。更进一步研究线性判别分析影响大小,沉积物和泥土微生物高维类比较宏基因组分析结果在1,2,3池塘中分别为19,17,11演化支,同时表明在三个池塘水体中着色菌科属和荚硫菌属是最接近的属。沙土壤微生物群落中的冗余分析(RDA)测试表明,总磷和有机物质是塑造细菌群落最重要的因子;与此相反,水体测试表明氨氮,总磷,溶解氧是塑造细菌群落的重要因子。研究结果表明养殖密度为1800或者每亩更少,M不是规范nifH基因编码丰度的限定因素。这些研究为进一步调研鉴定微生物催化氧化酶到种的阶段提供依据,为更广泛适应养殖提供平台。
【学位授予单位】：南京农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S917.1

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